本發明涉及分子生物學及遺傳育種領域，具體涉及一種與豬生長性狀相關的snp分子標記及其應用。
背景技術：
1、中國和歐洲作為世界上兩個最大的豬肉生產和消費區域，擁有眾多的家豬品種，在馴化過程中，中歐出于不同的目的對家豬的性狀從不同的方向進行選育，導致這兩個區域的家豬品種表型出現明顯的分化，生長速度便是其中最顯著的差異之一，其中中國地方豬種生長速度顯著慢于歐洲商品豬。雖然當前隨著社會生產力的發展，人們獲取肉類蛋白食品的途徑更加多樣，禽蛋、水產品以及營養更加豐富的牛羊肉對豬肉有所替代，但豬肉仍然是我國居民餐桌上的主要肉食。由于我國豬肉需求量巨大，為了滿足人們日常生活中對豬肉的需求，生豬養殖主要以大白、杜洛克等歐洲商品豬為主。雖然我國擁有眾多肉質優良的地方豬種，但其生長速度慢，飼養成本高，難以大規模養殖。因此挖掘家豬生長性狀相關的候選基因，培育生長快的豬種不僅可以提高肉質量，滿足市場需求，同時也能增強養殖效率，為養殖業帶來更大的經濟效益。
2、近年來，分子遺傳技術的飛速發展，使dna分子標記技術在豬遺傳多樣性研究中起著重要作用。為更好地開發和利用優良品種的優良經濟特性及保護和合理的利用品種資源，有必要開發豬生長性狀特異的分子標記，應用于高生長性狀豬的選育，為豬的分子育種提供理論依據。通過farmgtex數據庫中查詢，hmga1基因(growth?arrest-specific?gene7，hmga1)是一種組織光譜表達的基因，在脂肪、肌肉、骨骼組織中均表達。與野生型小鼠相比，小鼠中敲除hmga1后體型和體重顯著減小。通過rna-seq數據分析，該基因在大白和馬身豬的背最長肌組織中顯著差異表達，在大白豬(高生長性狀組)中高表達，在馬身豬(低生長性狀組)中低表達。但是基于hmga1基因的與豬生長性狀相關的snp分子標記還沒有獲得充分研究。
技術實現思路
1、為了解決以上問題，本發明提出一種與豬生長性狀相關的snp分子標記及其應用。
2、本發明公開了一種與豬生長性狀相關的snp分子標記在豬育種中的應用，所述snp分子標記的核苷酸序列如seq?id?no:1所示，所述snp分子標記位于豬參考基因組sscrofa11.1版本第7號染色體第30318006bp處，所述snp分子標記位于對應seq?id?no:1第60bp處，該處的堿基從g突變為a；所述snp分子標記的基因型為aa的個體具有高生長遺傳性狀；所述snp分子標記的基因型為gg或ag的個體具有低生長遺傳性狀；在育種時通過保留所述snp分子標記基因型為aa的個體，淘汰基因型為gg或ag的個體來提高后代豬的生長性能。
3、進一步，檢測所述snp分子標記的引物組合包括如seq?id?no:2所示的正向引物和如seq?id?no:3所示的反向引物。
4、進一步，所述應用包括豬生長性狀的選育、培育高生長性狀豬品系、豬的遺傳改良、篩選高生長性狀仔豬。
5、進一步，應用于豬生長性狀的選育時，先檢測后備種豬的所述snp分子標記，再保留所述snp分子標記基因型為aa的個體，淘汰基因型為gg或ag的個體。
6、進一步，應用于培育高生長性狀豬品系時，先檢測后備種豬的所述snp分子標記，再保留所述snp分子標記基因型為aa的個體作為留種豬，淘汰基因型為gg或ag的個體，并對作為留種豬的公、母豬進行配種，再對配種出生的豬檢測所述snp分子標記，保留基因型為aa的個體，淘汰基因型為gg或ag的個體，再進行繁育，獲得高生長性狀豬品系。
7、進一步，應用于豬的遺傳改良時，先檢測后備種豬的所述snp分子標記，再保留所述snp分子標記基因型為aa的個體作為留種豬，淘汰基因型為gg或ag的個體，并對作為留種豬的公、母豬進行配種，在后代中繼續選留基因型為aa的種豬個體，淘汰ag或gg基因型個體，以逐代提高后代豬群體中等位基因a的頻率，從而提高后代種豬的生長性能。
8、進一步，應用于篩選高生長性狀仔豬時，先檢測待篩選仔豬的所述snp分子標記，檢測出的snp分子標記的基因型為aa時，該待篩選仔豬具有高生長遺傳性狀，予以保留；檢測出的snp分子標記的基因型為gg或ag時，該待篩選仔豬具有低生長遺傳性狀，予以淘汰。
