Rna干擾的目標堿基序列的搜索方法,導致rna干擾的多核苷酸的堿基序列的設計...的制作方法

專利名稱：：Rna干擾的目標堿基序列的搜索方法,導致rna干擾的多核苷酸的堿基序列的設計...的制作方法
技術領域：
：本發明涉及RNA干擾(RNAinterference)，具體地說，涉及提高應用RNA干擾的試驗、制備等的效率及產生RNA干擾的多核苷酸序列的設計方法。在本說明書的以下部分中將RNA干擾記為“RNAi”。另外，本發明還涉及堿基序列處理裝置、在計算機上執行堿基序列處理方法的程序、記錄介質以及堿基序列處理系統，特別是涉及由RNA干擾的目標基因的堿基序列出發高效篩選能對目標基因產生RNA干擾的堿基序列的堿基序列處理裝置、在計算機上執行堿基序列處理方法的程序、記錄介質以及堿基序列處理系統。
背景技術：
：RNA干擾是指一種由和意圖阻斷其功能的基因的特定區域相同的正義和反義RNA組成的雙鏈RNA(double-strandedRNA)(以下簡稱為dsRNA)干擾、破壞目標基因的轉錄產物mRNA的相同部分的現象。1998年在線蟲上被首次試驗發現，可是，在哺乳動物上，當將30個或30個以上的長雙鏈RNA向細胞內導入時就誘導干擾反應，細胞經細胞凋亡程序而死亡，采用RNA干擾存在困難。但另一方面也發現，在小鼠初期胚胎或哺乳動物培養細胞中也可以產生RNA干擾，RNA干擾的誘導機構本身在哺乳動物中也存在。現在，已經發現，短的、大約21-23堿基對的雙鏈RNA(shortinterferingRNA，siRNA)能夠在哺乳動物細胞系中不產生細胞毒性的同時誘導產生RNA干擾，從而使在哺乳動物中利用RNA干擾成為了可能。發明詳述RNA干擾是一種值得期待有各種應用的技術，可是，在果蠅、線蟲中發現，和某些基因的特定領域相同的雙鏈RNA(dsRNA)以及小干擾RNA(siRNA)幾乎所有的序列都可以顯示干擾效果，但是在哺乳動物中隨機選擇的(21堿基的)小干擾RNA的70-80％都不顯示RNA干擾效果。這對在哺乳動物中利用RNA干擾進行基因功能解析提出了很大的問題。而且，現有技術在設計小干擾RNA時，依賴試驗者的經驗、感覺的部分很多，很難高準確率地設計能夠產生實際RNA干擾效果的小干擾RNA。另外，因為RNA合成需要時間、費用，所以，為進行RNA干擾而進行徒勞無益地合成小干擾RNA對于RNA干擾的研究以及眾多的利用RNA干擾方法的普及都構成了妨礙。在以上這種情況下，提供一種簡便、高效地進行RNA干擾的方法就成為了一個課題。為了解決上述課題，本發明者們針對RNA干擾法中最耗勞力、時間、費用的部分之一即如何容易地獲得小干擾RNA的方法進行了研究。因為在哺乳動物中小干擾RNA的調節制備非常困難，本發明者們通過采用哺乳動物培養細胞系嘗試確定能夠有效地產生RNA干擾的序列的規律性，從而發現了有效產生RNA干擾的小干擾RNA的序列規律性，完成了本發明。本發明如下所示(1)搜索RNA干擾的目標堿基序列的方法，從RNA干擾的目標基因的堿基序列中搜索符合下述規則(a)-(d)的序列部位。(a)3’末端的堿基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶，(b)5’末端的堿基是鳥嘌呤或胞嘧啶，(c)3’末端的7堿基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，(d)堿基數在能夠產生RNA干擾且不產生細胞毒性的范圍內。(2)上述(1)所述的目標堿基序列的搜索方法，其中在上述規則(c)中，7堿基中的至少3個或3個以上為從富含腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基。(3)上述(1)或(2)中所述的目標堿基序列的搜索方法，其中在上述規則(d)中，堿基數為13-28。(4)在目標基因的堿基序列中搜索符合下述規則(a)-(d)的堿基序列、設計和搜索的堿基序列相同的堿基序列、從而產生RNA干擾的多核苷酸堿基序列設計方法。(a)3’末端的堿基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶，(b)5’末端的堿基是鳥嘌呤或胞嘧啶，(c)3’末端的7堿基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，(d)堿基數在能夠產生RNA干擾且不產生細胞毒性的范圍內。(5)上述(4)所述的堿基序列設計方法，其中在上述規則(c)中，7堿基中的至少3個或3個以上為從富含腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基。(6)上述(4)或(5)中所述的堿基序列設計方法，所設計的相同堿基序列的堿基數為13-28。(7)上述(4)至(6)任意一項所述的堿基序列設計方法，其中經過設計，使得上述所設計的相同堿基序列中至少80％或80％以上的堿基與搜索到的堿基序列一致。(8)上述(4)至(7)任意一項所述的堿基序列設計方法，其中搜索到的堿基序列的3’末端堿基和設計的堿基序列的3’末端堿基相同，而且，搜索到的堿基序列的5’末端堿基和設計的堿基序列的5’末端堿基相同。(9)上述(4)至(8)任意一項所述的堿基序列設計方法，在多核苷酸的3’末端添加突出部。(10)雙鏈多核苷酸的制備方法，包括形成一條鏈，其在與規定序列相同的堿基序列的3’末端設一突出部，所述規定序列包含在目標基因的堿基序列中且符合下述規則(a)-(d)；形成另一條鏈，其在與上述規定序列相同的堿基序列的互補序列的3’末端設一突出部；合成雙鏈多核苷酸時各鏈的堿基數設計成15-30，(a)3’末端的堿基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶，(b)5’末端的堿基是鳥嘌呤或胞嘧啶，(c)3’末端的7堿基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，(d)堿基數在能夠產生RNA干擾且不產生細胞毒性的范圍內。(11)雙鏈多核苷酸，通過以下方法合成從RNA干擾的目標基因的堿基序列中搜索符合下述規則(a)-(d)、堿基數為13-28的序列部位，形成兩條鏈，其中一條鏈在與包含在目標基因的堿基序列中且符合下述規則(a)-(d)的規定序列相同的堿基序列的3’末端設一突出部，另一條鏈在與上述規定序列相同的堿基序列的互補序列的3’末端設一突出部，各鏈的堿基數設計成15-30。(a)3’末端的堿基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶，(b)5’末端的堿基是鳥嘌呤或胞嘧啶，(c)3’末端的7堿基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，(d)堿基數在能夠產生RNA干擾且不產生細胞毒性的范圍內。(12)基因表達抑制方法，包含搜索步驟，是從RNA干擾的目標基因的堿基序列中搜索符合下述規則(a)-(d)、堿基數為13-28的序列部位，和雙鏈多核苷酸合成步驟，所述雙鏈中，一條鏈在與包含在目標基因的堿基序列中且符合下述規則(a)-(d)的規定序列相同的堿基序列的3’末端設一突出部，另一條鏈在與上述規定序列相同的堿基序列的互補序列的3’末端設一突出部，各鏈的堿基數設計成15-30，和抑制目的基因表達的步驟，其把合成的雙鏈多核苷酸添加至希望抑制目標基因表達的表達系統中，(a)3’末端的堿基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶，(b)5’末端的堿基是鳥嘌呤或胞嘧啶，(c)3’末端的7堿基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，(d)堿基數在能夠產生RNA干擾且不產生細胞毒性的范圍內。(13)堿基序列處理裝置，其特征是，具備部分堿基序列制作裝置，其可取得RNA干擾的目標基因的堿基序列信息，并制作上述堿基序列信息中具有預定堿基數的序列部位的部分堿基序列信息形成部分堿基序列，和3’末端堿基判定裝置，其判定由上述部分堿基序列制作裝置制作的部分堿基序列信息的3’末端的堿基是否是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)，和5’末端堿基判定裝置，其判定由上述部分堿基序列制作裝置制作的部分堿基序列信息的5’末端的堿基是否是鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)，和判定是否包含預定堿基的裝置，其判定包含上述部分堿基序列制作裝置制作的部分堿基序列信息3’末端7堿基的上述堿基序列信息是否是富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基組成的預定堿基，和規定序列選擇裝置，根據上述3’末端堿基判定裝置、上述5’末端堿基判定裝置、上述判定是否包含預定堿基的裝置而判定的結果，從上述部分堿基序列制作裝置制作的部分堿基序列信息中篩選上述目標基因中特異地產生RNA干擾的規定序列信息。(14)根據(13)所述的堿基序列處理裝置，其特征是，上述部分堿基序列制作裝置進一步包括區域特異性堿基序列制作裝置，其由上述堿基序列信息中目標基因編碼區、或轉錄區相應部位制成具有預定堿基數的部分堿基序列信息。(15)根據(13)或(14)所述的堿基序列處理裝置，其特征是，上述部分堿基序列制作裝置進一步包括共同堿基序列制作裝置，其用于制作在源于不同生物的多個上述堿基序列信息間共有、且具有預定堿基數的上述部分堿基序列信息。(16)上述(13)至(15)任意一個記載的堿基序列處理裝置，其特征是，上述富含的堿基序列信息是一種包含上述7堿基的堿基序列信息，所述7堿基中至少含有3個或3個由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選出的1或1種以上的堿基。(17)上述(13)至(16)的任意一個記載的堿基序列處理裝置，其特征是上述預定的堿基數是13-28。(18)上述(13)至(17)的任意一個記載的堿基序列處理裝置，其特征是，上述部分堿基序列制作裝置進一步包含含有突出部堿基序列制作裝置，其制作含有突出部的上述部分堿基序列信息。(19)上述(13)至(17)的任意一個記載的堿基序列處理裝置，其特征是，其還包括突出部添加裝置，其在上述規定序列信息的至少一個末端添加上述突出部。(20)上述(18)至(19)的任意一個記載的堿基序列處理裝置，其特征是，上述突出部的堿基數為2。(21)上述(13)至(20)的任意一個記載的堿基序列處理裝置，其特征是，其進一步還包括，相同或類似堿基序列搜索裝置，其從其它的上述堿基序列信息中搜索和上述規定序列信息相同或類似的上述堿基序列信息，和無關基因靶標評價裝置，其根據由上述相同或類似堿基序列搜索裝置搜索得到的上述相同或類似上述堿基序列信息，評價上述規定序列信息是否靶向與上述目標基因無關的基因。(22)上述(21)記載的堿基序列處理裝置，其特征是，上述無關基因靶標評價裝置其進一步包括，總和計算裝置，其根據由上述相同或類似堿基序列搜索方法搜索得到的相同或類似堿基序列信息中，與目標基因無關的基因的堿基序列信息的總數，以及與目標基因無關的基因的堿基序列信息所附帶的相同或類似程度的數值，計算出表示相同或類似程度的數值的倒數的總和，和總和基準靶標評價裝置，其根據由上述總和計算方法算出的總和評價上述規定序列信息是否靶向與目標基因無關的基因。(23)一種在計算機上執行堿基序列處理方法的程序，其特征是，其堿基序列處理方法包含部分堿基序列制作步驟，其取得RNA干擾的目標基因的堿基序列信息，并制作在上述堿基序列信息中具有預定堿基數的序列部位的部分堿基序列信息，和3’末端堿基判定步驟，其判定上述部分堿基序列制作步驟中制作得到的部分堿基序列信息的3’末端堿基是否是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)，和5’末端堿基判定步驟，其判定上述部分堿基序列制作步驟中制作得到的部分堿基序列信息的5’末端堿基是否是鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)，和判定是否包含預定堿基的步驟，其判定包含上述部分堿基序列制作步驟中制作得到的部分堿基序列信息3’末端7堿基的堿基序列信息是否富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，和規定序列選擇步驟，根據上述3’末端堿基判定步驟、上述5’末端堿基判定步驟、上述判定是否包含預定堿基的步驟的判定結果，從上述部分堿基序列制作步驟中制作得到的部分堿基序列信息中選擇對目標基因特異地產生RNA干擾的規定序列信息。(24)一種計算機可讀取的記錄介質，其特征是其記錄上述(23)中記載的程序。(25)一種堿基序列處理系統，其特征是，將處理RNA干擾的目標基因的堿基序列信息的堿基序列處理裝置和客戶機裝置通過網絡可通訊地連接，上述客戶機裝置具備堿基序列發送裝置，其將上述目標基因的名稱或上述堿基序列信息提交給上述堿基序列處理裝置，和規定序列取得裝置，其取得由上述堿基序列處理裝置發送的、對上述目標基因特異地產生RNA干擾的規定序列信息，上述堿基序列處理裝置具備部分堿基序列制作裝置，其取得由上述客戶機裝置發送的對應上述目標基因名稱的堿基序列信息或者由上述客戶機裝置發送的上述堿基序列信息，制作與上述堿基序列信息中具有預定堿基數的序列部位對應的部分堿基序列信息，和3’末端堿基判定裝置，其判定由上述部分堿基序列制作裝置制作的部分堿基序列信息3’末端堿基是否是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)，和，5’末端堿基判定裝置，其判定由上述部分堿基序列制作裝置制作的部分堿基序列信息5’末端堿基是否是鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)，和判定是否包含預定堿基的裝置，其判定包含上述部分堿基序列制作裝置制作的部分堿基序列信息3’末端7堿基的上述堿基序列信息是否富含腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，和規定序列選擇裝置，其根據上述3’末端堿基判定裝置、上述5’末端堿基判定裝置、判定是否包含預定堿基的裝置的判定結果，從上述部分堿基序列制作裝置制作的部分堿基序列信息中篩選上述規定序列信息，和規定序列發送裝置，其將上述規定序列選擇裝置篩選的上述規定序列信息向上述客戶機裝置發送。(26)一種堿基序列處理方法，其特征是，其包含部分堿基序列制作步驟，其取得RNA干擾的目標基因的堿基序列信息，并制作在上述堿基序列信息中具有預定堿基數的序列部位的部分堿基序列信息，和3’末端堿基判定步驟，其判定上述部分堿基序列制作步驟中制作得到的部分堿基序列信息的3’末端堿基是否是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)，和5’末端堿基判定步驟，其判定上述部分堿基序列制作步驟中制作得到的部分堿基序列信息的5’末端堿基是否是鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)，和判定是否包含預定堿基的步驟，其判定包含上述部分堿基序列制作步驟中制作得到的部分堿基序列信息3’末端7堿基的堿基序列信息是否富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，和規定序列選擇步驟，根據上述3’末端堿基判定步驟、上述5’末端堿基判定步驟、上述判定是否包含預定堿基的步驟的判定結果，從上述部分堿基序列制作步驟中制作得到的部分堿基序列信息中選擇對目標基因特異地產生RNA干擾的規定序列信息。(27)上述(26)中記載的堿基序列處理方法，其特征是，上述部分堿基序列制作步驟進一步包含區域特異性堿基序列制作步驟，其由上述堿基序列信息中目標基因編碼區、或轉錄區相應部位制成具有預定堿基數的部分堿基序列信息。(28)上述(26)或(27)中記載的堿基序列處理方法，其特征是，上述部分堿基序列制作步驟進一步包含共同堿基序列制作步驟，其用于制作在源于不同生物的多個上述堿基序列信息間共有、且具有預定堿基數的上述部分堿基序列信息。(29)上述(26)至(28)中任一記載的堿基序列處理方法，其特征是，上述富含的堿基序列信息是一種包含上述7堿基的堿基序列信息，所述7堿基中至少含有3個或3個由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選出的1或1種以上的堿基。(30)上述(26)至(29)中任一記載的堿基序列處理方法，其特征是上述預定的堿基數是13-28。(31)上述(26)至(30)中任一記載的堿基序列處理方法，其特征是，上述部分堿基序列制作步驟進一步包含含有突出部堿基序列制作步驟，其制作含有突出部的上述部分堿基序列信息。(32)上述(26)至(31)中任一記載的堿基序列處理方法，其特征是，其還包括突出部添加步驟，其在上述規定序列信息的至少一個末端添加上述突出部。(33)上述(31)或(32)記載的堿基序列處理方法，其特征是，上述突出部的堿基數為2。(34)上述(26)至(33)中任一記載的堿基序列處理方法，其特征是，其進一步還包括，相同或類似堿基序列搜索步驟，其從其它的上述堿基序列信息中搜索和上述規定序列信息相同或類似的上述堿基序列信息，和無關基因靶標評價步驟，其根據由上述相同或類似堿基序列搜索步驟搜索得到的上述相同或類似上述堿基序列信息，評價上述規定序列信息是否靶向與上述目標基因無關的基因。(35)上述(34)記載的堿基序列處理方法，其特征是，上述無關基因靶標評價步驟其進一步還包括，總和計算步驟，其根據由上述相同或類似堿基序列搜索方法搜索得到的相同或類似堿基序列信息中，與目標基因無關的基因的堿基序列信息的總數，以及與目標基因無關的基因的堿基序列信息所附帶的相同或類似程度的數值，計算出表示相同或類似程度的數值的倒數的總和，和總和基準靶標評價步驟，其根據由上述總和計算方法算出的總和評價上述規定序列信息是否靶向與目標基因無關的基因。(36)上述(23)記載的程序，其特征是，上述部分堿基序列制作步驟進一步包含區域特異性堿基序列制作步驟，其由上述堿基序列信息中目標基因編碼區、或轉錄區相應部位制成具有預定堿基數的部分堿基序列信息。(37)上述(23)或(36)記載的程序，其特征是，上述部分堿基序列制作步驟進一步包含共同堿基序列制作步驟，其用于制作在源于不同生物的多個上述堿基序列信息間共有、且具有預定堿基數的部分堿基序列信息。(38)上述(23)、(36)、(37)任一記載的程序，其特征是，上述富含的堿基序列信息是一種包含上述7堿基的堿基序列信息，所述7堿基中至少含有3個或3個由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選出的1或1種以上的堿基。(39)上述(23)、(36)、(37)、(38)任一記載的程序，其特征是上述預定的堿基數是13-28。(40)上述(23)、(36)、(37)、(38)、(39)任一記載的程序，其特征是，上述部分堿基序列制作步驟進一步包含含有突出部堿基序列制作步驟，其制作含有突出部的上述部分堿基序列信息。(41)上述(23)、(36)、(37)、(38)、(39)任一記載的程序，其特征是，其還包括突出部添加步驟，其在上述規定序列信息的至少一個末端添加上述突出部。(42)上述(40)或(41)記載的程序，其特征是，上述突出部的堿基數為2。(43)上述(23)、(36)、(37)、(38)、(39)、(40)、(41)、(42)任一記載的程序，其特征是，其進一步還包括，相同或類似堿基序列搜索步驟，其從其它的上述堿基序列信息中搜索和上述規定序列信息相同或類似的上述堿基序列信息，和無關基因靶標評價步驟，其根據由上述相同或類似堿基序列搜索步驟搜索得到的上述相同或類似上述堿基序列信息，評價上述規定序列信息是否靶向與上述目標基因無關的基因。(44)上述(43)記載的程序，其特征是，上述無關基因靶標評價步驟其進一步還包括，總和計算步驟，其根據由上述相同或類似堿基序列搜索方法搜索得到的相同或類似堿基序列信息中，與目標基因無關的基因的堿基序列信息的總數，以及與目標基因無關的基因的堿基序列信息所附帶的相同或類似程度的數值，計算出表示相同或類似程度的數值的倒數的總和，和總和基準靶標評價步驟，其根據由上述總和計算方法算出的總和評價上述規定序列信息是否靶向與目標基因無關的基因。(45)一種計算機可讀取的記錄介質，其特征是其記錄上述(23)、(36)-(44)中任一記載的程序。(46)上述(25)中記載的堿基序列處理系統，其特征是，在上述堿基序列處理裝置中，上述部分堿基序列制作裝置進一步包括區域特異性堿基序列制作裝置，其由上述堿基序列信息中目標基因編碼區、或轉錄區相應部位制成具有預定堿基數的部分堿基序列信息。(47)上述(25)或(46)中記載的堿基序列處理系統，其特征是，在上述堿基序列處理裝置中，上述部分堿基序列制作裝置進一步包含共同堿基序列制作裝置，其用于制作在源于不同生物的多個上述堿基序列信息間共有、且具有預定堿基數的上述部分堿基序列信息。(48)上述(25)、(46)、(47)中任一記載的堿基序列處理系統，其特征是，在上述堿基序列處理裝置中，上述富含的堿基序列信息是一種包含上述7堿基的堿基序列信息，所述7堿基中至少含有3個或3個由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選出的1或1種以上的堿基。(49)上述(25)、(46)、(47)、(48)中任一記載的堿基序列處理系統，其特征是，在上述堿基序列處理裝置中，上述預定的堿基數是13-28。(50)上述(25)、(46)、(47)、(48)、(49)中任一記載的堿基序列處理系統，其特征是，在上述堿基序列處理裝置中，上述部分堿基序列制作裝置進一步包含含有突出部的堿基序列的制作裝置，其制作含有突出部的上述部分堿基序列信息。(51)上述(25)、(46)、(47)、(48)、(49)中任一記載的堿基序列處理系統，其特征是，在上述堿基序列處理裝置中，其還包括突出部添加裝置，其在上述規定序列信息的至少一個末端添加上述突出部。(52)上述(50)或(51)中任一記載的堿基序列處理系統，其特征是，在上述堿基序列處理裝置中，上述突出部的堿基數為2。(53)上述(25)、(46)、(47)、(48)、(49)、(50)、(51)、(52)中任一記載的堿基序列處理系統，其特征是，在上述堿基序列處理裝置中，其進一步包括，相同或類似堿基序列搜索裝置，其從其它堿基序列信息中搜索與上述規定序列信息相同或類似的堿基序列信息，和無關基因靶標評價裝置，其根據由上述相同或類似堿基序列搜索裝置搜索得到的相同或類似堿基序列信息，評價上述規定序列信息是否靶向與上述目標基因無關的基因。(54)上述(54)中記載的堿基序列處理系統，其特征是，在上述堿基序列處理裝置中，上述無關基因靶標評價裝置其進一步還包括，總和計算裝置，其根據由上述相同或類似堿基序列搜索方法搜索得到的相同或類似堿基序列信息中，與目標基因無關的基因的堿基序列信息的總數，以及與目標基因無關的基因的堿基序列信息所附帶的相同或類似程度的數值，計算出表示相同或類似程度的數值的倒數的總和，和總和基準靶標評價裝置，其根據由上述總和計算方法算出的總和評價上述規定序列信息是否靶向與目標基因無關的基因。圖1表示人與小鼠的共同序列的siRNA設計圖。圖2表示顯示RNAi效果的siRNA的規律性的圖。圖3表示人FBP1及小鼠Fbp1的堿基序列中具有規定序列的共同部分(粗體部分)。圖4列舉人FBP1及小鼠Fbp1中共有的規定序列。圖5對人FBP1及小鼠Fbp1中共同的規定序列進行評分。圖6表示為了避免目標基因以外的基因敲除，取規定序列中的一個進行BLAST搜索的結果。圖7表示為了避免目標基因以外的基因敲除，取規定序列中的一個進行BLAST搜索的結果。圖8表示程序的輸出結果。圖9表示RNA片斷的設計(a～p)。圖10表示驗證a～p的siRNA是否顯示RNAi效果的試驗結果，[B]為在果蠅培養細胞中的結果，[C]為在人培養細胞中的結果。圖11表示a～p的siRNA的序列特征分析結果。圖12表示本發明的基本原理的原理構成圖。圖13的框圖表示一例適用于本發明的本發明系統的堿基序列處理裝置100的構成。圖14表示目標基因堿基序列文件106a中存放的信息的一例。圖15表示部分堿基序列文件106b中存放的信息的一例。圖16表示判定結果文件106c中存放的信息的一例。圖17表示規定序列文件106d中存放的信息的一例。圖18表示對照序列數據庫106e中存放的信息的一例。圖19表示同一性或相似性文件106f中存放的信息的一例。圖20表示評價結果文件106g中存放的信息的一例。圖21的框圖表示一例適用于本發明的本發明系統的部分堿基序列制作部102a的構成。圖22的框圖表示一例適用于本發明的本發明系統的無關基因標靶評價部102h的構成。圖23表示本實施例中本發明系統的主處理的一例的流程圖。圖24表示本實施例中本發明系統的無關基因標靶評價處理的一例的流程圖。圖25表示目標基因表達載體pTREC的構造圖。圖26表示在實施例2的2.(2)中一條引物經設計不夾帶有內含子時的PCR的結果。圖27表示在實施例2的2.(2)中一條引物經設計夾帶有內含子時的PCR的結果。圖28表示siRNA；siVIM35的序列及構造的圖。圖29表示siRNA；siVIM812的序列及構造的圖。圖30表示siRNA；siControl的序列及構造的圖。圖31表示siVIM812及siVIM35的RNAi活性的分析結果。圖32表示siControl、siVIM812及siVIM35相對于波形蛋白(vimentin)的RNAi活性。圖33表示抗體染色的結果。圖34表示根據程序設計的siRNA對螢光素酶基因的RNAi活性的測定結果。圖35表示根據程序設計的siRNA對SARS病毒序列的RNAi活性的測定結果。實施本發明的優選實施例本發明的實施方案，按以下1至7的順序說明1、RNA干擾的目標基因序列搜索方法2、產生RNA干擾的多核苷酸的堿基序列設計方法3、雙鏈多核苷酸的制備方法4、基因抑制表達方法5、siRNA序列設計程序6、siRNA序列設計的商務模型系統(businessmodelsystem)7、執行siRNA序列設計程序的堿基序列處理裝置等1、RNA干擾的目標基因序列搜索方法本發明的搜索方法是一種從目標基因的堿基序列搜索出引起RNA干擾的堿基序列的方法。具體地說，本發明的搜索方法是從RNA干擾的目標基因堿基序列中搜索符合下述規則(a)至(d)的序列部位。(a)3’末端的堿基是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)。(b)5’末端的堿基是鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)。(c)3’末端的7堿基序列中富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基。(d)堿基數在能夠產生RNA干擾且不產生細胞毒性的范圍內。所謂“目標基因”中的“基因”是指編碼遺傳信息的載體。“基因”由諸如DNA、RNA或DNA及RNA的復合體等編碼遺傳信息的物質構成，作為遺傳信息，而不是其物質本身，可以將堿基序列的電子數據在電子計算機上進行處理。“目標基因”可以指編碼一個編碼區的目標基因、跨越多個編碼區的目標基因或者序列明確的所有多核苷酸。