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一種磷酸鹽誘導啟動子降低黑曲霉β?葡萄糖苷酶表達酶活的方法與流程

文檔序號:12097524閱讀:478來源:國知局

本發明屬于基因工程領域,涉及一種磷酸鹽誘導啟動子降低黑曲霉β-葡萄糖苷酶表達酶活的方法。



背景技術:

纖維素酶(β-1,4-葡聚糖-4-葡聚糖水解酶)是降解纖維素生成葡萄糖的一組酶的總稱,它不是單體酶,而是起協同作用的多組分酶系,是一種復合酶,主要由外切β-葡聚糖酶、內切β-葡聚糖酶和β-葡萄糖苷酶等組成。

在纖維素酶降解纖維素的時候,外切酶先把纖維素酶解為短鏈可溶的片段,內切酶把短鏈的片段酶解為纖維二糖,纖維二糖在β-葡萄糖苷酶的作用下酶解為葡萄糖。纖維素酶酶解纖維素是一個協同降解的過程,某一種酶活性過高或者過低都會降低纖維素酶解效率。

黑曲霉是一種食品安全菌,產生的纖維素酶具有廣闊的應用領域,比如污水處理、垃圾利用、食品等。黑曲霉生產的纖維素酶中β-葡萄糖苷酶的酶活相對較高,三種酶的組成不利于最大化的發揮酶的催化效率。降低β-葡萄糖苷酶的活性是優化纖維素酶酶系組成的一個重要措施。已有的降低某種酶的表達效率的措施主要為基因敲除,也取得了一些效果。



技術實現要素:

本發明的目的在于克服現有技術存在的缺點與不足,提供一種磷酸鹽誘導啟動子降低黑曲霉β-葡萄糖苷酶表達酶活的方法。本發明的目的還在于提供一種磷酸鹽誘導β-葡萄糖苷酶活性降低的黑曲霉菌株。

本發明的目的通過下述技術方案實現:

一種磷酸鹽誘導啟動子降低黑曲霉β-葡萄糖苷酶表達酶活的方法,包括如下步驟:

(1)將由磷酸鹽誘導啟動子或含磷酸鹽誘導啟動子的DNA序列、表達與β-葡萄糖苷酶mRNA互補的反義mRNA的DNA序列和終止子序列組成的DNA片段構建到表達載體上;

(2)將步驟(1)所構建的重組載體轉化到黑曲霉中;

(3)往培養基中加入磷酸鹽后對轉化有重組載體的黑曲霉菌株進行培養。

步驟(1)中所述的含磷酸鹽誘導啟動子的DNA序列優選如SEQ ID NO.1所示。

步驟(1)中所述的表達與β-葡萄糖苷酶mRNA互補的反義mRNA的DNA序列優選如SEQ ID NO.2所示。

步驟(1)中所述的終止子序列優選如SEQ ID NO.3所示。

步驟(1)中所述的表達載體優選為pMW1載體。

步驟(1)優選為:將序列如SEQ ID NO.4所示的DNA片段通過限制性內切酶EcoI、KpnI及DNA連接酶構建到pMW1載體上,得到重組載體。

步驟(2)中所述的黑曲霉優選為黑曲霉ATCC16404。

步驟(2)優選通過農桿菌將所構建的重組載體轉化到黑曲霉中。

步驟(3)中所述的培養基的配方優選為:麩皮10g,蛋白胨1g,牛肉膏1g,水1L。

步驟(3)中所述的磷酸鹽優選為磷酸鈉。

一種磷酸鹽誘導β-葡萄糖苷酶活性降低的黑曲霉菌株,為上述方法中構建的轉化有重組載體的黑曲霉菌株。

本發明具有如下優點和有益效果:本發明利用磷酸鹽誘導啟動子調控β-葡萄糖苷酶mRNA互補的反義mRNA轉錄,有效降低了β-葡萄糖苷酶的翻譯量和表達的活性,從而優化了黑曲霉表達的纖維素酶系組合,以最大化發揮纖維素酶系降解纖維素的效率。

具體實施方式

下面結合實施例對本發明作進一步詳細的描述,但本發明的實施方式不限于此。

實施例1

1. 材料

黑曲霉(Aspergillus niger)ATCC16404,大腸桿菌(Escherichia coli)DH5α,根癌農桿菌(Agrobacterium tumefaciens)AGL1,pMW1質粒(BioVector質粒載體菌種細胞基因保藏中心)。

人工合成的DNA序列1(SEQ ID NO.4所示),該序列由含磷酸鹽誘導啟動子的DNA序列、表達與β-葡萄糖苷酶mRNA互補的反義mRNA的DNA序列、終止子序列及兩端的酶切位點序列組成。

