為兼 性好氧菌。
[0033] 最適生長溫度試驗:以無菌操作吸取菌株的菌懸液加入液體培養基中,觀察試驗 菌株在10 °C、20 °C、30 °C、40 °C、50 °C、60 °C、70 °C、80 °C、90 °C時的生長情況,菌體的生長量以 Du800型分光光度計680nm處所測定的光密度值的大小表示。如果遇到不能生長時,則至少 觀察15-20天,以充分肯定其能否生長。每一溫度重復3次。結果表明,寡營養細菌D0B153的 最適宜溫度為28-35 °C
[0034] 以扮〇1〇8 1;[(^08七31:;[011系統的6?111測定卡進行測試,其0-纖維二糖,龍膽二糖, 鹿糖,D-松二糖,α-D-乳糖,蜜二糖,N-乙酰-D-匍糖胺,N-乙酰-β-D-甘露糖胺,α-D-匍糖,D-甘露糖,D-果糖,D-半乳糖,3-甲酰葡糖,D-果糖,D-甘露醇,D-阿拉伯醇,肌醇,甘油,D-葡 糖-6-磷酸,D-果糖-6-磷酸,D-天冬氨酸,D-絲氨酸,明膠,L-谷氨酸,林肯霉素,潔霉素,果 膠,L-半乳糖醛酸內酯,D-葡糖酸,D-葡糖醛酸葡糖醛酰胺,粘酸,粘液酸,奎寧酸,糖質酸, L_蘋果酸,γ -氨基-丁酸,α-羥基-丁酸,β-羥基-D,L丁酸,乙酰乙酸,甲酸利用均呈陽性結 果,判定為芽孢桿菌屬一新種,確定該菌參考芽孢桿菌(Bacillus sp.),建議的生物學命名 為Bacillus sp.D0B1530
[0035] 通過上述對于菌種寡營養細菌Bacillus sp.D0B153CGMCC NO. 11926的菌體形態、 培養特征觀察及生理生化指標測定,即通過菌體形態觀察、菌株培養特征觀察、生長溫度測 定、耐性試驗等試驗,與常見的芽孢桿菌相比,參照《伯杰氏系統細菌學鑒定手冊》第八版和 《常用細菌系統鑒定手冊》的方法進行分類,從菌種分類角度將菌種編號為D0B153的菌株綜 合鑒定為芽孢桿菌(Bacillus sp.)D0B153。
[0036] 實施例二:寡營養細菌Bacillus sp.D0B153CGMCC NO. 11926的分子水平鑒定
[0037] 1、PCR擴增寡營養細菌D0B153的DNA序列及其測序
[0038]挑取少量寡營養細菌D0B153菌株的單菌落,放入盛有25yL無菌水的EP管中,100°C 煮沸8-10min,后迅速放入冰水混合物中5min,離心10000r/min、5min,4°C保存,用時取上 清。
[0039] 16S r DNA基因序列測定及其系統進化樹的構建:按常規方法提取寡營養細菌 D0B153菌株的總DNA,用去離子水將稀釋通用引物進行16S r DNA區段的PCR擴增。
[0040] 50μ1的反應體系含:10 X PCR緩沖液5μ1,引物各20pmol,模板DNAlyl,TaqTM (TaKaRa公司)0.5U,dNTP SyLPCR擴增條件:95°C預變性5min,94°C45sec,55°Clmin,72°C lmin循環30次,72°C10min修復延伸,4°C終止反應。PCR產物的純化:PCR產物進行1%瓊脂糖 凝膠中電泳,用TaKaRa PCR Fragment RecoveryKit從膠中回收目的片段,溶于30μ1的高純 水中。送至測序公司進行16S r DNA區段序列的測定,菌種寡營養細菌D0B153的基因序列參 見附后的基因序列表。
[0041] aacgctggcggcgtgcctaatacatgcaagtcgagccagttgttgagtttactcaacaattagcggcggacgggtga gtaacacgtgggcaacctgcctataagactgggataacttctggaaaccggagctaataccggatatgttcttctct tgcatgagagaagatggaaagacggtctcggctgtcacttatagatgggcccgcggcgcattagctagttggtgagg taatggctcaccaaggcaacgatgcgtagtcgacctgagagggtgatcggccacactgggactgagacacggcgcag actcctacgcgaggcagcagtagggaatcttccgcaatgaacgaaagtctgacggagcaacgccgcgtgaacgatga