想搜索具有具體功能的基因的時候，通過只將此規定基因作為目標基因，可以高效地搜索能夠在該規定基因特異性地產生RNA干擾的堿基序列。也即，眾所周知RNA干擾是一種通過干擾破壞mRNA的現象，通過選擇特定的編碼區能夠減輕搜索負荷。而且，一組轉錄區也可以作為目標基因進行搜索。另外，除非作出相反的說明，本說明書中表示的堿基序列均以正義鏈，即mRNA的序列，作為基準。此外，在本說明書中，將滿足符合上述規則(a)至(d)的堿基序列稱之為“規定序列”，在上述規則中，胸腺嘧啶(T)對應于DNA序列，而尿嘧啶(U)則對應于RNA序列。在規則(c)中規定，3’末端的附近的序列為富含從腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中任選的堿基，作為搜索時的一個指標，具體規定為在從3’末端開始的7堿基范圍內的序列為富含選自腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)的堿基。在規則(c)中，所謂“富含序列”意指某一預定堿基出現頻率高。概括地，在規定序列的3’末端側的5-10個堿基、優選7個堿基序列中含有1種或1種以上從腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中任選的堿基，優選含量至少40％或40％以上、更優選至少50％。更具體地說，比如在規定序列為19堿基的情況下，3’末端側的7堿基中優選含有至少3個堿基、更優選至少4個堿基、特別優選至少5個堿基是從腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中任選的1種或1種以上堿基。對于是否符合規則(c)的確認方法不進行具體的限定，只要能確定7堿基中優選至少3個堿基、更優選至少4個堿基、特別優選至少5個堿基是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)就可以。例如，將3’末端的7堿基序列中含有3個或3個以上從腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中任選的1種或1種以上堿基定義為“富含”時，從3’末端的第1個堿基開始逐個比對是上述三種堿基的哪一個，一直比對至第7個堿基結束，只要出現了3個的情況就認為能夠判斷其符合規則(c)，例如，如果在至第3個堿基處就已經出現了3個堿基，檢查3個堿基就足夠了。也就是說，在針對規則(c)進行搜索時，沒必要必須將3’末端側的7堿基全部比對。相反的話，比對至第7個堿基仍沒有出現3個以上堿基則判定為不富含，不滿足規則(c)。眾所周知，雙鏈多核苷酸中腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)以氫鍵互補結合，而且，相對于鳥嘌呤(G)和胞嘧啶(C)的氫鍵互補結合(G-C氫鍵結合)形成三個氫鍵結合部位，腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)的氫鍵互補結合(A-T/U)只具有2個氫鍵結合部位，一般而言，相對于G-C氫鍵結合，A-T/U氫鍵結合的結合力較弱。在規則(d)中規定了搜索堿基序列的堿基數。搜索堿基序列的堿基數就是產生RNA干擾的堿基數。根據不同的條件，如生物體種類的差異，堿基數過大的siRNA會對細胞產生毒性。堿基數的上限因你想要產生RNA干擾的生物種類而異，但不論任何物種，構成siRNA的單鏈堿基數也優選為30以下，而且對于哺乳動物而言，優選為24或24以下，更優選為22或22以下。而且，只有RNA干擾能產生，就不對產生RNA干擾的堿基數的下限進行特別限制，優選至少15，更優選至少18，還更優選至少20。單鏈構成的siRNA的搜索堿基數特別優選21。此外，下面還要說明，siRNA中還要在規定序列的3’末端設突出部。突出部的堿基數為優選為2，因此，不含突出部分，僅僅規定序列的堿基數的上限最好為28或28以下，更優選22或22以下，還更優選20或20以下，而下限優選至少13，更優選至少16，還更優選至少18。規定序列的最優選堿基數為19。在進行RNAi的目標堿基序列搜索的時候，可以包含也可以不包含突出部。符合規定序列的堿基序列產生RNA干擾的可能性極高，因此，本發明的搜索方法能夠以極高的可能性搜索到產生RNAi的序列，從而使產生RNAi的多核苷酸設計簡化。在又一優選實施例中，規定序列不包含7個或7個以上堿基連續出現的鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的序列。所謂7個或7個以上堿基連續出現鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的序列，包括單獨鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)連續排列，也包括鳥嘌呤(G)和胞嘧啶(C)混合排列的情況，更具體地說，包括GGGGGGG、CCCCCCC以及GCGGCCC等。另外，規定序列的搜索是在堿基數確定以后，利用裝有一種程序的計算機高效檢出，該程序可以搜索與規則(a)至(d)等相符合的部位。更具體的實施方案在下述5.siRNA序列設計程序和7.執行siRNA序列設計程序的堿基序列處理裝置中進行描述。2、產生RNA干擾的多核苷酸的堿基序列設計方法本發明的堿基序列設計方法是根據上述搜索方法搜索得到的堿基序列進行產生RNA干擾的多核苷酸(siRNA)的堿基序列的設計。siRNA主要由RNA組成，但siRNA的實施例也包括含有一部分DNA的siRNA，即混合多核苷酸。本發明的堿基序列設計方法是從目標基因堿基序列搜索到上述符合規則(a)至(d)的堿基序列，然后設計出和上述搜索到的堿基序列同源的堿基序列。在又一優選的設計例中，可以考慮規定序列中不包含7個或7個以上堿基連續出現鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的序列的情況。規則(a)至(d)以及搜索方法與上述關于本發明的搜索方法的描述一致。所謂“同源序列”是指相同的序列以及在不喪失產生RNAi功能的范圍內含有對相同的序列進行諸如缺失、置換、插入等突變的序列。雖因目標基因的種類、序列而異，但允許突變的范圍，以同源性表示的話，優選80％或80％以上、更優選90％或90％以上、還更優選95％或95％以上。在計算允許突變范圍內的同源性時，對采用同一搜索算法計算出的數值組進行比較。搜索的算法不進行具體限定，適合于局部序列搜索的搜索算法均可以，更具體地，優選采用BLAST、ssearch等等。如上所述，雖搜索出來的序列可以進行少量改變，但特別優選設計的堿基序列的堿基數和搜索的序列一致。例如，關于堿基數相同的情況下堿基改變的許可度，設計的堿基序列的堿基優選80％或80％以上、更優選90％或90％以上、特別優選95％或95％以上與搜索的序列一致。例如，設計堿基數為19的堿基序列時，優選16個或16個以上堿基、更優選18個或18個以上堿基與搜索序列一致。而且，在設計與搜索的堿基序列同源的序列時，理想地，搜索到的堿基序列的3’末端堿基和設計的堿基序列的3’末端堿基相同，而且理想地，搜索的堿基序列的5’末端堿基和設計的堿基序列的5’末端堿基相同。通常在siRNA分子中設突出部。所謂突出部是指在雙鏈siRNA分子中的各單鏈的3’末端設置的單鏈狀態的突出部分。突出部的堿基數雖也因生物種類影響，但優選突出部的堿基數為2。突出部的堿基序列雖一般來說可以是任意堿基，但優選采用與搜索的目標基因相同的堿基序列、TT或者UU等。如上所述，通過在設計為和上述搜索到堿基序列同源的規定序列的3’末端設置突出部，設計構成siRNA的正義鏈。可選擇地，也可以通過搜索從最一開始就包含突出部的規定序列來進行設計。突出部的優選堿基數是2。因此，例如，在設計包含堿基數為19的規定序列以及堿基數為2的突出部的單鏈siRNA時，可以從目標基因中搜索出包含突出部的siRNA的堿基數為21的序列。而且，搜索雙鏈時，也可以搜索堿基數為23的序列。本發明的堿基序列設計方法如上所述，是從所需的目標基因中搜索給定的序列，但產生RNA干擾的對象也可與目標基因的來源不一致。也可以適用于親緣關系相近的物種。例如，以第1種生物上分離的基因作為目標基因，也可以用于屬于第1種生物近緣種的第2種生物的siRNA的設計。進一步，例如通過搜索兩種或多種哺乳類動物的共有序列，并從這個共同序列中搜索上述規定序列來進行設計，可以設計能夠在廣泛適用于哺乳類的siRNA。這樣設計的原因是考慮到在兩種或多種哺乳類中的共有序列在其它哺乳類動物存在的可能性是很高的。為了對與目標基因無關的基因不產生RNA干擾，優選地，還要搜索一下與設計的序列相同或類似序列是否包含在其它的基因中。與設計的序列相同或類似序列的搜索可采用能夠進行一般同源性搜索的軟件進行。通過排除這樣的相同或類似序列，能夠設計出僅對目標基因特異性地產生RNA干擾的序列。根據本發明的設計方法，可以容易地、高幾率地設計產生RNA干擾的RNA分子，盡管RNA的合成仍然需要花費勞動、時間和費用，但本發明的設計方法可以使他們最小化。3、雙鏈多核苷酸的制備方法本發明的雙鏈多核苷酸的制備方法是高幾率產生RNA干擾的雙鏈多核苷酸的制備方法。本發明的雙鏈多核苷酸的堿基序列遵從上述本發明的堿基序列設計方法進行設計，然后合成符合上述序列設計的雙鏈多核苷酸。序列設計的優選實施方案與上述關于堿基序列設計方法相同。合成雙鏈多核苷酸產生RNA干擾，且已知siRNA就屬于這種雙鏈多核苷酸。另外，本發明的制備方法制備的雙鏈多核苷酸優選由RNA構成，也可由含有部分DNA的混合多核苷酸構成。本說明書中，含有部分DNA的雙鏈多核苷酸也被納入siRNA的概念范疇。而且，根據本發明者的研究，siRNA在構造和功能上具有非對稱性傾向，從產生RNA干擾的目的出發的話，正義鏈的5’末端側的一半和反義鏈3’末端側的一半最好由RNA構成。在雙鏈多核苷酸中，一條鏈通過在與規定序列相同的堿基序列的3’末端設一突出部而形成，所述規定序列包含在目標基因的堿基序列中且符合規則(a)至(d)，另一條鏈則通過在與上述規定序列相同的堿基序列的互補序列的3’末端設一突出部而形成，各鏈的堿基數(包含突出部)為18-24，更優選為20-22，特別優選為21。而且，突出部的堿基數優選為2。全部堿基數為21、其中突出部的堿基數為2的siRNA適用于高幾率地產生RNA干擾的同時(甚至在哺乳類中也)不會產生細胞毒性。RNA的合成可以通過化學合成法合成，也可以通過標準的生物技術合成。在一種技術中，制備具有預定序列的DNA鏈，以產生的DNA鏈為模板在轉錄酶的作用下合成RNA單鏈，合成的單鏈RNA再形成雙鏈RNA。另外，關于分子生物學的基本技術有很多標準的試驗指南，如分子生物學基本方法(1986)；Sambrook等編著的分子克隆試驗手冊，第2版，冷泉港實驗室出版社，冷泉港，紐約(1989)；細胞工程學手冊，黑木登志夫等編著，羊土社(1992)；細胞工程學新手冊，Muramatsu等編著，羊土社(1992)；等等。作為上述本發明的制備方法得到的多核苷酸的一個優選實施方案是用如下方法產生的雙鏈多核苷酸，所述方法是從RNA干擾的目標基因的堿基序列中搜索符合規則(a)至(d)的含有13-28個堿基的序列部位，一條鏈通過在與符合規則(a)至(d)的上述規定序列相同的堿基序列的3’末端設突出部而形成，另一條鏈通過在與上述規定序列相同的堿基序列的互補序列的3’末端設突出部而形成，合成各鏈的堿基數為15-30。得到的多核苷酸為能夠高幾率地產生RNA干擾的多核苷酸。而且，也可以制備表達siRNA的表達載體，通過一種能夠表達含有規定序列的序列的表達載體，在能夠進行表達的非細胞系或細胞系條件下，采用表達載體提供預定的siRNA。以前，siRNA的常規設計依賴于試驗者的經驗或直覺，存在重復試驗和試驗錯誤的情況較多。但是，根據本發明的雙鏈多核苷酸的制備方法，能夠高幾率地制備產生RNA干擾的雙鏈多核苷酸。根據上述本發明的搜索方法、序列設計方法和多核苷酸制備方法，夠夠大幅降低用于RNA干擾的各種試驗、制作等中需要的勞動、時間和成本。也即，本發明能夠大幅簡化將RNA干擾用于解析基因、為新藥開發探索靶標、開發新藥、基因治療、研究生物種間差異時的試驗、研究、開發、制造等等，從而提高了效率。4、抑制基因表達方法本發明的抑制基因表達方法包含搜索預定堿基序列的步驟、根據搜索的堿基序列設計合成siRNA堿基序列的步驟、以及將得到的siRNA導入含有目標基因的表達系統的步驟。搜索預定堿基序列的步驟遵從上述RNA干擾的目標堿基序列搜索方法。優選的實施方案與上述一致。而且，根據搜索得到的堿基序列的siRNA堿基序列的設計合成步驟遵從上述產生RNA干擾的多核苷酸堿基序列設計方法、雙鏈多核苷酸的制備方法進行。優選的實施方案也與上述一致。得到的雙鏈多核苷酸添加于目標基因的表達系統中抑制目標基因的表達。所謂目標基因的表達系統即目標基因表達體系，更具體地說，是指由一個至少能形成目標序列的mRNA的反應體系提供的系統，目標基因的表達系統的實施例既包含體外(invitro)系統也包含體內(invivo)系統。作為目標基因的表達系統，除了細胞培養、組織培養、生物活體以外，也包括采用無細胞系。意圖抑制其表達的目標基因(抑制目標基因)也不需要與搜索序列源自同一物種，但如果搜索對象基因和抑制對象基因之間的親緣關系越近，對特定基因的抑制就越具有特異性和高效性。所謂導入表達系統，即進入目標基因的表達反應系統中。具體舉例說，在一種方法中，可以將雙鏈多核苷酸轉染具有目標基因的培養細胞，并進入細胞內，在另一種方法中，制備具有包含規定序列及突出部的堿基序列的表達載體，再將該表達載體導入具有目標基因的細胞內。根據本發明的抑制基因表達方法，由于可以產生引起RNA干擾的多核苷酸，所以可以高效、簡便地對基因進行抑制。5、siRNA序列設計程序以下，通過siRNA序列設計程序的實施方案進行說明5.1程序概述本程序在對還未進行基因組測序的物種例如馬、豬等進行RNA干擾時，以已經公開的人、鼠的同源序列信息為基礎計算在目標物種中能夠使用的siRNA序列。如果利用本程序進行siRNA序列設計，能夠不需對目標基因測序而迅速進行RNA干擾。siRNA設計(計算)時，考慮G-C分配規律(即上述規則(a)至(d))高幾率選擇具有RNAi活性的序列的同時，為了對于無關基因不產生RNA干擾，通過同源性搜索檢查核對。在本說明書中，有時將G或者C標記為“G/C”，A或者T標記為“A/T”，而且“A/T(U)”中的“T(U)”表示在脫氧核糖核酸序列的情況下為胸腺嘧啶T，在核糖核酸序列的情況下為尿嘧啶U。5.2siRNA設計的方針假設已知人的基因X以及鼠的同源基因X，本程序讀取那些序列，并從編碼區(CDS)部分搜索23個或23個以上堿基的完全共同序列，通過從這個共同部分設計siRNA，那個siRNA能夠將人和鼠的基因X同時作為靶標。(圖1)考慮到人和小鼠完全共同的序列部分在其它哺乳類中也出現的概率很高，上述的siRNA不止對人和鼠的基因X，對其它的哺乳類的基因X也可能具有功能。即，即使在目標基因的序列未知的物種中，只要對應的人和鼠的同源基因序列已知，就可以利用本程序設計siRNA。另外，在哺乳類動物中，已經探明，實際功能性的siRNA具有規律性(圖2)。本程序僅篩選符合此規律的序列。圖2顯示了具有RNA干擾效果的siRNA序列的規律性(siRNA的G/C分布規律)。圖2中的siRNA具有21堿基的雙鏈RNA鏈分別在3’一側具有2個堿基的突出部，5’一側的19個堿基間形成堿基對，可以看出，形成堿基對的19個堿基中編碼側的序列必須滿足下列條件1)3’末端為A/U，2)5’末端為G/C，3)3’一側的7個堿基A/U比例較高。特別是1)及2)的條件非常重要。5.3程序構造本程序由三個部分構成，即5.3.1搜索人與小鼠具有共同位點的共同序列的部分，5.3.2根據GC分布規律對序列進行評分的部分，5.3.3通過同源搜索檢查是否靶向無關基因的部分5.3.1搜索共同序列部分讀取多個堿基序列文件(file1，file2，file3，……)，在全部序列文件中找出共同出現的23個字符的全部堿基序列。(計算例)將文件1為人基因FBP1(NM_000507人果糖1，6-二磷酸酶1)，文件2為鼠Fbp1基因(NM_019395鼠果糖二磷酸酶1)的序列輸入程序，其結果，從兩者的序列(圖3)找到了15個兩者共同具有的23堿基序列(人FBP1和鼠Fbp1的共同序列)(圖4)。5.3.2對序列進行評分部分為了僅篩選出適合于前述G/C分布規律的序列，對23堿基序列進行評分(方法)對于23堿基序列進行按以下方式評分評分1從開始第21個堿基是否是A/U？[否為0，是為1]評分2從開始第3個堿基是否是G/C？[否為0，是為1]評分3從開始第15個堿基至第21個堿基的7個堿基的字符為A/U的數總評分評分1-3的積。積為3或3以下計為0。(計算例)對第4圖所示的15個序列進行計算的結果如第5圖所示，第5圖為對人FBP1和鼠Fbp1的共同序列進行評分的圖。在第5圖的序列后面，按順序記載的是評分1、評分2、評分3和總評分。5.3.3檢查是否將無關基因作為靶標部分為了防止設計的siRNA與和目標基因無關的基因發生作用，對已經公開的人與小鼠所有的mRNA進行同源性搜索，并評價無關基因的一致程度，同源性搜索可以使用各種可能的算法，這里舉例說比如可以使用BLAST。另外，使用BLAST時，考慮到搜索序列為23個堿基比較短，最好把字長(WordSize)盡量減小。BLAST搜索后，除目標基因以外，對BLAST的結果中命中的E值為10.0或10.0以下的結果求E值倒數的總和(以下稱此值為同源性評分)。即同源性評分(X)由下式求得X=Σallhits1E]]>注意命中結果的E值越低，表示和查詢的23個堿基字符的同源性就越高，成為siRNA的靶標的危險性就越高。而且，命中結果越多，將更多的無關基因成為靶標的幾率就越高。考慮到這樣2點，采用上式評價siRNA靶向與目標基因無關的基因的危險性。(計算例)對于每個具有23個堿基的序列，進行上述同源性搜索和同源性評分的結果(如圖6、圖7所示)，在圖6中，對人FBP1和鼠Fbp1的共同序列“caccctgacccgcttcgtcatgg”進行BLAST搜索的結果，最初的兩行是鼠FBP1和人FBP1中都命中的結果，同源性評分為5.9，是一個命中結果較少的例子。這個序列的siRNA將其它基因作為靶標的危險性很低。此外，圖7中，顯示了對人FBP1和鼠Fbp1的共同序列“gccttctgagaaggatgctctgc”進行BLAST搜索的結果，命中結果較多，同源性評分為170.8，將其它基因作為靶標的危險性很高，不適合于作為siRNA。實際上，上述5.3.1、5.3.2、5.3.3的部分可整合為一體，輸入第3圖所示的人與鼠的序列，直接得到第8圖所示的輸出結果。這里，在第8圖所示的序列后，順次記載的是評分1、評分2、評分3、總評分以及將同源性評分放大10倍的值。另外，為了縮短處理時間，程序可設計為，當總評分為0時，不計算同源性評分，結果為，片段“36caccctgacccgcttcgtcatgg”顯然可以用作siRNA。另外，5.3.1、5.3.2和5.3.3其中的一個部分也可以單獨利用。5.4實際計算對應于人與小鼠間的同源染色體上的約6400個基因對，使用本程序實際進行了siRNA的設計，其結果為，其中約7成具有人和鼠的共同序列，而且滿足有效siRNA的序列規律性的規律，能夠進行不將無關基因作為靶標的siRNA的設計。這些siRNA不僅在人和小鼠中，也在范圍寬泛的哺乳動物中也有望可以高效地抑制靶標基因，相信在家畜、寵物等上的利用的產業價值很高。而且，利用本程序，也可以對同種生物內具有兩個或兩個以上基因的情況，如eIF2C1和eIF2C2同時作為靶標的siRNA進行設計，因此，本程序提供的siRNA的設計方法，應用范圍很廣，功能強大。在進一步的應用中，如果用人和小鼠共同的序列部分設計PCR引物，可以在范圍寬泛的哺乳動物中對目標基因進行擴增。另外，執行siRNA序列設計程序的堿基序列處理裝置的實施方案，將在下述執行siRNA序列設計程序的堿基序列處理裝置等一欄里描述。6、siRNA序列設計的商務模型系統在本發明的siRNA序列設計商務模型系統中，當應用siRNA序列設計程序時，系統單獨或組合參考基因組數據庫、EST數據庫、進化系統樹數據庫，根據本程序的邏輯，對客戶提供對應于基因序列信息的可用狀態的有效的siRNA。術語“可用狀態”(availability)是指信息能夠利用的狀態。(1)基因組信息雖然可用，但確定ORF比較困難，以EST信息等為基礎抽選出對于假設的外顯子位點有效的siRNA候選序列，并顯示考慮剪切變體的siRNA序列和其評價結果。(2)基因序列、基因名稱確定的情況下，輸入基因序列或基因名稱后，即可搜索出有效的siRNA的候選序列，顯示其siRNA序列和其評價結果。(3)基因組信息不可用的情況下，采用保持同種基因功能的近緣生物種(同屬或具有同樣的起源)的基因序列或者進化系統樹中距離短且其基因組序列可用的2種或2種以上的生物種的基因序列，搜索出siRNA的候選序列，顯示其siRNA序列和其評價結果。(4)為了解析與侵染性病害相關的基因的功能、探索用于新藥開發的靶標，組合利用微生物基因組數據庫、進化系統樹數據庫及微生物的細胞凋亡誘導部位信息、功能表達部位信息，全面地求得siRNA候補序列的技術是比較有效的。7、執行siRNA序列設計程序的堿基序列處理裝置等以下，結合附圖詳細說明執行上述siRNA序列設計程序的裝置、本發明的堿基序列處理裝置、在計算機上執行堿基序列處理方法的程序、記錄介質以及堿基序列處理系統的實施方案。但是，易于理解這些實施方案不構成對本發明的限定。本發明概述以下概略說明本發明，然后，詳細說明本發明的組成及處理等。圖12是本發明的基本原理圖。概括地說，本發明具有以下基本特征。即本發明取得RNA干擾的目標基因的堿基序列信息，制作出相應于在堿基序列信息中具有預定堿基數的序列部位的部分堿基序列信息(步驟S-1)。這里，在步驟S-1中，也可以由堿基序列信息中目標基因的編碼區或轉錄區的相應位置制作出預定堿基數的部分堿基序列信息；也可以由來源于不同生物的多個堿基序列信息(例如人的堿基序列信息和小鼠的堿基序列信息等)間共同的序列制作出預定堿基數的部分堿基序列信息；也可以由同種生物中類似的多個堿基序列間共同的序列制作出預定堿基數的部分堿基序列信息；也可以由來源于不同生物的多個堿基序列信息的目標基因的編碼區或轉錄區的相應位置制作出預定堿基數的部分堿基序列信息；也可以由同種生物中類似的多個堿基序列信息的目標基因的編碼區或轉錄區的相應位置制作出預定堿基數的部分堿基序列信息。由此能夠高效地篩選出對目標基因特異性地產生RNA干擾的規定序列，減輕計算負荷。進一步，在步驟S-1中，可以制作含有突出部的部分堿基序列。具體地說，例如可以通過添加表示含有突出部的突出部含有信息制成部分堿基序列信息。即，也可把部分堿基序列信息和突出部含有信息相互連接在一起，這樣，就可以從設計的最初就篩選出包含突出部的規定序列。另外，上述預定堿基數的上限在不含突出部的情況下，優選為28或28以下，更優選為22或22以下，還更優選為20或20以下，含有突出部時，優選為32或32以下，更優選為26或26以下，還更優選為24或24以下。預定的堿基數的下限在不含突出部的情況下，優選為至少13，更優選至少16，還更優選至少18，含有突出部時，優選至少17，更優選至少20，還更優選至少22。因此，預定堿基數的最優選在不含突出部的情況下為19，含突出部時為23。這樣，可以高效篩選出產生RNA干擾的規定序列的同時(甚至在哺乳動物中)不產生細胞毒性。接下來，判定在步驟S-1制成的部分堿基序列信息的3’末端的堿基是否是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)(步驟S-2)。具體地說，例如可以在3’末端的堿基是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)的時候輸出1、不是的時候輸出0的判定結果。接下來，判定在步驟S-1制成的部分堿基序列信息的5’末端的堿基是否是鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)(步驟S-3)。具體地說，例如可以在5’末端的堿基是鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的時候輸出1、不是的時候輸出0的判定結果。接下來，判定在步驟S-1制成的部分堿基序列信息的3’末端的包含7堿基的堿基序列信息是否是富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基(步驟S-4)。具體地說，例如可以在3’末端的7堿基是富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基的時候輸出1、不是的時候輸出0的判定結果。步驟S-4的判定規則規定在步驟S-1制成的部分堿基序列信息的3’末端的附近的堿基序列信息富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，作為具體搜索的一個指標，規定是指包含3’末端7堿基的堿基序列信息是否富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基。這里，在步驟S-4中，“富含堿基序列信息”是指在上述“1RNA干擾的目標基因搜索方法”中記載的“富含序列”。具體地說，例如在步驟S-1制成的部分堿基序列信息為19個堿基時，包含該部分堿基序列信息7堿基的堿基序列信息中優選為至少3個堿基，更優選至少4個堿基，特別優選至少5個堿基為由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基。從步驟S-2至步驟S-4，判定含有突出部的部分堿基序列信息的時候，將從部分堿基序列信息中除去突出部后的序列部位作為判定對象。接下來，根據步驟S-2、S-3、S-4的判定結果，由步驟S-1制成的部分堿基序列信息中篩選特異性地產生RNA干擾的規定序列信息(步驟S-5)。具體地說，例如，步驟S-2判定3’末端的堿基是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)，在步驟S-3判定5’末端的堿基是鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)，在步驟S-4判定包含3’末端7堿基的堿基序列信息是否是富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，將判定符合上述的部分堿基序列信息作為規定序列信息進行篩選。這里，具體地說，例如計算出步驟S-2、S-3、S-4輸出的數值的積，根據該積的值，從步驟S-1制成的部分堿基序列信息中篩選規定序列信息。這樣，在哺乳動物等中可以高效而容易地制作出產生RNA干擾的概率極高也即有效產生RNA干擾的siRNA序列。這里，可以在步驟S-5篩選出的規定序列信息的至少一個末端添加突出部。另外，例如，也可以在搜索靶標一側時在規定序列信息的2個末端都添加突出部。這樣，可以簡化產生RNA干擾的多核苷酸的設計。另外，上述突出部的堿基數如在上述“2產生RNA干擾的多核苷酸的堿基序列設計方法”所述的堿基數，具體地說，例如為2非常適合。而且，可以從其它堿基序列信息(例如公共數據庫中已經公開的堿基序列信息，諸如NCBI的RefSeq(ReferenceSequenceProject))中，通過采用已知的諸如BLAST、FASTA、ssearch等同源性搜索方法，搜索到與步驟S-5篩選出的規定序列信息相同或近似的堿基序列信息，并根據搜索到的相同或類似的堿基序列信息，評價規定序列靶向無關基因的可能性。