2. 方法

(1)質粒pMW1的提取

含有質粒pMW1的大腸桿菌DH5α在含有30μg/mL氨芐霉素的LB培養基中培養18h。質粒提取按照上海生工的一步法質粒DNA抽提試劑盒(產品編號B518188)的操作流程提取。具體如下:取0.5mL菌液,10000r/m離心3min收集菌體,倒盡或吸干培養基。在菌體沉淀中加入700μL Lysis Buffer UF,吸打或振蕩至徹底懸浮菌體,室溫放置3min。將裂解液全部小心移入吸附柱,室溫放置1min,8000rpm離心2min。倒掉收集管中的液體,將吸附柱放入同一個收集管中,向吸附柱中加入500μL Prewash Solution,8000rpm離心2min。倒掉收集管中的液體,將吸附柱放入同一個收集管中,向吸附柱中加入500μL Wash Solution,8000rpm離心1min。倒掉收集管中的液體,將吸附柱放入同一個收集管中,再次向吸附柱中加入500μL Wash Solution,8000rpm離心1min。倒掉收集管中的液體,將吸附柱放入同一個收集管中,將空吸附柱和收集管放入離心機,8000rpm離心2min。將吸附柱放入干凈的1.5mL離心管中,在吸附膜中央加入50μL Elution Buffer,室溫靜置2min,8000r/m離心2 min。將所得到的質粒DNA溶液置于-20℃保存或用于后續試驗。

(2)重組質粒的構建

1)pMW1質粒、合成的DNA序列1的酶切、回收

往20μL提取的pMW1質粒或用雙蒸水稀釋10倍的DNA序列1中加入EcoI和KpnI(Takara)各2μL、酶切緩沖液2.5μL,37℃水浴3h后,加入2μL Loading Buffer,終止反應。

酶切的質粒或DNA序列1通過瓊脂糖凝膠電泳后用上海生工的SanPrep核酸純化套件(膠回收)試劑盒(B515103-0100)回收,得pMW1質粒酶切回收液、DNA序列1酶切回收液。

2)連接和轉化

連接體系為:pMW1質粒酶切回收液17.5μL,DNA序列1酶切回收液2μL,DNA連接酶(Takara)2.5μL,連接酶緩沖液2.5μL。16℃連接24h,連接產物備用。

將連接產物轉化大腸桿菌DH5α感受態細胞,挑取轉化子培養,提質粒進行酶切、測序鑒定,鑒定正確的重組質粒命名為pMW1-01。

(3)黑曲霉孢子原生質體制備及重組質粒的轉化

1)斜面活化

在無菌操作臺中,將保藏的黑曲霉ATCC16404菌種接入已滅菌的斜面培養基中,置于30℃恒溫培養箱中培養3天,斜面長出孢子。

所用斜面培養基為PDA培養基,其配制方法為:取新鮮馬鈴薯60g,去皮切成細絲狀,加入適量蒸餾水,置于蒸煮鍋內煮沸并不斷用玻璃棒攪拌至快成糊狀,用八層紗布過濾取濾液,依次加入用天平稱取的葡萄糖2g、瓊脂2g,攪勻,最后用蒸餾水定容至100mL,加熱溶解。分裝于試管中,約至試管的三分之一,然后加塞包扎滅菌,滅菌溫度為121℃,壓強為0.1Mpa,滅菌20min。滅菌結束后擺斜面冷卻待用。

2)孢子懸浮液的制備

將已活化的黑曲霉孢子從試管中刮到裝有生理鹽水的三角瓶中,置于30℃搖床上,150r/m震蕩10min。取出用4層擦鏡紙過濾,將濾液用3000r/m離心,棄上清液,用生理鹽水洗滌1-2次。然后對懸浮液進行鏡檢和計數,調整孢子濃度約為5×108個/mL,50℃熱激1min,30℃培養8h,得到孢子萌發懸浮液。

3)原生質體懸液的制備

采用高滲溶液即0.8mol/L NaCl溶液配制0.5%蝸牛酶和1%纖維素酶的混合酶液10mL,加入10mL孢子萌發懸浮液,30℃水浴4h,用微孔濾膜過濾,再用0.8mol/L NaCl溶液反復沖洗濾膜上的孢子,最后濾膜上的孢子溶解到10mL 0.8mol/L NaCl溶液中,得到原生質體懸液。

4)根癌農桿菌感受態的制備

挑取根癌農桿菌AGL1接種于3mL LB液體培養基中,28℃、180r/min培養過夜。取2mL 培養液接種于100mL LB液體培養基中繼續培養,至OD600為0.5左右。將培養液置冰浴中40min后4℃、5000r/min 離心10min,棄去上清液。用10mL 4℃預冷的無菌水離心洗滌1次,棄去上清液。再用10mL 4℃預冷的10%甘油懸浮菌體,4℃、5000r/min離心5min,棄去上清液。最后用1mL 4℃預冷的10%甘油懸浮,分裝成每管70μL,-70 ℃保存。

