專利名稱：一段淋球菌dna序列(4)特異性的確定及其應用的制作方法
技術領域：
本發明涉及一段淋球菌(Neisseria gonorrhoeae)DNA序列(4)特異性的確定及其應用，屬于生物醫學技術領域。
本發明的技術方案為本發明利用現有的方法確定了長度為212bp的一段淋球菌(Neisseria gonorrhoeae)特異DNA序列(4)及其PCR引物，用引物進行PCR擴增，其序列如下tttttgggat agcacggaac gtacttatga aactatgttg tatttgaacg gtaagcctgc 60acagattttg caggcagata ttcaaagtac tattcataag ctaggcaaaa atatccaaga 120agttgaaaga ccaagtaaat ttattgaaca taatagccat ttagaaaatt gtttgggtgt 180tcagaaaatt gcaccagaac aattcggcaa tt 212引物序列為1. 5’-tttttgggatagcacggaac-3’2. 5’-aattgccgaatctgttctgg-3’上述的淋球菌特異DNA序列(4)用于診斷淋球菌的基因芯片的探針序列，并通過上述的引物序列進行PCR擴增，標記后進行雜交檢測或直接用于PCR診斷。
用本發明建立的臨床檢測技術所使用的方法具有快速、準確、操作簡便、成本低等優點。
圖2、圖2續是測序圖。其中圖2是測定的序列、圖2續是原始測序圖譜。
圖3是用Blast軟件對PCR擴增產物的測序結果與預計序列的比較分析。
圖4、圖4續是基因數據庫中Blast搜索結果。
圖5為基因芯片雜交結果。
本發明可用于PCR方法或基因芯片方法進行淋球菌的臨床檢測。用本發明提供的序列進行PCR擴增，根據PCR方法獲得產物是否出現和大小判斷是否為淋球菌感染。也可用本序列為探針，作為基因芯片中的一個檢測位點，然后用本發明中的PCR引物序列擴增臨床標本，并標記后進行雜交檢測。
說明書序列表<110>昆明寰基生物芯片開發有限公司<120>一段白色淋球菌DNA序列(4)特異性的確定及其應用<140><141><160>1<210>1<211>212<212>DNA<213>淋球菌(Neisseria gonorrhoease)<220><221>gene<222>(1)…(212)<400>1tttttgggat agcacggaac gtacttatga aactatgttg tatttgaacg gtaagcctgc 60acagattttg caggcagata ttcaaagtac tattcataag ctaggcaaaa atatccaaga 120agttgaaaga ccaagtaaat ttattgaaca taatagccat ttagaaaatt gtttgggtgt 180tcagaaaatt gcaccagaac aattcggcaa tt 21權利要求
1.一段淋球菌DNA序列(4)特異性的確定，其特征在于該序列的長度為212bp，其序列及PCR引物序列如下tttttgggat agcacggaac gtacttatga aactatgttg tatttgaacg gtaagcctgc 60acagattttg caggcagata ttcaaagtac tattcataag ctaggcaaaa atatccaaga 120agttgaaaga ccaagtaaat ttattgaaca taatagccat ttagaaaatt gtttgggtgt 180tcagaaaatt gcaccagaac aattcggcaa tt 212引物序列為1. 5’-tttttgggatagcacggaac-3’2. 5’-aattgccgaatctgttctgg-3’
2.一段淋球菌特異DNA序列的應用，其特征在于該序列用于診斷淋球菌的基因芯片的探針序列，并通過上述的引物序列進行PCR擴增，標記后進行雜交檢測或直接用于PCR診斷。
全文摘要
本發明涉及一段淋球菌DNA序列(4)特異性的確定及其應用，屬于生物醫學技術領域。本發明通過基因數據庫資料的搜尋和分析，確定了一段淋球菌DNA序列(4)的特異性及PCR擴增引物，該序列長度為212bp。通過對人類生殖道淋球菌感染標本的PCR擴增，克隆，獲得該序列，測序證明與預計序列一致。再經生物信息學方法分析，基因芯片雜交分析，結果證實了該序列對于淋球菌的特異性。本發明作為基因芯片診斷的探針及PCR擴增檢測序列，用于淋球菌的診斷。用本發明建立的臨床檢測技術所使用的方法具有快速、準確、操作簡便、成本低等優點。
文檔編號C12Q1/04GK1465717SQ0213337
公開日2004年1月7日 申請日期2002年6月26日 優先權日2002年6月26日
發明者譚德勇, 朱寶生 申請人:昆明寰基生物芯片開發有限公司