具體地說，例如可以從其它堿基序列信息(例如公共數據庫中已經公開的堿基序列信息，諸如NCBI的RefSeq(ReferenceSequenceProject))中，通過采用已知的諸如BLAST、FASTA、ssearch等同源性搜索方法，搜索到與步驟S-5篩選出的規定序列信息相同或近似的堿基序列信息，根據搜索到的相同或類似堿基序列信息中的和目標基因無關的基因的堿基序列信息的總數，以及與目標基因無關的基因的堿基序列信息所附帶的相同或類似程度的數值(例如BLAST、FASTA、ssearch中的E值)，計算出表示相同或類似程度的數值的倒數的總和，根據算出的總和(例如根據算出的總和的大小)，評價規定序列信息是否可能靶向與目標基因無關的基因。這樣，可以從規定序列信息中篩選出僅對目標基因特異性地產生RNA干擾的序列。以上，根據本發明篩選出的對與目標基因無關的基因不產生RNA干擾的規定序列信息進行RNA合成，與常規技術相比，可以大幅度減低所需的勞動、時間和費用。首先說明本系統的構成。第13圖是適用于本發明的本系統的一個構成例的框圖。在該構成例中僅將與本發明相關的部分概念性地表示出。概括地說，本系統由處理RNA干擾的目標基因的堿基序列信息的堿基序列處理裝置100以及提供關于序列信息和構造信息等的外部數據庫以及諸如同源性搜索的外部程序的外部系統200，通過網絡300，以可通訊的方式連接構成。在第13圖，網絡300具有使堿基序列處理裝置100和外部系統200相互連接的功能，例如可以為因特網。在第13圖，外部系統200通過網絡300與堿基序列處理裝置100相連接，具有為利用者提供關于序列信息和構造信息等的外部數據庫，以及執行外部程序諸如同源性搜索和基序檢索的網址的功能。這里，外部程序200也可以由WEB服務器或ASP服務器等構成，其硬件構成可以包括市場上有售的諸如工作站、個人電腦等的信息處理裝置以及其附屬裝置。而且，外部系統200的各個功能通過外部系統200的硬件構成中的CPU、硬盤、存貯裝置、輸入裝置、輸出裝置、通信控制裝置等以及控制這些裝置的程序來實現。在第13圖中，堿基序列處理裝置100概括地說，由整體控制堿基序列處理裝置100的諸如CPU等的控制部102；通信控制界面部104，其與和連接通信線路相連的通信裝置，諸如路由器(router)相連(圖中未示出)的；輸入輸出控制界面部108，其與輸入裝置112、輸出裝置114連接、以及容納各種數據庫和桌面(table)的記憶部(存儲部)106構成。上述各部通過通信電路形成可通信的連接，進一步，堿基序列處理裝置100通過路由器等通信裝置以及有線或無線通信回路以能夠通訊的方式與網絡300連接。記憶部106容納的各種數據庫、桌面(目的基因堿基序列文件106a～目的基因注釋數據庫106h)是采用固定硬盤裝置等的存儲裝置，容納各處理中使用的各種程序、桌面、文件、數據庫、網頁用文件等。這個記憶部106的各構成要素中，目標基因堿基序列文件106a是容納RNA干擾的目標基因的堿基序列信息的目標基因堿基序列容納方法，第14圖就是容納于目標基因堿基序列文件106a的信息的一個示例。如第14圖所示，目標基因堿基序列文件106a所容納的信息由專一識別RNA干擾的目標基因的堿基序列信息的堿基序列識別信息(例如第14圖的NM-000507)和堿基序列信息(如第14圖的ATGGCTGA...AGTGA)相互關聯構成。部分堿基序列文件106b是容納部分堿基序列信息的裝置，所述部分堿基序列即具有RNA干擾目標基因的堿基序列信息中預定數目的堿基的序列片段。第15圖即是部分堿基序列文件106b容納信息的一個示例。如第15圖所示，部分堿基序列文件106b容納的信息由專一識別部分堿基序列信息的部分堿基序列識別信息(例如第15圖的NM-00050736)、部分堿基序列信息(如第15圖的caccct...tcattg)和表示含有突出端的突出端部位含有信息(例如第15圖的“含有”)相互關聯構成。判定結果文件106c是容納后述3’末端堿基判定部102b、5’末端堿基判定部102c、預定堿基含有判定部102d的判定結果的容納方法。第16圖即顯示容納在判定結果文件106c中的信息的一個示例。如第16圖所示，判定結果文件106c容納的信息由部分堿基序列識別信息(例如第16圖的NM-00050736)、3’末端堿基判定部102b判定的3’末端的堿基判定結果(例如第16圖中的“1”)、5’末端堿基判定部102c判定的的5’末端的堿基判定結果(例如第16圖中的“1”)、預定堿基含有判定部102d判定的預定堿基含有判定結果(例如第16圖“4”)、以及將3’末端堿基判定部102b、5’末端堿基判定部102c、預定堿基含有判定部102d的綜合在一起的判定結果(例如第16圖的“4”)相互關聯構成。另外，在第16圖中，3’末端的堿基判定結果和5’末端的堿基判定結果在由3’末端堿基判定部102b、5’末端堿基判定部102c判定為“含有”時設定為“1”，“不含有”設定為“0”。而且，在第16圖中，預定堿基含有判定結果被設定為由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1種或1種以上堿基的數目，其中所述堿基包含在含有位于部分堿基序列信息3’末端的7堿基的堿基序列信息中。將綜合判定結果設定為3’末端的堿基判定結果、5’末端的堿基判定結果、預定堿基含有判定結果的積，具體說，例如該積為3以下時設定為0。規定序列文件106是規定序列容納裝置，其容納能夠對目標基因特異產生RNA干擾的部分堿基序列的規定序列信息。第17圖即規定序列文件106d所容納的信息的一個示例。如第17圖所示，規定序列文件106d容納的信息由部分堿基序列識別信息(例如第17圖的NM-00050736)、能夠對目標基因特異性產生RNA干擾的部分堿基序列的規定序列信息(例如第17圖“caccc...tcattg”)相互關聯構成。為了通過后述的相同或類似堿基序列搜索部102g搜索與規定序列相同或類似的堿基序列信息，參照序列數據庫106e是容納用于參照的堿基序列信息的參照堿基序列信息的數據庫。參照序列數據庫106e也可經由因特網進入外部堿基序列數據庫，拷貝這些數據庫，存納為原始序列信息，更可以進一步加入獨特的注釋信息而制成內部數據庫(inhousedatabase)。第18圖即為參照序列數據庫106e所容納信息的一個示例。如第18圖所示，參照序列數據庫106e容納的信息由參照序列識別信息(例如第18圖的“ref|NM_015820.1|”)和參照堿基序列信息(例如第18圖的“caccct...gcatgg”)相互連接構成。相同類似度文件106f是容納后述用相同或類似堿基序列搜索部102g搜索相同或類似堿基序列信息所得相同或類似程度值的相同類似度容納方法。第19圖即為相同類似度文件106f容納信息的一個示例。如第19圖所示，相同類似度文件106f中容納的信息由部分堿基序列識別信息(例如第19圖的NM-00050736)、參照序列識別信息(例如第19圖的ref|NM_015820.1|以及ref|NM_003837.1|)和相同類似度(例如第19圖的0.52)相互連接構成。評價結果文件106g是容納在后述無關基因靶標評價表部評價是否將與目標基因無關的基因作為靶標的結果評價結果容納方法。第20圖即為容納在評價結果文件106g的容納信息的一個示例。如第20圖所示，容納在評價結果文件106g的容納信息由部分堿基序列識別信息(例如第20圖的NM-00050736以及NM-000507441)、后述總和計算部102m計算出的總和(例如第20圖的5.9以及170.8)、評價結果(例如第20圖的“非靶標”和“靶標”)相互連接構成。在第20圖中，“非靶標”意指規定序列信息不將與目標基因無關的基因作為靶標，“靶標”意指規定序列信息將與目標基因無關的基因作為靶標。目標基因注釋數據庫106h是容納有關目標基因的注釋信息的目標基因注釋容納方法，目標基因注釋數據庫106h是可經由因特網進入的、容納相關基因的注釋信息的外部注釋數據庫，或者是通過將這些數據庫拷貝下來，容納原始序列信息，進一步向該數據庫添加獨特的注釋信息而作成的內部數據庫(inhousedatabase)。目標基因注釋數據庫106h容納的信息由識別目標基因的目標基因識別信息(例如目標基因的基因名稱、登錄號(accession)等(如第3圖最上部記載的NM-000507、FBP1))和有關目標基因的簡略信息(例如第3圖最上部記載的“人果糖二磷酸酶1，6-二磷酸酶1)相互連接而成。在第13圖，控制通信的界面部104進行堿基序列處理裝置100和網絡300(或者路由器等通信裝置)間的通信控制，即控制通信的界面部104通過通信線路與其它末端交流數據。在第13圖中，輸入輸出控制界面部108進行輸入裝置112或輸出裝置114的控制，這里，輸出裝置114處理能夠采用監視器(monitor，包含家用電視)外，還可以使用話筒(以下有時將輸出裝置114記為監視器)，輸入裝置112可采用包括鍵盤、鼠標、以及麥克風等。另外，監視器和鼠標協同可以實施指示裝置功能。在第13圖中，控制部102具有容納OS(OperatingSystem)等的控制程序、規定各種處理順序的程序、以及所需數據的內部存儲器，由這些程序進行執行各種處理的信息處理。控制部102在功能上包括部分堿基序列制作部102a、3’末端堿基判定部102b、5’末端堿基判定部102c、預定堿基含有判定部102d、規定序列篩選部102e、突出端添加部102f、相同或類似堿基搜索部102g以及無關基因靶標評價部102h。其中，部分堿基序列制成部102a是部分堿基序列制作手段，用于獲得RNA干擾的目標基因的堿基序列信息，并產生具有堿基序列信息中預定數目堿基的序列片段的部分堿基序列信息。如圖21所示，部分堿基序列制成部102a包括區域指定堿基序列制成部102i，共堿基序列制成部102j，以及突出部分含有堿基序列制成部102k。第21圖是適用于本發明系統的部分堿基序列制成部102a的構成例的框圖。在該構成例中僅概念性地示出本發明的相關部分。在第21圖中，區域指定堿基序列制成部102i是區域指定堿基序列制作方法，其用于從對應于堿基序列信息中的目標基因編碼區或轉錄區的位置產生具有預定數目堿基的部分堿基序列信息。共同堿基序列制成部102j是一種制作來源于不同生物的多個堿基序列信息間共同的、預定數目堿基的部分堿基序列信息的共同堿基序列制作方法。突出端含有堿基序列制作部102k是一種制作含有突出端的部分堿基序列信息的突出端含有堿基序列制作方法。再回到第13圖，3’末端堿基判定部102b是判定部分堿基序列信息的3’末端是否是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)的3’末端的堿基判定方法。5’末端堿基判定部102c是判定部分堿基序列信息的5’末端是否是鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的5’末端堿基判定方法。預定堿基含有判定部102d是判定包含部分堿基序列信息的3’末端的7堿基的堿基序列信息是否是富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1種或1種以上的堿基的預定堿基含有判定方法。規定序列篩選部102e是根據3’末端堿基判定部102b、5’末端堿基判定部102c、預定堿基含有判定部102d的判定結果，從部分堿基序列信息中篩選特異地對目標基因產生RNA干擾的規定序列信息的規定序列信息篩選方法。突出端添加102f是一種在規定序列信息的至少一個末端添加突出端的突出端添加方法。相同類似堿基序列搜索部102g是一種從其它堿基序列信息搜索與規定序列信息相同或類似的堿基序列信息的相同類似堿基序列搜索方法。無關基因靶標評價部102h是一種根據相同或類似的堿基序列信息評價規定序列信息是否將無關基因作為靶標的無關基因靶標評價方法。這里，如第22圖所示，無關基因靶標評價部102h進一步包括總和算出部102m以及總和基準評價部102n。第22圖是適用于本發明的本系統的無關基因靶標評價部102h的構成例的框圖。在該構成例中僅概念性地示出本發明的相關部分。在第22圖中，總和算出部102m是一種總和算出方法，其根據相同或類似堿基序列信息中與目標基因無關的基因的堿基序列信息的總數，以及與目標基因無關的基因的堿基序列信息所附帶的相同或類似程度的數值，計算出表示相同或類似程度的數值的倒數的總和。總和基準評價部102n是一種根據總和算出部102m計算出的總和評價規定序列信息是否可能將無關基因作為靶標的總和基準靶標評價方法。通過上述各部進行處理的詳細情形在后述部分會詳細說明。接下來，參照第23圖以及第24圖詳細說明對具有本實施形式中所述構成的系統的處理的一個示例。首先，參照第23圖詳細說明主處理。第23圖為表示對本實施形式中的系統的主處理的流程圖。首先，堿基序列處理裝置100通過部分堿基序列制成部102a進行部分堿基序列制成處理，取得RNA干擾的目標基因的堿基序列信息，存放在目標基因堿基序列文件106a所確定的記憶區域，制成對應具有堿基序列信息中的預定數目堿基的序列片段的部分堿基序列信息，將作成的部分堿基序列信息存放在部分堿基序列文件106b所確定的記憶區域。(步驟S-1)。這里，在步驟SA-1中，部分堿基序列制成部102a通過區域指定序列制成部102i的處理，由來自堿基序列信息的目標基因編碼區或轉錄區的相應序列部位制成具有預定數目的部分堿基序列信息，將制得的部分堿基序列信息存放于部分堿基序列文件106b所確定的記憶區。在步驟SA-1中，部分堿基序列制成部102a通過共同堿基序列制成部102i的處理，由來源于不同生物的多個堿基序列信息(例如人的堿基序列信息和小鼠的堿基序列信息)中的共同序列制成具有預定堿基數的部分堿基序列信息，將制得的部位堿基序列信息存放于部分堿基序列文件106b所確定的記憶區。另外，也可以制得具有同種生物內多個類似的堿基序列信息所共有的、預定數目堿基的共同部分堿基序列信息。在步驟SA-1中，部分堿基序列制成部102a通過區域指定堿基序列制成部102i以及共同堿基序列制成部102j的處理，由來源于不同生物的多個堿基序列信息的目標基因的編碼區或轉錄區的相應部位制成具有預定堿基數的部分堿基序列信息，將制得的部分堿基序列信息存放于部分堿基序列文件106b所確定的記憶區。另外，也可以由同種生物內多個類似的堿基序列信息的目標基因的編碼區或轉錄區的位置制成具有預定堿基數的部分堿基序列信息。在步驟SA-1中，部分堿基序列制成部102a通過含有突出端堿基序列制成部102k的處理制得含有突出端的部分堿基序列信息。具體地說，例如部分堿基序列制成部102a通過含有突出端堿基序列制成部102k的處理，制成表示含有突出端的含有突出端信息的添加部分堿基序列信息，將制得的部分堿基序列信息和含有突出端信息相互關聯地存放于部分堿基序列文件106b所確定的記憶區。上述預定堿基數的上限在不含突出端的情況下，最好為28或28以下，更優選22或22以下，更優選20或20以下，含有突出端時，優選32或32以下，更優選26或26以下，更優選24或24以下。預定的堿基數的下限在不含突出端的情況下，最好為13或13以上，更優選16或16以上，更優選18或18以上，含有突出端時，優選17或17以上，更優選20或20以上，更優選22或22以上。因此，最優選預定堿基數在不含突出端的情況下為19，含突出端時為23。接下來，堿基序列處理裝置100通過3’末端堿基判定部102b判定在步驟SA-1制成的部分堿基序列信息的3’末端的堿基是否是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)，將判定的結果存放于判定結果文件106c所確定的記憶區(步驟SA-2)。具體地說，例如可以堿基序列處理裝置100通過3’末端堿基判定部102b的處理，在判定步驟SA-1制得的部分堿基序列信息的3’末端的堿基是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)的時候輸出1、而不是所述情況的時候輸出0的判定結果存放于判定結果文件106c所確定的記憶區。接下來，堿基序列處理裝置100通過5’末端堿基判定部102c判定在步驟SA-1制成的部分堿基序列信息的5’末端堿基是否是鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)，將判定的結果存放于判定結果文件106c所確定的記憶區(步驟SA-3)。具體地說，例如可以堿基序列處理裝置100通過5’末端堿基判定部102c的處理，在判定步驟SA-1制得的部分堿基序列信息的5’末端堿基是鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的時候輸出1、而不是所述情況的時候輸出0的判定結果存放于判定結果文件106c所確定的記憶區。接下來，堿基序列處理裝置100通過預定堿基含有判定部102d判定在步驟SA-1制成的部分堿基序列信息的3’末端7堿基組成的堿基序列信息是否是富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1種或1種以上的堿基，將判定的結果存放于判定結果文件106c所確定的記憶區(步驟SA-4)。具體地說，例如可以堿基序列處理裝置100通過預定堿基含有判定部102d的處理，將判定步驟SA-1制得的部分堿基序列信息的3’末端的7堿基組成的堿基序列信息富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1種或1種以上的堿基的時候輸出1、而不是所述情況的時候輸出0的判定結果存放于判定結果文件106c所確定的記憶區。步驟SA-4的判定規則規定在步驟SA-1制成的部分堿基序列信息的3’末端的附近的堿基序列信息富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1種或1種以上的堿基，更具體地作為檢索(搜索)的一個指標，規定是指3’末端的7堿基組成的堿基序列信息富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1種或1種以上的堿基。這里，在步驟SA-4中，“富含的堿基序列信息”是指在上述欄<1>RNA干擾的目標基因搜索方法中記載的“富含序列”。具體地說，例如在步驟SA-1制成的部分堿基序列信息包含19個堿基時，包含7堿基的所述部分堿基序列信息的堿基序列信息中由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1種或1種以上的堿基最好為至少3或3堿基以上，更優選4或4堿基以上，具體優選5或5堿基以上。從步驟SA-2至步驟SA-4，判定含有突出端的部分堿基序列信息的時候，要以除去部分堿基序列信息中的突出端后的序列部分作為判定對象。接下來，堿基序列處理裝置100通過規定序列篩選部102e的處理，根據步驟SA-2、SA-3、SA-4的判定結果，由步驟SA-1制成的部分堿基序列信息中篩選特異產生RNA干擾的規定序列信息，存放于規定序列文件106d所確定的記憶區(步驟SA-5)。具體地說，例如，堿基序列處理裝置100通過規定序列篩選部102e的處理，將判定符合下述的部分堿基序列信息作為規定序列信息進行篩選，其中在步驟SA-2中判定3’末端的堿基是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)，在步驟SA-3中判定5’末端的堿基是鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)，在步驟SA-4中判定3’末端的含7堿基的堿基序列信息富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1種或1種以上的堿基，存放于規定序列文件106d所確定的記憶區。這里，具體地說，例如堿基序列處理裝置100通過規定序列篩選部102e的處理，計算出步驟SA-2、SA-3、SA-4輸出的數值的積，根據該積值，從步驟SA-1制成的部分堿基序列信息中篩選規定序列信息。這里，堿基序列處理裝置100通過突出端添加部102f的處理，可以在步驟SA-5篩選出的規定序列信息的至少一個末端添加突出端，存放于規定序列文件106d所確定的記憶區。具體地說，例如可以通過堿基序列處理裝置100通過突出端添加部102f的處理，將規定序列文件106d的規定序列信息項中記載的規定序列信息換寫為至少一個末端添加了突出端規定的序列信息，另外，例如，也可以在搜索靶標時在規定序列信息的2個末端添加突出端。另外，上述突出端位置的堿基數如在上述欄<2>中產生RNA干擾的多核苷酸的堿基序列設計方法”所述的堿基數，具體地說，例如為2比較適合。而且，堿基序列處理裝置100通過相同類似堿基序列搜索部102g的處理，可搜索與在步驟SA-5中從其它堿基序列信息(諸如NCBI的RefSAeq(ReferenceSequenceProject)等的公共數據庫中公開的堿基序列信息)篩選出的規定序列信息相同或近似的堿基序列信息，可以通過采用已知的諸如BLAST、FASTA、ssearch等同源性搜索方法進行搜索，通過在無關基因靶標評價部102h中進行的無關基因靶標評價處理，根據搜索到的相同或類似的堿基序列信息，評價規定序列信息將無關基因作為靶標的可能性。具體地說，例如可以堿基序列處理裝置100通過相同類似堿基序列搜索部102g的處理，從其它堿基序列信息(例如NCBI的RefSeq等公共數據庫公開的堿基序列信息)，通過采用已知的諸如BLAST、FASTA、ssearch等同源性搜索方法搜索，與步驟SA-5中篩選出的規定序列信息相同或近似的堿基序列信息，無關基因靶標評價部102h通過總和算出部102m的處理，根據搜索到的相同或類似堿基序列信息中與目標基因無關的基因的堿基序列信息的總數以及與目標基因無關的基因的堿基序列信息所附帶的相同或類似程度的數值(例如BLAST、FASTA、ssearch時的E值)，計算出表示相同或類似程度的數值的倒數的總和。無關基因靶標評價部102h通過總和基準評價部102n的處理，根據算出的總和，評價規定序列信息是否可能將與目標基因無關的基因作為靶標。這里，參考第24圖，詳細說明無關基因靶標評價部102h進行的無關基因靶標評價處理。第24圖是表示本實施形式的系統的無關基因靶標評價處理的一個示例的流程圖。首先，堿基序列處理裝置100通過相同類似堿基序列搜索部102g的處理，從其它堿基序列信息(例如NCBI的RefSeq等公共數據庫公開的堿基序列信息)，通過采用已知的諸如BLAST、FASTA、ssearch等同源性搜索方法搜索與步驟SA-5篩選出的規定序列信息相同或近似的堿基序列信息，將規定序列信息的識別信息(第19圖的“部分堿基序列識別信息)、搜索得到的相同或類似堿基序列信息的識別信息(第19圖的“參照序列識別信息”)、賦予搜索得到的相同或類似堿基序列信息的、表示同一類似度的值(例如BLAST、FASTA、ssearch時的E值)(第19圖的同一類似度)相互關聯地存放于相同類似度文件106f所確定的記憶區。接下來，無關基因靶標評價部102h通過總和算出部102m的處理，根據搜索到的相同或類似堿基序列信息中與目標基因無關的基因的堿基序列信息的總數以及賦予與目標基因無關的基因的堿基序列信息表示相同或類似程度的數值(例如BLAST、FASTA、ssearch時的E值)，計算出表示相同或類似程度的數值的倒數的總和，將規定序列信息的識別信息(第20圖的部分堿基序列識別信息)和計算出的總和(第20圖的“總和”)相互關聯，存放于評價結果文件106g所確定的記憶區(步驟SB-1)。接下來，無關基因靶標評價部102h通過總和基準評價部102n的處理，根據步驟SB-1計算出的總和(例如根據步驟SB-1計算出的總和的大小)，評價規定序列信息是否可能將無關基因作為靶標，把評價結果(在第20圖的“非靶標”和“靶標”)存放于評價結果文件106g所確定的記憶區(步驟SB-2)。到此，主處理結束。至此，雖已經說明了本發明的實施形式，但本發明在上述實施形式以外，在權利要求范圍記載的技術思想的范圍內還可以具有各種不同的實施形式。例如，以堿基序列處理裝置100可以以獨立的形式進行處理的一個示例進行說明。堿基序列處理裝置100可以由按照以另行構成的客戶機端的要求進行處理、將處理結果返回該客戶機端的形式構成。具體地說，例如，從客戶機端向堿基序列處理裝置100發送RNA干擾的目標基因的名稱(例如基因名、登錄號)或目標基因的相關堿基序列信息，堿基序列處理裝置100對該基因名稱對應的堿基序列信息或對客戶機端發送過來的堿基序列信息通過控制部102進行上述各處理，篩選獲得的對目標基因特異產生RNA干擾的規定序列信息，然后對客戶機端發送所述規定序列信息。此時，也可以從公共數據庫取得序列信息篩選針對查詢基因的siRNA。而且，也可以預先計算出全部基因的siRNA，存儲記憶起來，在客戶機端發送來要求(基因的名稱或登錄號)時即時地篩選siRNA，將篩選的siRNA向客戶端發送。堿基序列處理裝置100也可以確認對于與目標基因無關的基因的規定序列信息的特異性。由此，篩選出僅對目的基因特異產生RNA干擾的規定序列信息。而且，對于由客戶機端和堿基序列處理裝置100構成的本系統來說，網頁上的利用者可以反饋siRNA的RNA干擾效果(例如“有效”、“無效”)的結果，在堿基序列處理裝置100存貯從利用者反饋回來的試驗例，從而也可以導入改善對上述RNA干擾有效的siRNA的序列規律性的界面功能。堿基序列處理裝置100可從規定序列信息中計算siRNA的正鏈堿基序列信息以及與該正鏈互補的反義鏈的堿基序列信息。具體地說，例如堿基序列處理裝置100進行完上述處理在結果規定序列的兩端添加各2個堿基的突出端形成23個堿基的序列信息“caccctgacccgcttcgtcatgg″時，計算正義鏈的序列信息″5-CCCUGACCCGCUUCGUCAUGG-3″以及反義鏈的堿基序列信息″5-AUGACGAAGCGGGUCAGGGUG-3″，由此，在訂購多核苷酸時，沒必要手工整理正義鏈和反義鏈，非常便利。在實施形式中說明的各處理中，自動進行的部分也可以手動實施說明的處理中的全部或部分，或者，手動進行的部分可以用共知的方法轉換為全部或部分地自動進行。此外，關于包含上述說明書、附圖中所示的處理順序、控制順序、具體名稱、各種登錄數據、參數諸如搜索條件等的信息、圖例、數據庫構成，除特殊情況下可以任意變更。關于堿基序列處理裝置100，圖中的各構成要素純是功能概念性的，不必在物理上如圖所示那樣構成。例如，關于堿基序列處理裝置100的各部或各裝置所具的處理功能，特別是控制部102進行處理的各處理功能，其全部或任意一部分能夠通過CPU(CentralProcessingUnit)以及由該CPU解釋執行的程序實現，或者，能夠由根據插線邏輯(wiredlogic)的硬件來實現。另外，程序記載在后述的記載載體上，需要時堿基序列處理裝置可機械地讀取。也即，在ROM或HD等的記憶部106等上記載著與OS(OperatingSystem)協動向CPU發布命令進行各種處理的計算機程序，這些計算機程序通過加載于RAM等上執行，和CPU協動構成控制部102。這些計算機處理程序也可通過網絡300記載在與堿基序列處理裝置100連接的應用程序服務器上。需要時再下載也可以。而且，本發明有關的程序能夠存儲在計算機能夠讀取的記錄介質上。這里所謂“記錄介質”包含柔性磁碟(flexibledisk)、光盤、ROM、EPROM、EEPROM、CD-ROM、MO、DVD、閃存(flashdisk)等任意“可移動的物理載體”、各種內藏于計算機系統內的ROM、RAM、HD等任意的“固定物理載體”、或者，在程序經由以LAN、WAN、因特網為代表的網絡傳送時，象通信線路或載波那樣的短期保持程序的“通訊載體”。