5)根癌農桿菌的轉化和培養

取1μL重組質粒pMW1-01,加到70μL根癌農桿菌AGL1感受態細胞中,混勻,吸取并加到間距0.2cm電轉杯中,擦拭干凈,調節電擊電壓為2.5kV,電擊5ms。將電轉化后的根癌農桿菌涂布于LB平板(含100μg/mL氨芐霉素)上進行篩選。篩選得到的陽性克隆子在LB平板(含100μg/mL氨芐霉素)上劃線,28℃培養2d。挑取單菌落接種于5mL LB液體培養基(含100μg/mL氨芐霉素)中,28℃、180r/min培養16~20h。取1mL根癌農桿菌菌液接種于含有相應抗性的100mL LB液體培養基中,28℃、180r/min培養至OD600為0.8左右時備用。

6)誘導培養和轉化

根癌農桿菌的誘導培養:取4mL(OD600=0.8)的根癌農桿菌菌液5000r/min離心5min收集菌體,用6mL含有400μmol/L乙酰丁香酮的IM培養基懸浮菌體,28℃懸浮培養5h。IM培養基:KH2PO4 1.45g,K2HPO4 2.05g,NH4NO3 0.5g,CaCl2 0.01g,MgSO4·7H2O 0.6g,NaCl 0.3g,葡萄糖2g,甘油5g,1000mL水,鹽酸調節pH 5.4。

轉化:黑曲霉原生質懸液250μL,調節誘導后的根癌農桿菌菌液的濃度,按黑曲霉孢子與根癌農桿菌1:100的數量比例等體積混合均勻,涂布在轉化媒介醋酸硝酸混合膜的IM固體培養基上。

7)轉化子的篩選

涂布在轉化媒介醋酸硝酸混合膜的IM固體培養基上的黑曲霉24℃避光培養48h,然后將原生質體長處的菌絲用無菌水稀釋后涂到含有150μg/mL潮霉素B的IM固體培養基上進行初篩,培養4d,隨后轉接至含有200μg/mL潮霉素B的IM培養基上進行復篩,獲得轉化成功的轉化子。

(4)誘導啟動降低β-葡萄糖苷酶的表達活性

1)產酶培養

產酶培養基配制:麩皮10g,蛋白胨1g,牛肉膏1g,自來水1L,115℃滅菌30min。在250mL三角瓶中裝入150mL液體產酶培養基。

在無菌操作臺中,將黑曲霉菌種或篩選的轉化子接入已滅菌的斜面PDA培養基中,置于30℃恒溫培養箱中培養3d,得到斜面孢子。得到的斜面孢子接入到產酶培養基中,接種量為 1×105孢子/mL,150r/m、30℃培養36h,培養液用濾紙過濾,測定濾液β-葡萄糖苷酶的酶活。出發菌株的酶活為22U/mL,所篩選轉化子的酶活為21.0U/mL。

β-葡萄糖苷酶酶活測定按照文獻(張莉,王婧,楊婷。產β-葡萄糖苷酶釀酒酵母菌株紫外誘變選育及酶學性質分析。《食品工業科技》, 2015。)中的方法。

2)磷酸鹽誘導產酶培養

往產酶培養基中加入磷酸鈉,磷酸鈉的終濃度為2g/L。在無菌操作臺中,將黑曲霉菌種或篩選的轉化子接入已滅菌的斜面PDA培養基中,置于30℃恒溫培養箱中培養3d,得到斜面孢子。黑曲霉菌種或篩選的轉化子接入到誘導培養基中,接種量為 1×105 孢子/mL,150r/m、30℃培養培養36h,濾紙過濾,測定濾液β-葡萄糖苷酶的酶活。出發菌株的酶活為25U/mL,所篩選轉化子的酶活為7.8U/mL。這說明啟動子在磷酸鹽誘導下,啟動β-葡萄糖苷酶反義mRNA的轉錄,降低了β-葡萄糖苷酶的翻譯量,從而降低了其表達量。

上述實施例為本發明較佳的實施方式,但本發明的實施方式并不受上述實施例的限制,其他的任何未背離本發明的精神實質與原理下所作的改變、修飾、替代、組合、簡化,均應為等效的置換方式,都包含在本發明的保護范圍之內。

SEQUENCE LISTING

<110> 湖北工業大學

<120> 一種磷酸鹽誘導啟動子降低黑曲霉β-葡萄糖苷酶表達酶活的方法

<130> 1

<160> 4

<170> PatentIn version 3.3

<210> 1

<211> 1346

<212> DNA

<213> Artificial

<220>

<223> 含磷酸鹽誘導啟動子的DNA序列

<400> 1

agctgcaatc attcgaatcg actggtcctt tatcggtcat acgcaccaaa gttggccggg 60

agtcagtcag aagggcgcac gcgtgtgacc agcccggctg cagatcccgg caacaggttc 120

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<210> 2

<211> 110

<212> DNA

<213> Artificial

<220>

<223> 表達與β-葡萄糖苷酶mRNA互補的反義mRNA的DNA序列

<400> 2

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<210> 3

<211> 214

<212> DNA

<213> Artificial

<220>

<223> 終止子序列

<400> 3

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<210> 4

<211> 1686

<212> DNA

<213> Artificial

<220>

<223> DNA序列1

<400> 4

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