aggctttcgggtcgtaaagttctgttgttagggaagaccaagtgccagagtaactgctggtaccttgacggtaccta accagaaagccacggctaattacgtgccagcagccgcggtaatacgtaggtggcaagcgttatccggaattattggg cgtaaagcgcgcgcaggtggttccttaagtctgatgtcagagccaatggctcaaccggggagggtcattggaaactt tggaacttgagtgtagaagagcatagtggaattccacgtgtagcggtgaaatgcgtagagatgtggaggaacaccag tggcgaaggcgactttctggtctataactgacactgaggcgcgaaagcgtggggagcaaacaggattagataccctg ttagtccacgccgtaaacgatgagtgctaagtgttaccgggtttccgccctttagtgctgcagctaacgcattaagc actccgcctgggcgatacggccgcaaggctgaaactcaaaggaattgacgggggcccgcacaagcggtggagcatgt ggtttaattcgaagcaacgcgaagaaccttaccaggttgtgacatcctctgacactcctagagttaggacgttcccc ttcgggggacagagtgacacgtggtgcatgcggtgtcgtcagctcgtgtcgtgagatgttgggttaagtcccgcaac gagcgcaacccttgatcttagttgccagcatccagtaaggcactctacggtgactgcctgtgataaaccggaggaag gtggggatgacgtcaaatcaacatgccccttatgacctgggctacacacgtgctacaatggatggtacaaagagctg caaacccgtgagtgtaagcgaatctcatagagccattctcagttcggattgcaggctgcaactcgcctgcatgaagc tggaatcgctagtaatcgcccatcagcatgccgcggtgaatacgtctccggaccttgtacacaccgcccgtcacacc acgagagtttgtaacacccgaagtcggtgaggtaaccgcaaggagctagccgcctaaggtgggacagatgattgggg tgaagtcgtaacaaggtagccgtatcggaaggtgcggctggatca
[0042] 3、16S r DNA基因序列比對及系統發育分析
[0043] 將測序得到的16S r DNA序列與GenBank數據庫中的核苷酸序列進行BLAST分析, 從中獲取相近的16S r DNA序列,將寡營養細菌D0B153的16S r DNA序列在NCBI數據庫中進 行BLAST分析后,構建系統進化樹。參見附圖1所示,
[0044] 通過16S rRNA基因序列測定及比對,并建立系統發育樹分析,結果表明菌株屬于 芽抱桿菌屬(Bacillus sp·),其與NCBI報道菌株Bacillus psychrosaccharolyticus ATCC 23296τ同源性最高,最高相似性為96.6%,初步斷定為該屬潛在新種。其屬性類似于短小芽 孢桿菌(Bacillus pumilus),但是有別于常見的短小芽孢桿菌(Bacillus pumilus)具有新 菌種的典型性,是一種典型的寡營養細菌的新菌種芽孢桿菌(Bacillus sp.),綜合結合寡 營養細菌D0B153的形態結構特征及生理生化特性,確定其為菌種編號為D0B153綜合鑒定為 寡營養細菌Bacillus sp·。
[0045] 實施例三:寡營養細菌Bacillus sp.D0B153CGMCC NO. 11926的特性研究
[0046] 1、實驗過程
[0047]將寡營養細菌D0B153在LB培養基上反復劃線活化后,用于液體菌劑的制備,接種 后置37°C搖瓶培養60h。
[0048] (1)固沙試驗
[0049]用流沙裝長30cm X寬20cm X高5cm的磁盤2個,將流沙裝入盤中,把經過搖床震蕩 培,養后的寡營養細菌D0B153噴灑在其中一個沙盤的流沙表面,另一個沙盤噴