所謂“程序”，指用任意語言、描述方法記述的數據處理方法，而不拘源代碼和二進位代碼的形式。“程序”未必僅限于單一地構成，也包含作為多個模塊(module)或程序庫(library)的分散構成系統或如OS(OperatingSystem)的其它程序協同實現其功能。另外，關于在實施形式所述的各裝置讀取記錄介質的具體構成、讀取順序、或者讀取后的安裝順序，采用眾所周知的構成、順序進行。在記憶部106存放的各種數據庫等(目標基因堿基序列文件106a～目標基因注釋數據庫106h)采用RAM、ROM等存儲裝置、硬盤等固定盤裝置、柔性磁碟((flexibledisk)、光盤等存儲裝置，存放有用于各種處理、用于提供給網址的程序、桌面、文件、數據庫、網頁用文件等等。堿基序列處理裝置100可在已知的個人計算機、工作站等的信息處理端等信息處理裝置上連接打印機、監視器、掃描儀等外圍裝置，該信息處理裝置由安裝有實現本發明的方法的軟件(包含程序、數據等)實現其功能。進一步，堿基序列處理裝置100的分散/集成的具體形式也不限于本發明說明書及附圖所示，其全部或其一部分可以以相應于各種負荷等的任意單位、功能地或物理地分散/集成構成(例如網格計算等)(gridcomputing)。例如，把各數據庫作為獨立的數據庫裝置獨立構成，處理的一部分采用CGI(CommonGatewayInterface)實現。網絡300具有使堿基序列處理裝置100和外部系統200相互連接的功能，例如，包含因特網、內聯網(intranet)、LAN、(包含有線、無線)、VAN、個人電子計算機通信網、公共電話網(包含模擬、數字兩種)、專用線路網(包含模擬、數字兩種)、CATV網、IMT2000方式、GSM方式、PDC/PDC-P方式等的手機線路交換網/手機程序包交換網、無線呼出網、藍牙的局部無線網、PHS網、CS、BS或ISDB等衛星通訊網中的任一均可。即本系統可通過不拘有線、無線的任意網絡接受發送各種數據。實施例以下通過實施例具體說明本發明，但本發明并不限于下述實施例。實施例1(1)測定RNAi效應的基因、表達載體為了測定由siRNA引起的RNA干擾效應，采用螢火蟲(Photinuspyralis，P.pyralis)的螢光素酶(luc)基因(登錄號U47296)作為目標基因，包含此基因的表達載體采用pGL3-對照載體(Promega制造)，P.pyralis的luc基因片段在載體中位于SV40啟動子和PolyA間，內對照基因采用海蕈(Renillarenifornis，R.reniformis)的luc基因，包含此基因的載體采用載體PRL-TK(Promega制造)。(2)21堿基雙鏈RNA(siRNA)的合成21堿基正義鏈和21堿基反義鏈RNA(第9圖所示位置的序列，a～p)通過日立計測器服務株式會社委托ジエンセツト株式會社合成。用于阻止P.pyralis的luc基因表達的雙鏈RNA是通過將正義鏈和反義鏈混合制作的，結合時，把正義鏈和反義鏈在含10MmTris-HCI(PH7.5)、20MmNaCI反應液中、90℃加熱3分鐘，在37℃孵育1小時，然后室溫放置。雙鏈多核苷酸的形成通過在TBE緩沖液中的2％瓊脂糖凝膠上進行電泳檢測，在上述條件下，幾乎所有的單鏈多核苷酸都結合成雙鏈多核苷酸。(3)哺乳類細胞培養方法哺乳細胞培養采用了人的HeLa細胞和HEK293細胞、中華倉鼠CHO-KI細胞(RIKENCellbank)。培養基中采用在Dulbecco`s改良的Eagle`s培養基(GibcoBRL制造)，其中添加10％滅活的胎牛血清(MitsubishiKasei公司制造)以及抗生素青霉素(penicillin)(Meiji公司制造)10單位/毫升、鏈霉素(Streptomycin)(Meiji公司制造)50微克/毫升。在37℃、5％CO2存在下培養。(4)目標基因、內對照基因、siRNA對哺乳類培養細胞的轉染哺乳細胞以0.2～0.3×106細胞/毫升的濃度接種于24孔板，1天以后，用鈣-磷酸鹽沉淀法(細胞工程學手冊，黑木登志夫等編著，羊土社，1992)將1.0μg的pGL3-對照DNA、0.5或1.0μg的pRL-TKDNA、以及分別為0.01、0.1、1、10、100nM的各siRNA導入。(5)果蠅(Drosophila)細胞培養法果蠅細胞培養采用S2細胞(Schneider，I.，etal.，J.EmbryolExp.Morph.，27，353-365(1972)，培養基采用Schneider`s果蠅培養基(Gibcobrl社制造)，其中加入10％滅活的胎牛血清(MitsubishiKasei社制造)和抗生素青霉素(Meiji公司制造)10單位/毫升、鏈霉素(Meiji公司制造)50微克/毫升。在25℃、5％CO2存在下培養。(6)目標基因、內對照基因、siRNA向果蠅細胞的轉染將此S2細胞以1.0×106細胞/毫升的濃度接種于24孔平板，1天以后，用鈣-磷酸鹽沉淀法(細胞工程學手冊，黑木登志夫等編著，羊土社，1992)將1.0μg的pGL3-對照DNA、0.1μg的pRL-TKDNA、以及分別為0.01、0.1、1、10、100nM的siRNA導入。(7)RNAi效果的測定轉染后20個小時，回收轉染了siRNA的細胞，采用Dual-LuciferaseReporterAssaySystem(Promega社制造)測定2種螢光素酶(P.Pyralis的luc和R.Reniformis的luc)的表達水平(螢光素酶活性)，發光量的測定采用LumatLB9507照度計(luminometer)(EG&GBerthold)進行。(8)結果螢光素酶活性測定的結果如第10圖所示，而且，螢光素酶活性和各堿基序列之間的對應性研究結果如第11圖所示。在第10圖中，B圖表示果蠅的結果，C圖表示人細胞的結果。如第10圖所示，在果蠅中通過產生堿基數為21的RNA，幾乎所有序列都能夠抑制螢光素酶活性。另外，在人的細胞中，可以看出，僅僅是將堿基數定為21很難得到能夠抑制螢光素酶活性的序列。因此，分析了a～p的RNA的堿基序列的規律性，序列分析如第1圖所示，對雙鏈RNA的5個位置進行了分析。觀察第11圖中的表中最上部的a的siRNA，螢光素酶相對活性(RLA)為0.03，對反義鏈從3’末端順次看，突出端部(OH)的堿基序列為UC，接著的7堿基(圖11中的3’-T)中的G/C含有量(鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的含有量)為57％，再接著的5堿基(第11圖中M)的G/C含有量為20％，再接著的7堿基(第11圖中的5’-T)G/C含有量為14％，5’末端為U，G/C含有量合計為32％。該表中，RLA的值越低，RLA活性越低，即表示螢光素酶的表達被抑制。從這個結果可以看出，產生RNA干擾的多核苷酸的堿基序列的3’末端的堿基是腺嘌呤(A)、或尿嘧啶(U)，5’末端的堿基是鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的概率極高，而且，3’末端的7堿基序列中富含腺嘌呤(A)、或尿嘧啶(U)。實施例21、目標表達載體pTREC的構建如下述構建了目標表達載體，目標表達分子即使RNAi的目標序列的RNA表達的分子。在PCI-neo(GenebankAccessionNo.U47120，Promega制造)的CMV增強子/啟動子下游構建目標mRNA序列(第25圖)。合成具有Kozak序列、ATG序列、目標23堿基序列克隆位點(target)以及用于重組的限制酶(NheI、EcoRI、XhoI)識別序列的下述雙鏈寡聚體，該雙鏈寡聚體由與序列表編號為1所示序列的互補序列組成，。將合成的雙鏈寡聚體插入PCI-neo的NheI/XhoI位點，構建成目標表達載體pTREC(第25圖)。另外，內含子采用PCI-neo當初構建時具有的來源于β珠蛋白的內含子部位。5′-gctagccaccatggaattcacgcgtctcgagtctaga-3′(SEQIDNO1)如第25圖所示的pTREC具有啟動子/增強子(pro/enh)、和PCR引物對應的區域PAR(F)1以及PAR(R)1。PAR(F)1中間具有內含子，是為了表達載體本身不要成為PCR的模板。RNA轉錄后，在真核生物培養細胞的進行剪接的環境條件下，除去pTREC內含子部位以連接兩個相鄰的PAR(R)1。通過RT-PCR擴增由pTREC形成的RNA，內含子采用PCI-neo當初構建時具有的來源于β珠蛋白的內含子部位。pTREC中還含有作為對照的新霉素抗性基因(neo)。制作對應于新霉素抗性基因內的序列一部分的PCR引物，對所述新霉素抗性基因內的序列一部分進行RT-PCR，將新霉素抗性基因內作為內部標準對照(內對照)進行使用。PAR(F)2和PAR(R)2表示新霉素抗性基因中的PCR引物對應區。另外，第25圖并沒有示出內含子也可插入PAR(F)2和PAR(R)2的至少一個。2、檢測目標mRNA的引物的效果(1)轉染培養細胞在24孔板的每一個孔接種0.2～0.3×106細胞的HeLa細胞，1天后采用Lipofectamine2000(Invitrogen社制造)，按手冊指南轉染0.5μgpTREC載體。(2)細胞回收以及mRNA定量轉染1天以后，回收細胞，用Trizol(Invitrogen社制造)提取總RNA，用此RNA100ng，以OligodT為引物，用SuperScriptIIRT試劑盒(Invitrogen社制造)逆轉錄，合成cDNA，將得到的cDNA的1/320量用作PCR模板，用SYBRGreenPCRMasterMix(AppliedBiosystem公司制造)、在50μl反應系統中進行定量PCR，對目標mRNA(稱為mRNA(T))以及作為內對照的pTREC中的新霉素抗性基因的mRNA(稱為mRNA(C))進行定量。定量PCR采用實時監測裝置ABIPRIZM7000(AppliedBiosystem公司制造)，mRNA(T)的定量使用引物對T(序列表序列編號2、3)，mRNA(C)的定量采用引物對C(序列表序列編號4、5)。引物對Taggcactgggcaggtgtc(SEQIDNO2)tgctcgaagcattaaccctcacta(SEQIDNO3)引物對Catcaggatgatctggacgaag(SEQIDNO4)ctcttcagcaatatcacgggt(SEQIDNO5)第26以及27圖表示PCR的結果，第26以及27圖縱軸表示PCR產物，橫軸表示循環次數。新霉素抗性基因中，在加入逆轉錄酶進行cDNA合成(RT+)和不加逆轉錄酶的對照(-RT)時得到的PCR產物量擴增的差是很小的；(第26圖)，這表示，不只cDNA，細胞內殘留的載體也作為PCR模板并被擴增。另一方面，目標序列mRNA在加入逆轉錄酶(RT+)和不加逆轉錄酶(-RT)時的差異很大(第27圖)，這個結果表明由于引物對T中的一個設計為中間夾有內含子的形式，能夠高效擴增來源于除去了內含子的mRNA的cDNA，而對尚含有內含子的載體難以作為模板。3、通過siRNA抑制目標mRNA的表達(1)靶向目標表達載體的評價序列的克隆將對應于人波形纖維蛋白基因(VIM)(RefSeqIDNM-003380)編碼區的812-834、35-57位置的序列作為評價對象，制作出含有這些序列以及EcoRI、XhoI識別位點的、下述序列表中序列編號6及7所示的合成寡聚核苷酸(評價序列片斷)。評價序列VIM35(相應于VIM的35-57)5′-gaattcgcaggatgttcggcggcccgggcctcgag-3′(SEQIDNO6)評價序列VIM812(相應于VIM的812-834)5′-gaattcacgtacgtcagcaatatgaaagtctcgag-3′(SEQIDNO7)利用得到的評價序列片斷兩端的EcoRI、XhoI位點，將其克隆進pTREC的EcoRI、XhoI位點間，構建形成新的目標序列pTREC-VIM35、pTREC-VIM812。(2)siRNA的制作合成分別相當于各個評價序列VIM35(序列表序列編號8、第28圖)、評價序列VIM812(序列表編號9、第29圖)、對照序列(siControl、序列編號10、第30圖)的siRNA片段，進行退火。在下述各序列的3’末端設突出端。siVIM355′-aggauguucggcggcccgggc-3′(SEQIDNO8)siVIM8125′-guacgucagcaauaugaaagu-3′(SEQIDNO9)作為對照，使用相對于螢光素酶基因的siRNA。SiControl5′-cauucuauccgcuggaagaug-3′(SEQIDNO10)(3)轉染進入所培養的細胞在24孔板的每一個孔接種0.2～0.3×106細胞的HeLa細胞，1天后采用Lipofectamine2000(Invitrogen社制造)，按手冊指南同時轉染0.5μg的pTREC-VIM35或者pTREC-VIM812載體和相應于各自VIM來源的序列的100nM的siRNA(siVIM35、siVIM812)。對于對照細胞，同時轉染0.5μg的pTREC-VIM35或者pTREC-VIM812載體以及相應于螢光素酶基因的100nM的siRNA(SiControl)。(4)細胞回收以及mRNA定量轉染1天以后，回收細胞，用Trizol(Invitrogen社制造)提取總RNA，用此RNA100ng，以OligodT為引物，用SuperScriptIIRT試劑盒(Invitrogen社制造)逆轉錄，合成cDNA，將得到的cDNA的1/320量用作PCR模板，用SYBRGreenPCRMasterMix(AppliedBiosystem公司制造)、在50μl的反應系統中進行定量PCR，對包含要評價的來自VIM的序列的mRNA(稱為mRNA(T))以及作為內對照的來自pTREC的新霉素抗性基因的mRNA(稱為mRNA(C))進行定量。定量PCR采用實時監測裝置ABIPRIZM7000(AppliedBiosystem公司制造)，mRNA(T)的定量使用引物對T(序列表序列編號2、3)，mRNA(C)的定量采用引物對C(序列表序列編號4、5)。將得到的各mRNA的值的比(T/C)作為縱軸(目標mRNA相對量％)列表。(第31圖)。對照細胞中，由于相對于螢光素酶基因的siRNA不影響目標mRNA，T/C比幾乎為1，對于VIM812siRNA來說T/C比顯著下降，這是因為VIM812siRNA切斷相應序列的mRNA的緣故；也顯示VIM812siRNA具有RNA干擾效應。另一方面，VIM35siRNA的T/C比與對照幾乎相同，對VIM35的序列幾乎不產生RNA干擾效果。實施例31、由siRNA引起的內源性波形蛋白的表達抑制(1)轉染進入所培養的細胞在24孔板的每一個孔接種0.2～0.3×106細胞的HeLa細胞，1天后采用Lipofectamine2000(Invitrogen社制造)，按手冊指南同時將100nM對應于VIM的siRNA(Sivim35或者siVIM812)、或者對照siRNA(siControl)、作為轉染效率對照的0.5μgpEGFP。pEGFP中含有EGFP。(2)內源性波形蛋白mRNA測定轉染1天以后，回收細胞，用Trizol(Invitrogen社制造)提取總RNA，用此RNA100ng，以OligodT為引物，用SuperScriptIIRT試劑盒(Invitrogen社制造)逆轉錄，合成cDNA，將得到的cDNA產物用作PCR模板，采用對應于波形蛋白的引物VIM-F3-84、VIM-R3-274(序列編號11、12)進行PCR。VIM-F3-84；gagctacgtgactacgtcca(SEQIDNO11)VIM-R3-274；gttcttgaactcggtgttgat(SEQIDNO12)作為對照，采用對應于β肌動蛋白的引物ACTB-F2-481、ACTB-R2-664(序列編號13、14)進行PCR，合計各樣品β肌動蛋白的常見定量值，評價波形蛋白的表達量。ACTB-F2-481；cacactgtgcccatctacga(SEQIDNO13)ACTB-R2-664；gccatctcttgctcgaagtc(SEQIDNO14)結果如圖32所示，將加入siControl(即與目標無關的序列)情況作為100％用于比較，第32圖表示在加入對應于VIM的siRNA的情況下，VIM的mRNA減少的程度是多少。結果顯示，siVIM812能夠高效抑制VIM的mRNA，而采用Sivim35時則幾乎不顯示RNA干擾效應。(3)細胞的抗體染色轉染3日以后，將細胞在3.7％甲醛中固定，根據常規方法進行封閉以后，加入兔抗波形蛋白抗體(α-VIM)或者作為內對照的兔抗Yes抗體(α-Yes)，室溫反應后，將細胞表面用PBS(phophatebufferedSaline，磷酸緩沖液)洗凈，加入作為二抗的熒光標記的抗兔IgG抗體，室溫反應以后，將細胞表面用PBS洗凈，在熒光顯微鏡下觀察。熒光顯微鏡觀察的結果如第33圖所示。在第33圖中，9個圖中發白的部分為熒光部分，EGFP及Yes在任何細胞中都顯示同等程度的表達，在導入siControl、siVIM35的細胞，通過波形蛋白抗體染色觀察熒光，確定了內源性波形蛋白的存在。在導入siVIM812的細胞中，比起導入siControl、siVIM35的細胞來，其熒光顯著減弱。這個結果揭示，由于siVIM812波形蛋白mRNA受到干擾，從而波形蛋白表達減少，siVIM812對內源性波形蛋白mRNA具有RNAi效果。因為本發明的試驗系得到的結果(實施例2)與實際上采用各種siRNA處理內源基因的結果常常一致，所以，這個試驗系作為任意的siRNA的RNAi活性的評價方法也是有效的。實施例4根據上述規則(a)～(d)設計堿基序列。堿基序列的設計通過執行上述siRNA序列設計程序的堿基序列處理裝置進行。準備了預測為有RNAi活性的15種序列(序列編號15-29)和預測不具有RNAi活性的5種序列(序列編號30-34)。除根據設計的序列制作目標序列及評價對象的siRNA以外，和上述實施例1一樣，通過測定熒光素酶活性，評價RNAi的活性。結果如34圖所示，熒光素酶相對活性值低的為有效狀態，即其是具備RNAi活性的siRNA。上述經程序預測有RNAi活性的siRNA全部具有熒光素酶的表達抑制效果。5，gacgccaaaaacataaaga(SEQIDNO15)184，gttggcagaagctatgaaa(SEQIDNO16)272，gtgttgggcgcgttattta(SEQIDNO17)309，ccgcgaacgacatttataa(SEQIDNO18)428，ccaatcatccaaaaaatta(SEQIDNO19)515，cctcccggttttaatgaat(SEQIDNO20)658，gcatgccagagatcctatt(SEQIDNO21)695，ccggatactgcgattttaa(SEQIDNO22)734，ggttttggaatgtttacta(SEQIDNO23)774，gatttcgagtcgtcttaat(SEQIDNO24)891，gcactctgattgacaaata(SEQIDNO25)904，caaatacgatttatctaat(SEQIDNO26)1186，gattatgtccggttatgta(SEQIDNO27)1306，ccgcctgaagtctctgatt(SEQIDNO28)1586，ctcgacgcaagaaaaatca(SEQIDNO29)[顯示無RNAi活性的序列，規定序列部分，不含突出部]14，aacataaagaaaggcccgg(SEQIDNO30)265，tatgccggtgttgggcgcg(SEQIDNO31)295，agttgcagttgcgcccgcg(SEQIDNO32)411，acgtgcaaaaaaagctccc(SEQIDNO33)1044，ttctgattacacccgaggg(SEQIDNO34)實施例5對SARS病毒進行siRNA設計，檢查其RNAi活性。除目標序列以及評價對象序列分別變更以外，RNAi活性采用和上述實施例2同樣的分析試驗進行評價。從SARS病毒的基因組的3CL-pro、RdRp、Spike糖蛋白、小衣殼E蛋白，膜糖蛋白M、核衣殼蛋白、s2m基序的各處，利用上述siRNA序列設計程序設計符合所述規則的siRNA。第35圖試驗的結果顯示，設計的符合規則的11個siRNA序列以其分別對應的作為靶標高效抑制其RNA。以加入siControl(與SARS無關的序列)的情況作為100％表示加入各siRNA時的相對目標mRNA的量。在加入各siRNA時，目標RNA減少到10％或10％以下，確認其具有RNAi活性。siControl；gggcgcggtcggtaaagtt(SEQIDNO35)3CL-PRO；SARS-10754；ggaattgccgtcttagata(SEQIDNO36)3CL-PRO；SARS-10810；gaatggtcgtactatcctt(SEQIDNO37)RdRp；SARS-14841；ccaagtaatcgttaacaat(SEQIDNO38)刺突蛋白(Spikeglycolprotein)；SARS-23341；gcttggcgcatatattcta(SEQIDNO39)刺突蛋白；SARS-24375；cctttcgcgacttgataaa(SEQIDNO40)小包膜(Smallenvelope)E蛋白；SARS-26233；gtgcgtactgctgcaatat(SEQIDNO41)小包膜E蛋白；SARS-26288；ctactcgcgtgttaaaaat(SEQIDNO42)膜糖蛋白M；SARS-26399；gcagacaacggtactatta(SEQIDNO43)膜糖蛋白M；SARS-27024；ccggtagcaacgacaatat(SEQIDNO44)核殼體(Nucleocapsid)蛋白；SARS-28685；cgtagtcgcggtaattcaa(SEQIDNO45)s2m基序；SARS-29606；gatcgagggtacagtgaat(SEQIDNO46)實施例6遵照上述“<5>siRNA序列設計程序”以及“<7>執行siRNA序列設計程序的堿基序列處理裝置等”，進行下述siRNA設計。設計的siRNA的序列如序列表序列編號47-序列編號892所示。(RNAi目標基因)NM-000604，人成纖維細胞生長因子受體1(fms-相關的酪氨酸激酶2，Pfeiffer綜合癥)(FFFR1)(目標序列)NM_000604-807，gtagcaacgtggagttcat(SEQIDNO47)NM_000604-806，ggtagcaacgtggagttca(SEQIDNO48)NM_000604-811，caacgtggagttcatgtgt(SEQIDNO49)NM_000604-880，ggtgaatgggagcaagatt(SEQIDNO50)NM_000604-891，gcaagattggcccagacaa(SEQIDNO51)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_000604-818，gagttcatgtgtaaggtgt(SEQIDNO52)(RNAi目標基因)NM_000141，人纖維母細胞生長因子受體(人fibroblastgrowthfactorreceptor)2(細菌表達的激酶(bacteria-expressedkinase)，角質化細胞生長因子受體(keratinocytegrowthfactorreceptor)，顱面骨發育不全(craniofacialdysostosis)1，Crouzon綜合征(Crouzonsyndrome)，Pfeffer綜合征(Pfeffersyndrome)，Jackson-Weiss綜合征(Jackson-Weisssyndrome))(FGFR2)(目標序列)NM_000141-612，gaggctacaaggtacgaaa(SEQIDNO53)NM_000141-615，gctacaaggtacgaaacca(SEQIDNO54)NM_000141-637，ctggagcctcattatggaa(SEQIDNO55)NM_000141-574，gaaaaacgggaaggagttt(SEQIDNO56)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_000141-595，gcaggagcatcgcattgga(SEQIDNO57)NM_000141-69，ccttcagtttagttgagga(SEQIDNO58)NM_000141-70，cttcagtttagttgaggat(SEQIDNO59)(RNAi目標基因)NM_000142，人纖維母細胞生長因子受體(人fibroblastgrowthfactorreceptor)3(軟骨發育不全(achondroplasia)，致死性侏儒癥(thanatophoricdwarfism))(FGFR3)(目標序列)NM_000142-899，gacggcacaccctacgtta(SEQIDNO60)NM_000142-1925，cacaacctcgactactaca(SEQIDNO61)NM_000142-2154，gcacacacgacctgtacat(SEQIDNO62)NM_000142-678，cctgcgtcgtggagaacaa(SEQIDNO63)NM_000142-2157，cacacgacctgtacatgat(SEQIDNO64)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_000142-812，gagttccactgcaaggtgt(SEQIDNO65)(RNAi目標基因)NM_004448，人v-erb-b2成紅細胞白血病病毒癌基因同源物2(Homosapiensv-erb-b2erythroblasticleukemiaviraloncogenehomolog2，)，神經/膠質母細胞瘤來源的癌基因同源物(鳥類)(neuro/glioblastomaderivedoncogenehomolog(avian))(ERBB2)(目標序列)NM_004448-356，ggagacccgctgaacaata(SEQIDNO66)NM_004448-3645，ccttcgacaacctctatta(SEQIDNO67)NM_004448-3237，gggctggctccgatgtatt(SEQIDNO68)NM_004448-3238，ggctggctccgatgtattt(SEQIDNO69)NM_004448-3240，ctggctccgatgtatttga(SEQIDNO70)(RNAi目標基因)NM_001982，人v-erb-b2成紅細胞白血病病毒癌基因同源物3(鳥類)(ERBB3)(目標序列)NM_001982-1347，gtgctgggcgtatctatat(SEQIDNO71)NM_001982-1349，gctgggcgtatctatataa(SEQIDNO72)NM_001982-1548，gcttgtcctgtcgaaatta(SEQIDNO73)NM_001982-1549，cttgtcctgtcgaaattat(SEQIDNO74)NM_001982-2857，cattcgcccaacctttaaa(SEQIDNO75)(RNAi目標基因)NM_005235，人v-erb-a成紅細胞白血病病毒癌基因同源物4(