9、本發明的有益效果如下：
10、1、本發明篩選鑒定了一種與影響豬生長性狀相關的snp分子標記(chr7-30318006:g>a)，所述snp分子標記的不同基因型豬的240日齡體重有極顯著差異；所述snp分子標記基因型gg的豬平均240日齡體重為105kg，分子標記基因型aa的豬平均240日齡體重為115.3kg，a等位基因顯著提高生長性狀，aa基因型為優勢基因型。由此，通過對該分子標記進行應用，就可以大大提高豬生長，提高豬的生產性能，加快種豬的遺傳改良進展和育種進程。
11、2、通過檢測所述snp分子標記基因型輔助種豬選育，可通過選留aa基因型種豬，有效提高豬生長性能，便于后續種豬的綜合育種。
12、3、通過將所述snp分子標記應用在培育高生長性狀豬品系上，可以獲得在育肥期具有高生長性狀的豬品系，從而提高該品系豬的生產性能，加快種豬的遺傳改良進展和育種進程。
13、4、通過將所述snp分子標記應用于豬的遺傳改良上，可以大大縮短遺傳育種年限，提高豬生長，加快種豬的遺傳改良進展和育種進程。
14、5、通過將所述snp分子標記應用在篩選高生長遺傳性狀的仔豬上，可以在仔豬階段就篩選出具有高生長性狀的種豬，并對其進行選留，由此在仔豬階段就對種豬的生長性狀進行了選育，可以大大提高育種效率，節約飼養成本。
1.一種與豬生長性狀相關的snp分子標記在豬育種中的應用，其特征在于，所述snp分子標記的核苷酸序列如seq?id?no:1所示，所述snp分子標記位于豬參考基因組sscrofa11.1版本第7號染色體第30318006bp處，所述snp分子標記位于對應seq?id?no:1第60bp處，該處的堿基從g突變為a；所述snp分子標記的基因型為aa的個體具有高生長遺傳性狀；所述snp分子標記的基因型為gg或ag的個體具有低生長遺傳性狀；在育種時通過保留所述snp分子標記基因型為aa的個體，淘汰基因型為gg或ag的個體來提高后代豬的生長性能。
2.根據權利要求1所述與豬生長性狀相關的snp分子標記在豬育種中的應用，其特征在于，檢測所述snp分子標記的引物組合包括如seq?id?no:2所示的正向引物和如seq?id?no:3所示的反向引物。
3.根據權利要求1所述與豬生長性狀相關的snp分子標記在豬育種中的應用，其特征在于，所述應用包括豬生長性狀的選育、培育高生長性狀豬品系、豬的遺傳改良、篩選高生長性狀仔豬。
4.根據權利要求3所述與豬生長性狀相關的snp分子標記在豬育種中的應用，其特征在于，應用于豬生長性狀的選育時，先檢測后備種豬的所述snp分子標記，再保留所述snp分子標記基因型為aa的個體，淘汰基因型為gg或ag的個體。
5.根據權利要求3所述與豬生長性狀相關的snp分子標記在豬育種中的應用，其特征在于，應用于培育高生長性狀豬品系時，先檢測后備種豬的所述snp分子標記，再保留所述snp分子標記基因型為aa的個體作為留種豬，淘汰基因型為gg或ag的個體，并對作為留種豬的公、母豬進行配種，再對配種出生的豬檢測所述snp分子標記，保留基因型為aa的個體，淘汰基因型為gg或ag的個體，再進行繁育，獲得高生長性狀豬品系。
6.根據權利要求3所述與豬生長性狀相關的snp分子標記在豬育種中的應用，其特征在于，應用于豬的遺傳改良時，先檢測后備種豬的所述snp分子標記，再保留所述snp分子標記基因型為aa的個體作為留種豬，淘汰基因型為gg或ag的個體，并對作為留種豬的公、母豬進行配種，在后代中繼續選留基因型為aa的種豬個體，淘汰ag或gg基因型個體，以逐代提高后代豬群體中等位基因a的頻率，從而提高后代種豬的生長性能。
7.根據權利要求3所述與豬生長性狀相關的snp分子標記在豬育種中的應用，其特征在于，應用于篩選高生長性狀仔豬時，先檢測待篩選仔豬的所述snp分子標記，檢測出的snp分子標記的基因型為aa時，該待篩選仔豬具有高生長遺傳性狀，予以保留；檢測出的snp分子標記的基因型為gg或ag時，該待篩選仔豬具有低生長遺傳性狀，予以淘汰。