鳥類)(ERBB4)(目標序列)NM_005235-295，ggagaatttacgcattatt(SEQIDNO76)NM_005235-2120，gctcaacttcgtattttga(SEQIDNO77)NM_005235-2940，ctcaaagatacctagttat(SEQIDNO78)NM_005235-2121，ctcaacttcgtattttgaa(SEQIDNO79)NM_005235-2880，ctgacagtagacctaaatt(SEQIDNO80)(RNAi目標基因)NM_002227，人Janus激酶1(蛋白酪氨酸激酶)(JAK1)(目標序列)NM_002227-441，ctcagggacagtatgattt(SEQIDNO81)NM_002227-1299，cagaatacgccatcaataa(SEQIDNO82)NM_002227-673，gatgcggataaataatgtt(SEQIDNO83)NM_002227-672，ggatgcggataaataatgt(SEQIDNO84)NM_002227-3385，ctttcagaaccttattgaa(SEQIDNO85)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002227-607，cagctacaagcgatatatt(SEQIDNO86)NM_002227-3042，caattgaaaccgataagga(SEQIDNO87)NM_002227-2944，gggttctcggcaatacgtt(SEQIDNO88)(RNAi目標基因)NM_004972，人Janus激酶2(酪氨酸蛋白激酶)(JAK2)(目標序列)NM_004972-2757，ctggtcggcgtaatctaaa(SEQIDNO89)NM_004972-2759，ggtcggcgtaatctaaaat(SEQIDNO90)NM_004972-2760，gtcggcgtaatctaaaatt(SEQIDNO91)NM_004972-3175，ggaatttatgcgtatgatt(SEQIDNO92)NM_004972-1452，ctgttcgctcagacaatat(SEQIDNO93)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_004972-872，ggaaacggtggaattcagt(SEQIDNO94)NM_004972-870，ctggaaacggtggaattca(SEQIDNO95)NM_004972-847，gatttttgcaaccattata(SEQIDNO96)(RNAi目標基因)NM_000215，人Janus激酶3(酪氨酸蛋白激酶，白細胞)(JAK3)(目標序列)NM_000215-2315，gtcattcgtgacctcaata(SEQIDNO97)NM_000215-2522，gacccgctagcccacaata(SEQIDNO98)NM_000215-2524，cccgctagcccacaataca(SEQIDNO99)NM_000215-1788，ccatggtgcaggaatttgt(SEQIDNO100)NM_000215-1825，catgtatctgcgaaaacgt(SEQIDNO101)(RNAi目標基因)NM_003331，人酪氨酸激酶2(TYK2)(目標序列)NM_003331-3213，gcctgaaggagtataagtt(SEQIDNO102)NM_003331-2658，cggaccctacggttttcca(SEQIDNO103)NM_003331-299，ctatatttccgcataaggt(SEQIDNO104)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_003331-2674，ccacaagcgctatttgaaa(SEQIDNO105)NM_003331-2675，cacaagcgctatttgaaaa(SEQIDNO106)NM_003331-328，gaactggcatggcatgaat(SEQIDNO107)(RNAi目標基因)NM_001079，人ξ-鏈(zeta-chain)(TCR)結合的蛋白激酶70kDa(ZAP70)(目標序列)NM_001079-512，gaggccgagcgcaaacttt(SEQIDNO108)NM_001079-1512，ggtacgcacccgaatgcat(SEQIDNO109)NM_001079-242，gagctctgcgagttctact(SEQIDNO110)NM_001079-929，gacacgagcgtgtatgaga(SEQIDNO111)NM_001079-1412，cggcactacgccaagatca(SEQIDNO112)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_001079-1566，ggagctatggggtcaccat(SEQIDNO113)(RNAi目標基因)NM_005417，人v-src肉瘤(Schmidt-RuppinA-2)病毒癌基因同源物(鳥類)(SRC)(目標序列)NM_005417-185，ctgttcggaggcttcaact(SEQIDNO114)NM_005417-685，ggtggcctactactccaaa(SEQIDNO115)NM_005417-474，gggagtcagagcggttact(SEQIDNO116)NM_005417-480，cagagcggttactgctcaa(SEQIDNO117)NM_005417-567，cagtgtctgacttcgacaa(SEQIDNO118)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_005417-651，cctcccgcacccagttcaa(SEQIDNO119)(RNAi目標基因)NM_002350，人v-yes-1Yamaguchi肉瘤病毒相關的癌基因同源物(LYN)(目標序列)NM_002350-610，cagcgacatgattaaacat(SEQIDNO120)NM_002350-533，gttattaagcactacaaaa(SEQIDNO121)NM_002350-606，gtatcagcgacatgattaa(SEQIDNO122)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002350-783，ggatgggttactataacaa(SEQIDNO123)NM_002350-694，gaagccatgggataaagat(SEQIDNO124)NM_002350-541，gcactacaaaattagaagt(SEQIDNO125)(RNAi目標基因)NM_005157，人v-ablAbelson鼠白血病(murineleukemia)病毒癌基因同源物1(ABL1)(目標序列)NM_005157-232，cactctaagcataactaaa(SEQIDNO126)NM_005157-770，gagggcgtgtggaagaaat(SEQIDNO127)NM-005157-262，ccgggtcttaggctataat(SEQIDNO128)NM_005157-264，gggtcttaggctataatca(SEQIDNO129)NM_005157-484，catctcgctgagatacgaa(SEQIDNO130)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_005157-217，ggccagtggagataacact(SEQIDNO131)NM_005157-1227，gcctggcctacaacaagtt(SEQIDNO132)NM_005157-680，gtgtcccccaactacgaca(SEQIDNO133)(RNAi目標基因)NM_005158，人v-ablAbelson鼠白血病病毒癌基因同源物2(arg，Abelson-相關的基因)(ABL2)(目標序列)NM_005158-3273，ctcaaactcgcaacaaatt(SEQIDNO134)NM_005158-3272，cctcaaactcgcaacaaat(SEQIDNO135)NM_005158-1425，ctaaggtttatgaacttat(SEQIDNO136)NM_005158-448，gctcagcagtctaatcaat(SEQIDNO137)NM_005158-3110，caggccgctgagaaaatct(SEQIDNO138)(RNAi目標基因)NM_004071，人CDC-樣激酶1(CLK1)(目標序列)NM_004071-1215，ccaggaaacgtaaatattt(SEQIDNO139)NM_004071-774，catttcgactggatcatat(SEQIDNO140)NM_004071-1216，caggaaacgtaaatatttt(SEQIDNO141)NM_004071-973，ctttggtagtgcaacatat(SEQIDNO142)NM_004071-463，cgtactaagtgcaagatat(SEQIDNO143)(RNAi目標基因)NM_001291，人CDC-樣激酶2(CLK2)(目標序列)NM_001291-202，gtatgaccggcgatactgt(SEQIDNO144)NM_001291-225，gctacagacgcaacgatta(SEQIDNO145)NM_001291-226，ctacagacgcaacgattat(SEQIDNO146)NM_001291-45，ggagttaccgtgaacacta(SEQIDNO147)NM_001291-46，gagttaccgtgaacactat(SEQIDNO148)(RNAi目標基因)NM_001292，人CDC-樣激酶3(CLK3)(目標序列)NM_001292-189，gccgtgacagcgatacata(SEQIDNO149)NM_001292-72，cctacagtcgggaacatga(SEQIDNO150)NM_001292-73，ctacagtcgggaacatgaa(SEQIDNO151)NM_001292-188，cgccgtgacagcgatacat(SEQIDNO152)NM_001292-121，gcctcccccacgaagatct(SEQIDNO153)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_001292-388，ggtgaaggcacctttggca(SEQIDNO154)(RNAi目標基因)NM_020666，人CDC-樣激酶4(CLK4)(目標序列)NM_020666-617，gtattagagcacttaaata(SEQIDNO155)NM_020666-1212，gaaaacgcaagtattttca(SEQIDNO156)NM_020666-1348，cctggttcgaagaatgtta(SEQIDNO157)NM_020666-181，cttgaatgagcgagattat(SEQIDNO158)NM_020666-803，cagatctgccagtcaataa(SEQIDNO159)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_020666-457，cgttctaagagcaagatat(SEQIDNO160)NM_020666-446，caaagtggagacgttctaa(SEQIDNO161)NM_020666-461，ctaagagcaagatatgaaa(SEQIDNO162)(RNAi目標基因)NM_002093，人糖原合酶激酶(glycogensynthasekinase)3beta(GSK3B)(目標序列)NM_002093-326，gtccgattgcgttatttct(SEQIDNO163)NM_002093-307，gctagatcactgtaacata(SEQIDNO164)NM_002093-451，gacgctccctgtgatttat(SEQIDNO165)NM_002093-632，cccaatgtttcgtatatct(SEQIDNO166)NM_002093-623，cgaggagaacccaatgttt(SEQIDNO167)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002093-206，gtatatcaagccaaacttt(SEQIDNO168)NM_002093-195，catttggtgtggtatatca(SEQIDNO169)NM_002093-205，ggtatatcaagccaaactt(SEQIDNO170)(RNAi目標基因)NM_182691，人SFRS蛋白激酶2(SRPK2)(目標序列)NM_182691-1312，gccaaatggacgacataaa(SEQIDNO171)NM_182691-1313，ccaaatggacgacataaaa(SEQIDNO172)NM_182691-1314，caaatggacgacataaaat(SEQIDNO173)NM_182691-1985，ctgatcccgatgttagaaa(SEQIDNO174)NM_182691-233，ggccggtatcatgttatta(SEQIDNO175)(RNAi目標基因)NM_005430，人無翼型MMTV整合位點家族，成員1(Homosapienswingless-typeMMTVintegrationsitefamily，member1)(WNT1)(目標序列)NM_005430-614，ggccgtacgaccgtattct(SEQIDNO176)NM_005430-205，gcgtctgatacgccaaaat(SEQIDNO177)NM_005430-855，cccacgacctcgtctactt(SEQIDNO178)NM_005430-196，caaacagcggcgtctgata(SEQIDNO179)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_005430-875，gagaaatcgcccaacttct(SEQIDNO180)NM_005430-863，ctcgtctacttcgagaaat(SEQIDNO181)NM_005430-860，gacctcgtctacttcgaga(SEQIDNO182)(RNAi目標基因)NM_003391，人無翼型MMTV整合位點家族，成員2(WNT2)(目標序列)NM_003391-111，gggtgatgtgcgataatgt(SEQIDNO183)NM_003391-681，ggaaaacgggcgattatct(SEQIDNO184)NM_003391-764，gctaacgagaggtttaaga(SEQIDNO185)NM_003391-765，ctaacgagaggtttaagaa(SEQIDNO186)NM_003391-295，ggtcctactccgaagtagt(SEQIDNO187)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_003391-797，gacctcgtgtattttgaga(SEQIDNO188)NM_003391-790，gaaaaatgacctcgtgtat(SEQIDNO189)NM_003391-789，cgaaaaatgacctcgtgta(SEQIDNO190)(RNAi目標基因)NM_004625，人無翼型MMTV整合位點家族，成員7A(WNT7A)(目標序列)NM_004625-92，ctgggcgcaagcatcatct(SEQIDNO191)NM_004625-313，gttcacctacgccatcatt(SEQIDNO192)NM_004625-524，gcccggactctcatgaact(SEQIDNO193)NM_004625-480，gcttcgccaaggtctttgt(SEQIDNO194)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_004625-205，cctggacgagtgtcagttt(SEQIDNO195)NM_004625-209，gacgagtgtcagtttcagt(SEQIDNO196)NM_004625-172，catcatcgtcataggagaa(SEQIDNO197)(RNAi目標基因)NM_004626，人無翼型MMTV整合位點家族，成員11(WNT11)(目標序列)NM_004626-543，gatcccaagccaataaact(SEQIDNO198)NM_004626-917，gacagctgcgaccttatgt(SEQIDNO199)NM_004626-915，gcgacagctgcgaccttat(SEQIDNO200)NM_004626-54，ccggcgtgtgctatggcat(SEQIDNO201)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_004626-59，gtgtgctatggcatcaagt(SEQIDNO202)NM_004626-560，ctgatgcgtctacacaaca(SEQIDNO203)NM_004626-562，gatgcgtctacacaacagt(SEQIDNO204)(RNAi目標基因)NM_030753，人無翼型MMTV整合位點家族，成員3(WNT3)(目標序列)NM_030753-417，gctgtgactcgcatcataa(SEQIDNO205)NM_030753-483，ctgacttcggcgtgttagt(SEQIDNO206)NM_030753-485，gacttcggcgtgttagtgt(SEQIDNO207)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_030753-887，gaccggacttgcaatgtca(SEQIDNO208)NM_030753-56，ctcgctggctacccaattt(SEQIDNO209)NM_030753-59，gctggctacccaatttggt(SEQIDNO210)(RNAi目標基因)NM_033131，人無翼型MMTV整合位點家族，成員3A(WNT3A)(目標序列)NM_033131-2，gccccactcggatacttct(SEQIDNO211)NM_033131-3，ccccactcggatacttctt(SEQIDNO212)NM_033131-4，cccactcggatacttctta(SEQIDNO213)NM_033131-77，gctgttgggccacagtatt(SEQIDNO214)NM_033131-821，gaggcctcgcccaacttct(SEQIDNO215)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_033131-168，ggaactacgtggagatcat(SEQIDNO216)NM_033131-50，ggcagctacccgatctggt(SEQIDNO217)NM_033131-165，gcaggaactacgtggagat(SEQIDNO218)(RNAi目標基因)NM_003392，人無翼型MMTV整合位點家族，成員5A(WNT5A)(目標序列)NM_003392-91，gtggtcgctaggtatgaat(SEQIDNO219)NM_003392-93，ggtcgctaggtatgaataa(SEQIDNO220)NM_003392-307，ggataacacctctgttttt(SEQIDNO221)NM_003392-57，ccttcgcccaggttgtaat(SEQIDNO222)NM_003392-87，cttggtggtcgctaggtat(SEQIDNO223)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_003392-163，ccaactggcaggactttct(SEQIDNO224)NM_003392-116，gttcagatgtcagaagtat(SEQIDNO225)NM_003392-102，gtatgaataaccctgttca(SEQIDNO226)(RNAi目標基因)NM_004196，人細胞周期蛋白-依賴的激酶-樣1(Homosapienscyclin-dependentkinase-like1)(CDC2-relatedkinase)(CDKL1)(目標序列)NM_004196-405，cgaaacattccgtgattaa(SEQIDNO227)NM_004196-305，ctcgtgaagagcataactt(SEQIDNO228)NM_004196-458，ggaccgagtgactactata(SEQIDNO229)NM_004196-844，gttgcatcacccatatttt(SEQIDNO230)NM_004196-330，cactgcaagctgtaaattt(SEQIDNO231)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_004196-119，gatgaccctgtcataaaga(SEQIDNO232)(RNAi目標基因)NM_003948，人細胞周期蛋白-依賴的激酶-樣2(CDC2-相關的激酶)(CDKL2)(目標序列)NM_003948-623，gatcagctatatcatatta(SEQIDNO233)NM_003948-1379，ccatcaggcatttataaca(SEQIDNO234)NM_003948-1380，catcaggcatttataacat(SEQIDNO235)NM_003948-768，ctgaagtggtgatagattt(SEQIDNO236)NM_003948-626，cagctatatcatattatga(SEQIDNO237)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_003948-325，gattattaatggaattgga(SEQIDNO238)NM_003948-1012，ggtacaggataccaatgct(SEQIDNO239)(RNAi目標基因)NM_016508，人細胞周期蛋白-依賴的激酶-樣3(CDKL3)(目標序列)NM_016508-498，gagctcccgaattagtatt(SEQIDNO240)NM_016508-500，gctcccgaattagtattaa(SEQIDNO241)NM_016508-1290，cacccatcaatctaactaa(SEQIDNO242)NM_016508-1301，ctaactaacagtaatttga(SEQIDNO243)NM_016508-501，ctcccgaattagtattaaa(SEQIDNO244)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_016508-785，gttcatgcttgtttacaaa(SEQIDNO245)NM_016508-555，ctttgggctgtatgatcat(SEQIDNO246)NM_016508-776，gcagatatagttcatgctt(SEQIDNO247)(RNAi目標基因)NM_002745，人有絲分裂原活化的蛋白激酶1(MAPK1)(目標序列)NM_002745-746，gaagacctgaattgtataa(SEQIDNO248)NM_002745-276，caaccatcgagcaaatgaa(SEQIDNO249)NM_002745-849，ccaaagctctggacttatt(SEQIDNO250)NM_002745-749，gacctgaattgtataataa(SEQIDNO251)NM_002745-113，gtgtgctctgcttatgata(SEQIDNO252)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002745-220，cttactgcgcttcagacat(SEQIDNO253)NM_002745-228，gcttcagacatgagaacat(SEQIDNO254)NM_002745-224，ctgcgcttcagacatgaga(SEQIDNO255)(RNAi目標基因)NM_016231，人nemo-樣激酶(Homosapiensnemo-likekinase)(NLK)(目標序列)NM_016231-450，gagtagcgctcaaaaagat(SEQIDNO256)NM_016231-1074，gcgctaaggcacatatact(SEQIDNO257)NM_016231-962，ctactaggacgaagaatat(SEQIDNO258)NM_016231-579，ctccacacattgactattt(SEQIDNO259)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_016231-703，gattttgcgaggtttgaaa(SEQIDNO260)NM_016231-1382，gtccgacaggttaaagaaa(SEQIDNO261)NM_016231-1384，ccgacaggttaaagaaatt(SEQIDNO262)(RNAi目標基因)NM_001315，人有絲分裂原活化的蛋白激酶14(MAPK14)(目標序列)NM_001315-401，ctccgaggtctaaagtata(SEQIDNO263)NM_001315-403，ccgaggtctaaagtatata(SEQIDNO264)NM_001315-251，ggtctgttggacgttttta(SEQIDNO265)NM_001315-212，ctgcggttacttaaacata(SEQIDNO266)NM_001315-405，gaggtctaaagtatataca(SEQIDNO267)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_001315-664，gtttcctggtacagaccat(SEQIDNO268)(RNAi目標基因)NM_002751，人有絲分裂原活化的蛋白激酶11(MAPK11)(目標序列)NM_002751-366，gcgacgagcacgttcaatt(SEQIDNO269)NM_002751-667，cccgggaagcgactacatt(SEQIDNO270)NM_002751-669，cgggaagcgactacattga(SEQIDNO271)NM_002751-731，gaggttctggcaaaaatct(SEQIDNO272)NM_002751-729，ctgaggttctggcaaaaat(SEQIDNO273)(RNAi目標基因)NM_002969，人有絲分裂原活化的蛋白激酶12(MAPK12)(目標序列)NM_002969-1018，gaagcgtgttacttacaaa(SEQIDNO274)NM_002969-262，gctgctggacgtattcact(SEQIDNO275)NM_002969-1017，ggaagcgtgttacttacaa(SEQIDNO276)NM_002969-578，cccgaggtcatcttgaatt(SEQIDNO277)NM_002969-1013，gaatggaagcgtgttactt(SEQIDNO278)(RNAi目標基因)NM_002754，人有絲分裂原活化的蛋白激酶13(MAPK13)(目標序列)NM_002754-164，ctgagccgaccctttcagt(SEQIDNO279)NM_002754-174，cctttcagtccgagatctt(SEQIDNO280)NM_002754-978，ccttagaacacgagaaact(SEQIDNO281)NM_002754-285，ccctgcgcaacttctatga(SEQIDNO282)NM_002754-287，ctgcgcaacttctatgact(SEQIDNO283)(RNAi目標基因)NM_139049，人有絲分裂原活化的蛋白激酶8(MAPK8)(目標序列)NM_139049-449，gacttaaagcccagtaata(SEQIDNO284)NM_139049-213，gagagctagttcttatgaa(SEQIDNO285)NM_139049-451，cttaaagcccagtaatata(SEQIDNO286)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_139049-525，caggaacgagttttatgat(SEQIDNO287)NM_139049-524，gcaggaacgagttttatga(SEQIDNO288)NM_139049-283，gaaatccctagaagaattt(SEQIDNO289)(RNAi目標基因)NM_002752，人有絲分裂原活化的蛋白激酶9(MAPK9)(目標序列)NM_002752-116，gtttgtgctgcatttgata(SEQIDNO290)NM_002752-204，gagcttatcgtgaacttgt(SEQIDNO291)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002752-878，gccagagatctgttatcaa(SEQIDNO292)NM_002752-879，ccagagatctgttatcaaa(SEQIDNO293)NM_002752-880，cagagatctgttatcaaaa(SEQIDNO294)(RNAi目標基因)NM_002753，人有絲分裂原活化的蛋白激酶10(MAPK10)(目標序列)NM_002753-668，gtggtgacacgttattaca(SEQIDNO295)NM_002753-957，cggactccgagcacaataa(SEQIDNO296)NM_002753-958，ggactccgagcacaataaa(SEQIDNO297)NM_002753-811，gtggaataaggtaattgaa(SEQIDNO298)NM_002753-1212，ctaaaaatggtgtagtaaa(SEQIDNO299)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002753-1167，ggaaagaacttatctacaa(SEQIDNO300)NM_002753-584，gtagtcaagtctgattgca(SEQIDNO301)NM_002753-761，gaaatggttcgccacaaaa(SEQIDNO302)(RNAi目標基因)NM_001786，人細胞分裂中期2，G1到S以及G2到M(Homosapienscelldivisioncycle2，G1toSandG2toM)(CDC2)(目標序列)NM_001786-782，gatttgctctcgaaaatgt(SEQIDNO303)NM_001786-788，ctctcgaaaatgttaatct(SEQIDNO304)NM_001786-658，gggcactcccaataatgaa(SEQIDNO305)NM_001786-696，ctttacaggactataagaa(SEQIDNO306)NM_001786-562，gagtataggcaccatattt(SEQIDNO307)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_001786-869，gacaatcagattaagaaga(SEQIDNO308)(RNAi目標基因)NM_001798，人細胞周期蛋白依賴的激酶2(Homosapienscyclin-dependentkinase2)(CDK2)(目標序列)NM_001798-224，ctctacctggtttttgaat(SEQIDNO309)NM_001798-690，cttctatgcctgattacaa(SEQIDNO310)NM_001798-770，gatggacggagcttgttat(SEQIDNO311)NM_001798-226，ctacctggtttttgaattt(SEQIDNO312)NM_001798-36，gcacgtacggagttgtgta(SEQIDNO313)(RNAi目標基因)NM_000075，人細胞周期蛋白依賴的激酶4(CDK4)(目標序列)NM_000075-45，cctatgggacagtgtacaa(SEQIDNO314)NM_000075-616，gatgtttcgtcgaaagcct(SEQIDNO315)NM_000075-161，cgtgaggtggctttactga(SEQIDNO316)NM_000075-35，ggtgtcggtgcctatggga(SEQIDNO317)NM_000075-242，cgaactgaccgggagatca(SEQIDNO318)(RNAi目標基因)NM_052984，人細胞周期蛋白依賴的激酶4(CDK4)，轉錄物變體2，mRNA.，228..563，0(目標序列)NM_052984-248，gaccgggagatcaagagat(SEQIDNO319)NM_052984-251，cgggagatcaagagatgtt(SEQIDNO320)(RNAi目標基因)NM_001799，人細胞周期蛋白依賴的激酶7(MO15同源物，爪蟾(Xenopuslaevis)，cdk-活化性激酶)(CDK7)(目標序列)NM_001799-242，ggacataaatctaatatta(SEQIDNO321)NM_001799-104，caaattgtcgccattaaga(SEQIDNO322)NM_001799-490，ccccaatagagcttataca(SEQIDNO323)NM_001799-20，cgggcaaagcgttatgaga(SEQIDNO324)NM_001799-21，gggcaaagcgttatgagaa(SEQIDNO325)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_001799-345，cctacatgttgatgactct(SEQIDNO326)(RNAi目標基因)NM_000455，人絲氨酸/蘇氨酸激酶11(Peutz-Jegherssyndrome)(STK11)(目標序列)NM_000455-306，ggaggttacggcacaaaaa(SEQIDNO327)NM_000455-307，gaggttacggcacaaaaat(SEQIDNO328)NM_000455-309，ggttacggcacaaaaatgt(SEQIDNO329)NM_000455-1157，cccaaggccgtgtgtatga(SEQIDNO330)NM_000455-1158，ccaaggccgtgtgtatgaa(SEQIDNO331)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_000455-916，cagctggttccggaagaaa(SEQIDNO332)(RNAi目標基因)NM_001274，人CHK1檢驗點同源物(HomosapiensCHK1checkpointhomolog)(粟酒裂殖酵母(S.pombe))(CHEK1)(目標序列)NM_001274-456，cagtatttcggtataataa(SEQIDNO333)NM_001274-361，gcatggtattggaataact(SEQIDNO334)NM_001274-990，gcccctcatacattgataa(SEQIDNO335)NM_001274-1038，ccacatgtcctgatcatat(SEQIDNO336)NM_001274-227，ggcaatatccaatatttat(SEQIDNO337)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_001274-573，ggtcctgtggaatagtact(SEQIDNO338)NM_001274-416，gaaagggataacctcaaaa(SEQIDNO339)NM_001274-577，ctgtggaatagtacttact(SEQIDNO340)(RNAi目標基因)NM_002648，人pim-1癌基因(Homosapienspim-1oncogene)(PIM1)(目標序列)NM_002648-831，ggccaaccttcgaagaaat(SEQIDNO341)NM_002648-601，cgatgggacccgagtgtat(SEQIDNO342)NM_002648-602，gatgggacccgagtgtata(SEQIDNO343)NM_002648-293，ggtttctccggcgtcatta(SEQIDNO344)NM_002648-834，caaccttcgaagaaatcca(SEQIDNO345)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002648-96，ccctggagtcgcagtacca(SEQIDNO346)NM_002648-203，gtggagaaggaccggattt(SEQIDNO347)(RNAi目標基因)NM_006875，人pim-2癌基因(PIM2)(目標序列)NM_006875-698，ggggacattccctttgaga(SEQIDNO348)NM_006875-242，ctcgaagtcgcactgctat(SEQIDNO349)NM_006875-245，gaagtcgcactgctatgga(SEQIDNO350)NM_006875-499，gaacatcctgatagaccta(SEQIDNO351)NM_006875-468，gtggagttgtccatcgtga(SEQIDNO352)(RNAi目標基因)NM_021643，人tribbles同源物2(Homosapienstribbleshomolog2)(TRB2)(目標序列)NM_021643-174，cttgtatcgggaaatactt(SEQIDNO353)NM_021643-71，gaagagttgtcgtctataa(SEQIDNO354)NM_021643-177，gtatcgggaaatacttatt(SEQIDNO355)NM_021643-524，ctcaagctgcggaaattca(SEQIDNO356)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_021643-41，gggagatcgcggaacaaaa(SEQIDNO357)NM_021643-382，gttctttgagcgaagctat(SEQIDNO358)NM_021643-143，cccgagactccgaacttgt(SEQIDNO359)(RNAi目標基因)NM_007118，人三重功能結構域(Homosapienstriplefunctionaldomain)(PTPRF相互作用型)(TRIO)(目標序列)NM_007118-1684，caccaatgcggataaatta(SEQIDNO360)NM_007118-1686，ccaatgcggataaattact(SEQIDNO361)NM_007118-3857，gaaatctacgaatttcata(SEQIDNO362)NM_007118-6395，gagcagatcgtcatattca(SEQIDNO363)NM_007118-8531，cctatccgtagcattaaaa(SEQIDNO364)(RNAi目標基因)NM_004938，人死亡相關蛋白激酶1(Homosapiensdeath-associatedproteinkinase1)(DAPK1)(目標序列)NM_004938-917，caatccgttcgcttgatat(SEQIDNO365)NM_004938-1701，ggtgtttcgtcgattatca(SEQIDNO366)NM_004938-1702，gtgtttcgtcgattatcaa(SEQIDNO367)NM_004938-2824，gaaggtacttcgaaatcat(SEQIDNO368)NM_004938-668，gaaacgttagcaaatgtat(SEQIDNO369)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_004938-609，gggtaataacctatatcct(SEQIDNO370)NM_004938-2697，gaggcgagtttggatatga(SEQIDNO371)NM_004938-490，ggcccataaaattgacttt(SEQIDNO372)(RNAi目標基因)NM_006252，人蛋白激酶，AMP活化的，α2催化亞基(Homosapiensproteinkinase，AMP-activated，alpha2catalyticsubunit)(PRKAA2)(目標序列)NM_006252-760，gaaacgagcaactatcaaa(SEQIDNO373)NM_006252-148，gaagattcgcagtttagat(SEQIDNO374)NM_006252-1227，gcaaaccgtatgacattat(SEQIDNO375)NM_006252-1338，ctggcaattacgtgaaaat(SEQIDNO376)NM_006252-1340，ggcaattacgtgaaaatga(SEQIDNO377)(RNAi目標基因)NM_002742，人蛋白激酶C，μ(PRKCM)(目標序列)NM_002742-508，ggtacgtcaaggtcttaaa(SEQIDNO378)NM_002742-1332，gattggatagcaaatgtat(SEQIDNO379)NM_002742-509，gtacgtcaaggtcttaaat(SEQIDNO380)NM_002742-370，ggaaggcgatcttattgaa(SEQIDNO381)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002742-1913，caccctggtgttgtaaatt(SEQIDNO382)NM_002742-2041，cataacgaagtttttaatt(SEQIDNO383)NM_002742-2521，ctatcagacctggttagat(SEQIDNO384)(RNAi目標基因)NM_003684，人MAP激酶-相互作用型絲氨酸/蘇氨酸激酶1(HomosapiensMAPkinase-interactingserine/threoninekinase1)(MKNK1)(目標序列)NM_003684-218，gagtatgccgtcaaaatca(SEQIDNO385)NM_003684-229，caaaatcatcgagaaacaa(SEQIDNO386)NM_003684-344，gatgacacaaggttttact(SEQIDNO387)NM_003684-192，gtgccgtgagcctacagaa(SEQIDNO388)NM_003684-379，gcaaggaggttccatctta(SEQIDNO389)(RNAi目標基因)NM_004759，人有絲分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(Homosapiensmitogen-activatedproteinkinase-activatedproteinkinase)2(MAPKAPK2)(目標序列)NM_004759-942，ccatcaccgagtttatgaa(SEQIDNO390)NM_004759-836，cgaatgggccagtatgaat(SEQIDNO391)NM_004759-563，cctgagaatctcttataca(SEQIDNO392)NM_004759-669，gttatacaccgtactatgt(SEQIDNO393)NM_004759-362，gatgtgtacgagaatctgt(SEQIDNO394)(RNAi目標基因)NM_172171，人鈣/鈣調蛋白-依賴的蛋白激酶(Homosapienscalcium/calmodulin-dependentproteinkinase)(CaM激酶)IIγ(CAMK2G)(目標序列)NM_172171-113，gagtacgcagcaaaaatca(SEQIDNO395)NM_172171-422，ctgctgctggcgagtaaat(SEQIDNO396)NM_172171-1075，ggtacacaacgctacagat(SEQIDNO397)NM_172171-474，gcctagccatcgaagtaca(SEQIDNO398)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_172171-425，ctgctggcgagtaaatgca(SEQIDNO399)NM_172171-260，ctcgtgtttgaccttgtta(SEQIDNO400)NM_172171-597，gcggggtcatcctgtatat(SEQIDNO401)(RNAi目標基因)NM_015981，人鈣/鈣調蛋白-依賴的蛋白激酶(CaM激酶)IIα(CAMK2A)(目標序列)NM_015981-1213，ccatcgattctattttgaa(SEQIDNO402)NM_015981-1210，cttccatcgattctatttt(SEQIDNO403)NM_015981-1067，cggaaacaggaaattataa(SEQIDNO404)NM_015981-1066，gcggaaacaggaaattata(SEQIDNO405)NM_015981-754，gaccattaacccatccaaa(SEQIDNO406)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_015981-1130，gagtcctacacgaagatgt(SEQIDNO407)NM_015981-1416，ggcagatcgtccacttcca(SEQIDNO408)NM_015981-1418，cagatcgtccacttccaca(SEQIDNO409)(RNAi目標基因)NM_020439，人鈣/鈣調蛋白-依賴的蛋白激酶IG(CAMK1G)(目標序列)NM_020439-1354，ggtcatggtaccagttaaa(SEQIDNO410)NM_020439-1409，ggagtctgtctcattatgt(SEQIDNO411)NM_020439-639，gtggataccccccattcta(SEQIDNO412)NM_020439-823，ctggattgacggaaacaca(SEQIDNO413)NM_020439-662，gaaacggagtctaagcttt(SEQIDNO414)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_020439-85，gggatcaggagctttctca(SEQIDNO415)NM_020439-903，gcaagtggaggcaagcctt(SEQIDNO416)(RNAi目標基因)NM_007194，人CHK2檢驗點同源物(HomosapiensCHK2checkpointhomolog)(粟酒裂殖酵母(S.pombe))(CHEK2)(目標序列)NM_007194-460，ctcttacattgcatacata(SEQIDNO417)NM_007194-201，ctcaggaactctattctat(SEQIDNO418)NM_007194-1233，gtttaggagttattctttt(SEQIDNO419)NM_007194-398，gataaataccgaacataca(SEQIDNO420)NM_007194-396，cagataaataccgaacata(SEQIDNO421)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_007194-614，gtagatgatcagtcagttt(SEQIDNO422)NM_007194-620，gatcagtcagtttatccta(SEQIDNO423)NM_007194-612，ctgtagatgatcagtcagt(SEQIDNO424)(RNAi目標基因)NM_002610，人丙酮酸脫氫酶激酶，同功酶1(Homosapienspyruvatedehydrogenasekinase，isoenzyme1)(PDK1)(目標序列)NM_002610-1194，gactcccagtgtataacaa(SEQIDNO425)NM_002610-553，catgagtcgcatttcaatt(SEQIDNO426)NM_002610-306，ggacaccatccgttcaatt(SEQIDNO427)NM_002610-1086，gtctttacgcacaatactt(SEQIDNO428)NM_002610-388，ggatgctaaagctatttat(SEQIDNO429)(RNAi目標基因)NM_001619，人腎上腺素，β，受體激酶1(Homosapiensadrenergic，beta，receptorkinase1)(ADRBK1)(目標序列)NM_001619-474，gggacgtgttccagaaatt(SEQIDNO430)NM_001619-317，gagatcttcgactcataca(SEQIDNO431)NM_001619-665，gacaaaaagcgcatcaaga(SEQIDNO432)NM_001619-439，gccatacatcgaagagatt(SEQIDNO433)NM_001619-476，gacgtgttccagaaattca(SEQIDNO434)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_001619-1476，caaaaggaatcaagttact(SEQIDNO435)NM_001619-1474，cacaaaaggaatcaagtta(SEQIDNO436)NM_001619-1171，ccggcagcacaagaccaaa(SEQIDNO437)(RNAi目標基因)NM_005160，人腎上腺素，β，受體激酶2(ADRBK2)(目標序列)NM_005160-1779，gagagtcccggcaaaattt(SEQIDNO438)NM_005160-1778，ggagagtcccggcaaaatt(SEQIDNO439)NM_005160-1373，cagcatgtctacttacaaa(SEQIDNO440)NM_005160-307，cagaagtcgacaaatttat(SEQIDNO441)NM_005160-306，gcagaagtcgacaaattta(SEQIDNO442)(RNAi目標基因)NM_003161，人核糖體蛋白S6激酶(HomosapiensribosomalproteinS6kinase)，70kDa，多肽1(RPS6KB1)(目標序列)NM_003161-1294，ccgatcacctcgaagattt(SEQIDNO443)NM_003161-1556，cacctgcgtatgaatctat(SEQIDNO444)NM_003161-1296，gatcacctcgaagatttat(SEQIDNO445)NM_003161-831，gtttgggagcattaatgta(SEQIDNO446)NM_003161-1295，cgatcacctcgaagattta(SEQIDNO447)(RNAi目標基因)NM_014496，人核糖體蛋白S6激酶，90kDa，多肽6(RPS6KA6)(目標序列)NM_014496-682，gaaggcttactcattttgt(SEQIDNO448)NM_014496-1552，ggaggctagtgatatacta(SEQIDNO449)NM_014496-1553，gaggctagtgatatactat(SEQIDNO450)NM_014496-1551，gggaggctagtgatatact(SEQIDNO451)NM_014496-1481，cttgttacggatttaatga(SEQIDNO452)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_014496-831，gaaatgagaccatgaatat(SEQIDNO453)NM_014496-1411，gatgcgctatggacaacat(SEQIDNO454)NM_014496-927，ggaatccagcaaatagatt(SEQIDNO455)(RNAi目標基因)NM_002953，人核糖體蛋白S6激酶，90kDa，多肽1(RPS6KA1)(目標序列)NM_002953-739，ctatggggtgttgatgttt(SEQIDNO456)NM_002953-1331，gctgtcaaggtcattgata(SEQIDNO457)NM_002953-1332，ctgtcaaggtcattgataa(SEQIDNO458)NM_002953-735，ggtcctatggggtgttgat(SEQIDNO459)NM_002953-738，cctatggggtgttgatgtt(SEQIDNO460)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002953-666，gcgggacagtggagtacat(SEQIDNO461)NM_002953-832，gctaggcatgccccagttt(SEQIDNO462)NM_002953-1315，caccaacatggagtatgct(SEQIDNO463)(RNAi目標基因)NM_001626，人v-akt鼠胸腺瘤病毒癌基因同源物2(Homosapiensv-aktmurinethymomaviraloncogenehomolog2)(AKT2)(目標序列)NM_001626-141，ctctaccccccttaaacaa(SEQIDNO464)NM_001626-35，cacaagcgtggtgaataca(SEQIDNO465)NM_001626-143，ctaccccccttaaacaact(SEQIDNO466)NM_001626-41，cgtggtgaatacatcaaga(SEQIDNO467)NM_001626-420，gcaaggcacgggctaaagt(SEQIDNO468)(RNAi目標基因)NM_005163，人v-akt鼠胸腺瘤病毒癌基因同源物1(AKT1)(目標序列)NM_005163-1294，gactgacaccaggtatttt(SEQIDNO469)NM_005163-1296，ctgacaccaggtattttga(SEQIDNO470)NM_005163-1292，gagactgacaccaggtatt(SEQIDNO471)NM_005163-751，cttctatggcgctgagatt(SEQIDNO472)NM_005163-630，cagccctgaagtactcttt(SEQIDNO473)(RNAi目標基因)NM_005465，人v-akt鼠胸腺瘤病毒癌基因同源物3(蛋白激酶B，γ)(AKT3)(目標序列)NM_005465-229，ccagtggactactgttata(SEQIDNO474)NM_005465-99，cattcataggatataaaga(SEQIDNO475)NM_005465-402，cctctacaacccatcataa(SEQIDNO476)NM_005465-1283，gagacagatactagatatt(SEQIDNO477)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_005465-733，ggaccgcacacgtttctat(SEQIDNO478)NM_005465-1317，cagctcagactattacaat(SEQIDNO479)NM_005465-1319，gctcagactattacaataa(SEQIDNO480)(RNAi目標基因)NM_005627，人血清/糖皮質激素調節的激酶(Homosapiensserum/glucocorticoidregulatedkinase)(SGK)(目標序列)NM_005627-875，ggcctgccgcctttttata(SEQIDNO481)NM_005627-97，gggtctgaacgactttatt(SEQIDNO482)NM_005627-99，gtctgaacgactttattca(SEQIDNO483)NM_005627-190，ggagcctgagcttatgaat(SEQIDNO484)NM_005627-413，gaggagaagcatattatgt(SEQIDNO485)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_005627-649，catcgtttatagagactta(SEQIDNO486)NM_005627-367，ctatgcagtcaaagtttta(SEQIDNO487)NM_005627-307，gatcggaaagggcagtttt(SEQIDNO488)(RNAi目標基因)NM_170693，人血清/糖皮質激素調節的激酶2(SGK2)(目標序列)NM_170693-163，gtctgatggggcgttctat(SEQIDNO489)NM_170693-840，cagactttcttgagattaa(SEQIDNO490)NM_170693-842，gactttcttgagattaaga(SEQIDNO491)NM_170693-582，gtggtacccctgagtactt(SEQIDNO492)NM_170693-183，cagtgaaggtactacagaa(SEQIDNO493)(Targetsequenceeffectiveformousehomolog)NM_170693-287，gtgggcctgcgctactcct(SEQIDNO494)(RNAi目標基因)NM_013257，人血清/糖皮質激素調節的激酶-樣(SGKL)(目標序列)NM_013257-273，caggactaaacgaattcat(SEQIDNO495)NM_013257-944，gacaccactaccacatttt(SEQIDNO496)NM_013257-1388，gtatcttctgactattcta(SEQIDNO497)NM_013257-946，caccactaccacattttgt(SEQIDNO498)NM_013257-790，gttttacgctgctgaaatt(SEQIDNO499)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_013257-693，caactgaaaagctttattt(SEQIDNO500)NM_013257-225，gaatatttggtgataattt(SEQIDNO501)NM_013257-38，ccaagtgtaagcattccca(SEQIDNO502)(RNAi目標基因)NM_002744，人蛋白激酶C(HomosapiensproteinkinaseC)，zeta(PRKCZ)(目標序列)NM_002744-1233，gcggaaccccgaattacat(SEQIDNO503)NM_002744-398，caagccaagcgctttaaca(SEQIDNO504)NM_002744-1447，caaagcctcccatgtttta(SEQIDNO505)NM_002744-823，ccaaatttacgccatgaaa(SEQIDNO506)NM_002744-1100，cacgagagggggatcatct(SEQIDNO507)(RNAi目標基因)NM_006254，人蛋白激酶C，δ(PRKCD)(目標序列)NM_006254-1524，gcggcacccctgactatat(SEQIDNO508)NM_006254-1339，ctaccgtgccacgttttat(SEQIDNO509)NM_006254-992，gggacctacggcaagatct(SEQIDNO510)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_006254-172，gttcgacgcccacatctat(SEQIDNO511)NM_006254-659，cagaaagaacgcttcaaca(SEQIDNO512)NM_006254-761，gtgaagcagggattaaagt(SEQIDNO513)(RNAi目標基因)NM_002737，人蛋白激酶C，α(PRKCA)(目標序列)NM_002737-1571，ggcgtcctgttgtatgaaa(SEQIDNO514)NM_002737-393，gtgacacctgcgatatgaa(SEQIDNO515)NM_002737-711，gacgactgtctgtagaaat(SEQIDNO516)NM_002737-1085，gaactgtatgcaatcaaaa(SEQIDNO517)NM_002737-1924，gctggttattgctaacata(SEQIDNO518)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002737-1958，gaagggttctcgtatgtca(SEQIDNO519)NM_002737-1835，ccattcaagcccaaagtgt(SEQIDNO520)NM_002737-1234，gctgtacttcgtcatggaa(SEQIDNO521)(RNAi目標基因)NM_002738，人蛋白激酶C，β1(PRKCB1)(目標序列)NM_002738-573，cagatccctacgtaaaact(SEQIDNO522)NM_002738-1791，catttttccggtatattga(SEQIDNO523)NM_002738-1384，catttaccgtgacctaaaa(SEQIDNO524)NM_002738-575，gatccctacgtaaaactga(SEQIDNO525)NM_002738-1315，ggagccccatgctgtattt(SEQIDNO526)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002738-1006，gatgaaactgaccgatttt(SEQIDNO527)NM_002738-1961，gaattcgaaggattttcct(SEQIDNO528)NM_002738-1233，ccatggaccgcctgtactt(SEQIDNO529)(RNAi目標基因)NM_015282，人細胞質接頭結合的蛋白(Homosapienscytoplasmiclinkerassociatedprotein)1(CLASP1)(目標序列)NM_015282-2447，gagccgtatgggatgtatt(SEQIDNO530)NM_015282-4151，gccgagctgacgattatga(SEQIDNO531)NM_015282-4152，ccgagctgacgattatgaa(SEQIDNO532)NM_015282-1786，gcgatctcgaagtgatatt(SEQIDNO533)NM_015282-635，cagtcccggttgaatgtaa(SEQIDNO534)(RNAi目標基因)NM_006287，人組織因子途徑抑制物(脂蛋白結合的凝固抑制物)(Homosapienstissuefactorpathwayinhibitor(lipoprotein-associatedcoagulationinhibitor))(TFPI)(目標序列)NM_006287-225，ctcgacagtgcgaagaatt(SEQIDNO535)NM_006287-227，cgacagtgcgaagaattta(SEQIDNO536)NM_006287-228，gacagtgcgaagaatttat(SEQIDNO537)NM_006287-230，cagtgcgaagaatttatat(SEQIDNO538)NM_006287-393，gaatatgtcgaggttatat(SEQIDNO539)(RNAi目標基因)NM_004073，人細胞因子誘導型激酶(Homosapienscytokine-induciblekinase)(CNK)(目標序列)NM_004073-1283，gttgactactccaataagt(SEQIDNO540)NM_004073-138，gcgcctacgctgtcaaagt(SEQIDNO541)NM_004073-239，cgccacatcgtgcgttttt(SEQIDNO542)NM_004073-1281，gggttgactactccaataa(SEQIDNO543)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_004073-192，gcgagaagatcctaaatga(SEQIDNO544)NM_004073-183，cgcatcagcgcgagaagat(SEQIDNO545)NM_004073-190，gcgcgagaagatcctaaat(SEQIDNO546)(RNAi目標基因)NM_003384，人痘苗病毒相關的激酶(Homosapiensvacciniarelatedkinase)1(VRK1)(目標序列)NM_003384-776，ccttgggaggataatttga(SEQIDNO547)NM_003384-773，cttccttgggaggataatt(SEQIDNO548)NM_003384-195，caccttgtgttgtaaaagt(SEQIDNO549)NM_003384-777，cttgggaggataatttgaa(SEQIDNO550)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_003384-372，gttacaggtttatgataat(SEQIDNO551)NM_003384-463，gcagctaagcttaagaatt(SEQIDNO552)NM_003384-977，ggactaaaagctataggaa(SEQIDNO553)(RNAi目標基因)NM_006296，人痘苗病毒相關的激酶2(VRK2)(目標序列)NM_006296-366，gactaggaatagatttaca(SEQIDNO554)NM_006296-165，caagacatgtagtaaaagt(SEQIDNO555)NM_006296-874，ggtatgtgctcatagttta(SEQIDNO556)NM_006296-541，ggtttatcttgcagattat(SEQIDNO557)NM_006296-113，ggatttggattgatatatt(SEQIDNO558)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_006296-560，ggactttcctacagatatt(SEQIDNO559)NM_006296-626，cataatgggacaatagagt(SEQIDNO560)NM_006296-568，ctacagatattgtcccaat(SEQIDNO561)(RNAi目標基因)NM_004672，人有絲分裂原活化的蛋白激酶激酶激酶(Homosapiensmitogen-activatedproteinkinasekinasekinase)6(MAP3K6)(目標序列)NM_004672-2221，ctttctcctccgaactttt(SEQIDNO562)NM_004672-1489，gatgttggagtttgattat(SEQIDNO563)NM_004672-814，caaagagctccggctaata(SEQIDNO564)NM_004672-51，ccctgcgggaggatgtttt(SEQIDNO565)NM_004672-503，gccgagcagcataatgtct(SEQIDNO566)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_004672-442，ggactactcggccatcatt(SEQIDN0567)NM_004672-277，ctatttccgggagaccatt(SEQIDNO568)NM_004672-1929，ggctgctcaagatttctga(SEQIDNO569)(RNAi目標基因)NM_005923，人有絲分裂原活化的蛋白激酶激酶激酶5(MAP3K5)(目標序列)NM_005923-3294，gatccactgaccgaaaaat(SEQIDNO570)NM_005923-838，caggaaagctcgtaattta(SEQIDNO571)NM_005923-840，ggaaagctcgtaatttata(SEQIDNO572)NM_005923-1525，gtacctcaagtctattgta(SEQIDNO573)NM_005923-2517，ctggtaccctccagtatat(SEQIDNO574)(RNAi目標基因)NM_020998，人巨噬細胞刺激1(肝細胞生長因子樣)(Homosapiensmacrophagestimulating1(hepatocytegrowthfactor-like))(MST1)(目標序列)NM_020998-943，ccgatttacgccagaaaaa(SEQIDNO575)NM_020998-944，cgatttacgccagaaaaat(SEQIDNO576)NM_020998-945，gatttacgccagaaaaata(SEQIDNO577)NM_020998-698，ggtctggacgacaactatt(SEQIDNO578)NM_020998-1827，ccaaaggtacgggtaatga(SEQIDNO579)(RNAi目標基因)NM_003576，人絲氨酸/蘇氨酸激酶(Homosapiensserine/threoninekinase)24(STE20同源物，酵母)(STK24)(目標序列)NM_003576-348，gctccgcactagatctatt(SEQIDNO580)NM_003576-349，ctccgcactagatctatta(SEQIDNO581)NM_003576-351，ccgcactagatctattaga(SEQIDNO582)NM_003576-352，cgcactagatctattagaa(SEQIDNO583)NM_003576-437，ctccattcggagaagaaaa(SEQIDNO584)(Targetsequenceeffectiveformousehomolog)NM_003576-148，gttcaaaggcattgacaat(SEQIDNO585)(RNAi目標基因)NM_016542，人Mst3和SOK1-相關的激酶(HomosapiensMst3andSOK1-relatedkinase)(MST4)(目標序列)NM_016542-857，ctgatagatcgttttaaga(SEQIDNO586)NM_016542-139，gcaagtcgttgctattaaa(SEQIDNO587)NM_016542-1133，gaagaactcgagaaaagta(SEQIDNO588)NM_016542-556，ggctcctgaagttattcaa(SEQIDNO589)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_016542-613，gggaattactgctattgaa(SEQIDNO590)NM_016542-669，caatgagagttctgtttct(SEQIDNO591)NM_016542-1063，gataatcacacctgcattt(SEQIDNO592)(RNAi目標基因)NM_002576，人p21/Cdc42/Rac1-活化的激酶(Homosapiensp21/Cdc42/Rac1-activatedkinase)1(STE20同源物，酵母)(PAK1)(目標序列)NM_002576-38，gcccctccgatgagaaata(SEQIDNO593)NM_002576-788，ggcgatcctaagaagaaat(SEQIDNO594)NM_002576-3，caaataacggcctagacat(SEQIDNO595)NM_002576-154，ccgattttaccgatccatt(SEQIDNO596)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002576-1020，gggttgttatggaatactt(SEQIDNO597)NM_002576-1165，catcaagagtgacaatatt(SEQIDNO598)NM_002576-1015，gctgtgggttgttatggaa(SEQIDNO599)(RNAi目標基因)NM_002577，人p21(CDKN1A)-活化的激酶(Homosapiensp21(CDKN1A)-activatedkinase)2(PAK2)(目標序列)NM_002577-721，cataggtgaccctaagaaa(SEQIDNO600)NM_002577-908，cccaacatcgttaactttt(SEQIDNO601)NM_002577-909，ccaacatcgttaacttttt(SEQIDNO602)NM_002577-557，ccggatcatacgaaatcaa(SEQIDNO603)NM_002577-558，cggatcatacgaaatcaat(SEQIDNO604)(RNAi目標基因)NM_002578，人p21(CDKN1A)-活化的激酶3(PAK3)(目標序列)NM_002578-458，catccttcgagtacaaaaa(SEQIDNO605)NM_002578-1467，ctgtattccgtgacttttt(SEQIDNO606)NM_002578-1469，gtattccgtgactttttaa(SEQIDNO607)NM_002578-706，cacagatcggcaaagaaaa(SEQIDNO608)NM_002578-3，ctgacggtctggataatga(SEQIDNO609)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002578-1376，cccccttaccttaatgaaa(SEQIDNO610)NM_002578-219，cagactttgagcatacgat(SEQIDNO611)NM_002578-254，gcagtcaccggggaattca(SEQIDNO612)(RNAi目標基因)NM_005884，人p21(CDKN1A)-活化的激酶4(PAK4)(目標序列)NM_005884-1502，gggataatggtgattgaga(SEQIDNO613)NM_005884-1503，ggataatggtgattgagat(SEQIDNO614)NM_005884-883，gccacagcgagtatcccat(SEQIDNO615)NM_005884-77，cagcacgagcagaagttca(SEQIDNO616)NM_005884-1494，ggtcgctggggataatggt(SEQIDNO617)(RNAi目標基因)NM_002755，人有絲分裂原活化的蛋白激酶激酶1(MAP2K1)(目標序列)NM_002755-280，ggccagaaagctaattcat(SEQIDNO618)NM_002755-402，gcgatggcgagatcagtat(SEQIDNO619)NM_002755-404，gatggcgagatcagtatct(SEQIDNO620)NM_002755-682，ctacatgtcgccagaaaga(SEQIDNO621)NM_002755-1128，ccaccatcggccttaacca(SEQIDNO622)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002755-912，gacctcccatggcaatttt(SEQIDNO623)NM_002755-915，ctcccatggcaatttttga(SEQIDNO624)NM_002755-911，cgacctcccatggcaattt(SEQIDNO625)(RNAi目標基因)NM_030662，人有絲分裂原活化的蛋白激酶激酶2(MAP2K2)(目標序列)NM_030662-1136，gccggctggttgtgtaaaa(SEQIDNO626)NM_030662-184，caaggtcggcgaactcaaa(SEQIDNO627)NM_030662-959，ctcctggactatattgtga(SEQIDNO628)NM_030662-183，ccaaggtcggcgaactcaa(SEQIDNO629)NM_030662-711，ggttgcagggcacacatta(SEQIDNO630)(RNAi目標基因)NM_002756，人有絲分裂原活化的蛋白激酶激酶3(MAP2K3)(目標序列)NM_002756-257，cgcacggtcgactgtttct(SEQIDNO631)NM_002756-258，gcacggtcgactgtttcta(SEQIDNO632)NM_002756-289，ctacggggcactattcaga(SEQIDNO633)NM_002756-285，ccttctacggggcactatt(SEQIDNO634)NM_002756-44，gactcccggaccttcatca(SEQIDNO635)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002756-129，gagcctatggggtggtaga(SEQIDNO636)NM_002756-41，ctggactcccggaccttca(SEQIDNO637)NM_002756-89，gaggctgatgacttggtga(SEQIDNO638)(RNAi目標基因)NM_002758，人有絲分裂原活化的蛋白激酶激酶6(MAP2K6)(目標序列)NM_002758-394，ggatacatcactagataaa(SEQIDNO639)NM_002758-395，gatacatcactagataaat(SEQIDNO640)NM_002758-755，cttcgatttccctatgatt(SEQIDNO641)NM_002758-340，cttttatggcgcactgttt(SEQIDNO642)NM_002758-399，catcactagataaattcta(SEQIDNO643)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002758-312，ggacggtggactgtccatt(SEQIDNO644)NM_002758-418，caaacaagttattgataaa(SEQIDNO645)NM_002758-415，ctacaaacaagttattgat(SEQIDNO646)(RNAi目標基因)NM_003010，人有絲分裂原活化的蛋白激酶激酶4(MAP2K4)(目標序列)NM_003010-543，ctacctcgtttgataagtt(SEQIDNO647)NM_003010-1130，gcatgctatgtttgtaaaa(SEQIDNO648)NM_003010-1056，ccaaaaggccaaagtataa(SEQIDNO649)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_003010-1129，cgcatgctatgtttgtaaa(SEQIDNO650)NM_003010-1057，caaaaggccaaagtataaa(SEQIDNO651)NM_003010-452，gtaatgcggagtagtgatt(SEQIDNO652)(RNAi目標基因)NM_016123，人白介素-1受體結合的激酶4(Homosapiensinterleukin-1receptor-associatedkinase)4(IRAK4)(目標序列)NM_016123-1299，gccaatgtcggcatgaaaa(SEQIDNO653)NM_016123-1073，gctttgcgtggagaaataa(SEQIDNO654)NM_016123-38，ctcaatgttggactaatta(SEQIDNO655)NM_016123-769，cctctgcttagtatatgtt(SEQIDNO656)NM_016123-1180，gttattgctagatattaaa(SEQIDNO657)(RNAi目標基因)NM_002880，人v-raf-1鼠白血病病毒癌基因同源物(Homosapiensv-raf-1murineleukemiaviraloncogenehomolog)1(RAF1)(目標序列)NM_002880-1703，gatcttagtaagctatata(SEQIDNO658)NM_002880-232，gcatgactgccttatgaaa(SEQIDNO659)NM_002880-1597，ctatggcatcgtattgtat(SEQIDNO660)NM_002880-1706，cttagtaagctatataaga(SEQIDNO661)NM_002880-568，cagacaactcttattgttt(SEQIDNO662)(RNAi目標基因)NM_000020，人活化素A受體II型樣1(HomosapiensactivinArecepttypeII-like1)(ACVRL1)(目標序列)NM_000020-1453，caagaagacactacaaaaa(SEQIDNO663)NM_000020-722，gagactgagatctataaca(SEQIDNO664)NM_000020-1456，gaagacactacaaaaaatt(SEQIDNO665)NM_000020-728，gagatctataacacagtat(SEQIDNO666)NM_000020-846，gctccctctacgactttct(SEQIDNO667)(RNAi目標基因)NM_001105，人活化素A受體，I型(ACVR1)(目標序列)NM_001105-1456，cacagcactgcgtatcaaa(SEQIDNO668)NM_001105-428，gttgctctccgaaaattta(SEQIDNO669)NM_001105-431，gctctccgaaaatttaaaa(SEQIDNO670)NM_001105-1460，gcactgcgtatcaaaaaga(SEQIDNO671)NM_001105-1458，cagcactgcgtatcaaaaa(SEQIDNO672)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_001105-1306，caatgacccaagttttgaa(SEQIDNO673)NM_001105-1381，gttctcagacccgacatta(SEQIDNO674)NM_001105-281，caaggggactggtgtaaca(SEQIDNO675)(RNAi目標基因)NM_004302，人活化素A受體，IB型(ACVR1B)(目標序列)NM_004302-609，cccgaaccatcgttttaca(SEQIDNO676)NM_004302-610，ccgaaccatcgttttacaa(SEQIDNO677)NM_004302-897，caattgaggggatgattaa(SEQIDNO678)NM_004302-857，cacgggtccctgtttgatt(SEQIDNO679)NM_004302-859，cgggtccctgtttgattat(SEQIDNO680)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_004302-1119，gggtggggaccaaacgata(SEQIDNO681)NM_004302-1063，cctggctgtccgtcatgat(SEQIDNO682)NM_004302-1121，gtggggaccaaacgataca(SEQIDNO683)(RNAi目標基因)NM_145259，人活化素A受體，IC型(ACVR1C)(目標序列)NM_145259-1419，ctgctcttcgtattaagaa(SEQIDNO684)NM_145259-956，gctcatcgagacataaaat(SEQIDNO685)NM_145259-825，gctccttatatgactattt(SEQIDNO686)NM_145259-959，catcgagacataaaatcaa(SEQIDNO687)NM_145259-1237，gtaccaattgccttattat(SEQIDNO688)(RNAi目標基因)NM_004612，人轉化型生長因子，β受體I(活化素A受體II型-樣激酶，53kDa)(Homosapienstransforminggrowthfactor，betareceptorI(activinAreceptortypeII-likekinase，53kDa))(TGFBR1)(目標序列)NM_004612-236，cgagataggccgtttgtat(SEQIDNO689)NM_004612-1451，gcattgcggattaagaaaa(SEQIDNO690)NM_004612-463，ccatcgagtgccaaatgaa(SEQIDNO691)NM_004612-492，cattagatcgcccttttat(SEQIDNO692)NM_004612-1449，cagcattgcggattaagaa(SEQIDNO693)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_004612-829，gttggtgtcagattatcat(SEQIDNO694)NM_004612-288，caacatattgctgcaatca(SEQIDNO695)NM_004612-839，gattatcatgagcatggat(SEQIDNO696)(RNAi目標基因)NM_004836，人真核轉位起始因子2-α激酶3(Homosapienseukaryotictranslationinitiationfactor2-alphakinase3)(EIF2AK3)(目標序列)NM_004836-1594，catagcaacaacgtttatt(SEQIDNO697)NM_004836-1419，catatgataatggttatta(SEQIDNO698)NM_004836-1900，ggtaatgcgagaagttaaa(SEQIDNO699)NM_004836-1248，ctaatgaaaacgcaattat(SEQIDNO700)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_004836-784，ctttgaacttcggtatatt(SEQIDNO701)NM_004836-782，cactttgaacttcggtata(SEQIDNO702)NM_004836-983，gaatgggagtaccagtttt(SEQIDNO703)(RNAi目標基因)NM_001433，人ER到細胞核信號1(HomosapiensERtonucleussignalling1)(ERN1)(目標序列)NM_001433-2407，cattgcacgagaattgata(SEQIDNO704)NM_001433-2277，caggctgcgtcttttacta(SEQIDNO705)NM_001433-2530，cgtgagcgacagaatagaa(SEQIDNO706)NM_001433-1149，ccaaacatcgggaaaatgt(SEQIDNO707)NM_001433-364，ggacatctggtatgttatt(SEQIDNO708)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_001433-319，cccatgccgaagttcagat(SEQIDNO709)NM_001433-2254，ctacacggtggacatcttt(SEQIDNO710)NM_001433-324，gccgaagttcagatggaat(SEQIDNO711)(RNAi目標基因)NM_001278，人保守的螺旋-環-螺旋遍在激酶(Homosapiensconservedhelix-loop-helixubiquitouskinase)(CHUK)(目標序列)NM_001278-746，ggagaagttcggtttagta(SEQIDNO712)NM_001278-1879，ggccctcagtaatatcaaa(SEQIDNO713)NM_001278-864，gacctgttgaccttacttt(SEQIDNO714)NM_001278-2150，ggccatttaagcactatta(SEQIDNO715)NM_001278-2151，gccatttaagcactattat(SEQIDNO716)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_001278-645，ctggatataggcctttctt(SEQIDNO717)NM_001278-1354，gttaagtcttcttagatat(SEQIDNO718)NM_001278-1203，gtttatctgattgtgtaaa(SEQIDNO719)(RNAi目標基因)NM_014002，B細胞中的人κ輕多肽基因增強子，激酶ε(HomosapiensinhibitorofkappalightpolypeptidegeneenhancerinB-cells，kinaseepsilon)(IKBKE)(目標序列)NM_014002-2107，catcgaacggctaaataga(SEQIDNO720)NM_014002-1724，ctggataaggtgaatttca(SEQIDNO721)NM_014002-535，cctgcatcccgacatgtat(SEQIDNO722)NM_014002-1220，ctgcaggcggattacaaca(SEQIDNO723)NM_014002-1726，ggataaggtgaatttcagt(SEQIDNO724)(Targetsequenceeffectiveformousehomolog)NM_014002-54，ccactgccagtgtgtacaa(SEQIDNO725)(RNAi目標基因)NM_003177，人脾酪氨酸激酶(Homosapiensspleentyrosinekinase)(SYK)(目標序列)NM_003177-1222，caatgaccccgctcttaaa(SEQIDNO726)NM_003177-713，cagctagtcgagcattatt(SEQIDNO727)NM_003177-849，ggtcagcgggtggaataat(SEQIDNO728)NM_003177-715，gctagtcgagcattattct(SEQIDNO729)NM_003177-1389，gacatgtcaaggataagaa(SEQIDNO730)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_003177-1559，gctgatgaaaactactaca(SEQIDNO731)NM_003177-1028，gacacagaggtgtacgaga(SEQIDNO732)NM_003177-1560，ctgatgaaaactactacaa(SEQIDNO733)(RNAi目標基因)NM_153831，人PTK2蛋白酪氨酸激酶2(HomosapiensPTK2proteintyrosinekinase2)(PTK2)(目標序列)NM_153831-451，gaagagcgattatatgtta(SEQIDNO734)NM_153831-1889，gtaatcggtcgaattgaaa(SEQIDNO735)NM_153831-93，caatggagcgagtattaaa(SEQIDNO736)NM_153831-2747，ctggaccggtcgaatgata(SEQIDNO737)NM_153831-92，gcaatggagcgagtattaa(SEQIDNO738)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_153831-1767，ctccagagtcaatcaattt(SEQIDNO739)NM_153831-1766，gctccagagtcaatcaatt(SEQIDNO740)NM_153831-599，gttggtttaaagcgatttt(SEQIDNO741)(RNAi目標基因)NM_173174，人PTK2B蛋白酪氨酸激酶2β(PTK2B)(目標序列)NM_173174-1273，ggtcctgaatcgtattctt(SEQIDNO742)NM_173174-1776，ccccagagtccattaactt(SEQIDNO743)NM_173174-1723，ggacgaggactattacaaa(SEQIDNO744)NM_173174-2486，gaccccatggtttatatga(SEQIDNO745)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_173174-378，ggaggtatgaccttcaaat(SEQIDNO746)NM_173174-1182，gcagcatagagtcagacat(SEQIDNO747)NM_173174-376，gtggaggtatgaccttcaa(SEQIDNO748)(RNAi目標基因)NM_002944，人v-rosUR2肉瘤病毒癌基因同源物1(sarcomavirusoncogenehomolog1)(avian)(ROS1)(目標序列)NM_002944-417，gaagctggacttatactaa(SEQIDNO749)NM_002944-2123，gacatggattggtataaca(SEQIDNO750)NM_002944-2163，cgaaaggcgacgtttttgt(SEQIDNO751)NM_002944-1385，caagccaagcgaatcattt(SEQIDNO752)NM_002944-416，ggaagctggacttatacta(SEQIDNO753)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002944-3048，ctgtcactccttataccta(SEQIDNO754)NM_002944-3044，ctttctgtcactccttata(SEQIDNO755)NM_002944-1051，caacatgtctgatgtatct(SEQIDNO756)(RNAi目標基因)NM_004304，人退行性淋巴瘤激酶(Homosapiensanaplasticlymphomakinase)(Ki-1)(ALK)(目標序列)NM_004304-2469，ccacctacgtatttaagat(SEQIDNO757)NM_004304-4067，cctgtataccggataatga(SEQIDNO758)NM_004304-2468，gccacctacgtatttaaga(SEQIDNO759)NM_004304-4183，cgctttgccgatagaatat(SEQIDNO760)NM_004304-2922，gccacggggaagtgaatat(SEQIDNO761)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_004304-3258，ccatcatgaccgactacaa(SEQIDNO762)NM_004304-2833，caatgaccccgaaatggat(SEQIDNO763)NM_004304-3156，ccggcatcatgattgtgta(SEQIDNO764)(RNAi目標基因)NM_000245，人met原癌基因(Homosapiensmetproto-oncogene)(肝細胞生長因子受體(MET)(目標序列)NM_000245-2761，gaacagcgagctaaatata(SEQIDNO765)NM_000245-1271，cagcgcgttgacttattca(SEQIDNO766)NM_000245-1086，gtgcattccctatcaaata(SEQIDNO767)NM_000245-725，gattcttaccccattaagt(SEQIDNO768)NM_000245-3619，caaagcgatgaaatatctt(SEQIDNO769)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_000245-2987，catttggataggcttgtaa(SEQIDNO770)NM_000245-801，ctctagatgctcagacttt(SEQIDNO771)NM_000245-2660，gttaaaggtgaagtgttaa(SEQIDNO772)(RNAi目標基因)NM_002529，人神經營養性酪氨酸激酶，受體，1型(Homosapiensneurotrophictyrosinekinase，receptor，type1)(NTRK1)(目標序列)NM_002529-2091，gcatcctgtaccgtaagtt(SEQIDNO773)NM_002529-345，ggctcagtcgcctgaatct(SEQIDNO774)NM_002529-347，ctcagtcgcctgaatctct(SEQIDNO775)NM_002529-953，ggctccgtgctcaatgaga(SEQIDNO776)NM_002529-1987，ggtcaagattggtgatttt(SEQIDNO777)(RNAi目標基因)NM_006180，人神經營養性酪氨酸激酶，受體，2型(NTRK2)(目標序列)NM_006180-358，caattttacccgaaacaaa(SEQIDNO778)NM_006180-1642，catcaagcgacataacatt(SEQIDNO779)NM_006180-663，gtgatccggttcctaatat(SEQIDNO780)NM_006180-665，gatccggttcctaatatgt(SEQIDNO781)NM_006180-792，cttgtgtggcggaaaatct(SEQIDNO782)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_006180-562，cctgcagatacccaattgt(SEQIDNO783)NM_006180-898，ctggtgcattccattcact(SEQIDNO784)NM_006180-735，cacagggctccttaaggat(SEQIDNO785)(RNAi目標基因)NM_000208，人胰島素受體(Homosapiensinsulinreceptor)(INSR)(目標序列)NM_000208-2562，gccctgtgacgcatgaaat(SEQIDNO786)NM_00208-2565，ctgtgacgcatgaaatctt(SEQIDNO787)NM_000208-3492，gcatggtcgcccatgattt(SEQIDNO788)NM_000208-3493，catggtcgcccatgatttt(SEQIDNO789)NM_000208-329，ggatcacgactgttcttta(SEQIDNO790)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_000208-2911，gattggaagtatttatcta(SEQIDNO791)NM_000208-902，caccaatacgtcattcaca(SEQIDNO792)NM_000208-1514，cggacatcttttgacaaga(SEQIDNO793)(RNAi目標基因)NM_000323，人ret原癌基因(多內分泌腫瘤和甲狀腺髓樣癌1，Hirschsprung病)(Homosapiensretproto-oncogene(multipleendocrineneoplasiaandmedullarythyroidcarcinoma1，Hirschsprungdisease))(RET)(目標序列)NM_000323-2679，gcttgtcccgagatgttta(SEQIDNO794)NM_000323-3066，catctgactccctgattta(SEQIDNO795)NM_000323-3069，ctgactccctgatttatga(SEQIDNO796)NM_000323-2680，cttgtcccgagatgtttat(SEQIDNO797)NM_000323-2728，gggtcggattccagttaaa(SEQIDNO798)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_000323-3159，ccacatggattgaaaacaa(SEQIDNO799)NM_000323-3156，cttccacatggattgaaaa(SEQIDNO800)NM_000323-3155，ccttccacatggattgaaa(SEQIDNO801)(RNAi目標基因)NM_006293，人TYRO3蛋白酪氨酸激酶(HomosapiensTYRO3proteintyrosinekinase)(TYRO3)(目標序列)NM_006293-1494，gcatcagcgatgaactaaa(SEQIDNO802)NM_006293-2207，gaaaacgctgagatttaca(SEQIDNO803)NM_006293-2394，gccaggaccccttatacat(SEQIDNO804)NM_006293-2399，gaccccttatacatcaaca(SEQIDNO805)NM_006293-1493，ggcatcagcgatgaactaa(SEQIDNO806)(RNAi目標基因)NM_82925，人fms-相關的酪氨酸激酶(Homosapiensfms-relatedtyrosinekinase)4(FLT4)(目標序列)NM_182925-758，gtgtgggctgagtttaact(SEQIDNO807)NM_82925-756，ccgtgtgggctgagtttaa(SEQIDNO808)NM_82925-1217，ggcctgaggcgcaacatca(SEQIDNO809)NM_82925-1827，gcaagaacgtgcatctgtt(SEQIDNO810)NM_182925-908，gacctgggctcgtatgtgt(SEQIDNO811)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_182925-2033，cggctcacgcagaacttga(SEQIDNO812)NM_182925-330，gctactacaagtacatcaa(SEQIDNO813)(RNAi目標基因)NM_004119，人fms-相關的酪氨酸激酶3(FLT3)(目標序列)NM_004119-1569，gtgagacgatccttttaaa(SEQIDNO814)NM_004119-2490，gattggctcgagatatcat(SEQIDNO815)NM_004119-1571，gagacgatccttttaaact(SEQIDNO816)NM_004119-32，ccgctgctcgttgtttttt(SEQIDNO817)NM_004119-730，gttcacaatagatctaaat(SEQIDNO818)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_004119-92，gtgatcaagtgtgttttaa(SEQIDNO819)NM_004119-1483，ggtgtcgagcagtactcta(SEQIDNO820)NM_004119-1456，ggctaacagaaaagtgttt(SEQIDNO821)(RNAi目標基因)NM_002253，人激酶插入結構域受體(Homosapienskinaseinsertdomainreceptor)(III型受體酪氨酸激酶)(KDR)(目標序列)NM_002253-617，gaaagttaccagtctatta(SEQIDNO822)NM_002253-865，gagcaccttaactatagat(SEQIDNO823)NM_002253-2020，gaatcagacgacaagtatt(SEQIDNO824)NM_002253-815，gtaaaccgagacctaaaaa(SEQIDNO825)NM_002253-2586，ggacagtagcagtcaaaat(SEQIDNO826)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002253-3032，gtggctaagggcatggagt(SEQIDNO827)NM_002253-3627，ccaaattccattatgacaa(SEQIDNO828)NM_002253-3626，cccaaattccattatgaca(SEQIDNO829)(RNAi目標基因)NM_002609，人血小板來源的生長因子受體，β多肽(Homosapiensplatelet-derivedgrowthfactorreceptor，betapolypeptide)(PDGFRB)(目標序列)NM_002609-961，ggtgggcacactacaattt(SEQIDNO830)NM_002609-2881，gttgggcgaaggttacaaa(SEQIDNO831)NM_002609-409，ctttctcacggaaataact(SEQIDNO832)NM_002609-278，gacacgggagaatactttt(SEQIDNO833)NM_002609-3048，gtgacaacgactatatcat(SEQIDNO834)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_002609-633，catccatcaacgtctctgt(SEQIDNO835)NM_002609-2784，cctccgacgagatctatga(SEQIDNO836)(RNAi目標基因)NM_005433，人v-yes-1Yamaguchi肉瘤病毒癌基因同源物1(Homosapiensv-yes-1Yamaguchisarcomaviraloncogenehomolog1)(YES1)(目標序列)NM_005433-525，gaaatcaacgaggtatttt(SEQIDNO837)NM_005433-670，cacaaccagagcacaattt(SEQIDNO838)NM_005433-1333，gtatggtcggtttacaata(SEQIDNO839)NM_005433-1331，ctgtatggtcggtttacaa(SEQIDNO840)NM_005433-416，ggttatatcccgagcaatt(SEQIDNO841)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_005433-953，caagaagctcagataatga(SEQIDNO842)NM_005433-1，gggctgcattaaaagtaaa(SEQIDNO843)NM_005433-4，ctgcattaaaagtaaagaa(SEQIDNO844)(RNAi目標基因)NM_002005，人貓肉瘤癌基因(Homosapiensfelinesarcomaoncogene)(FES)(目標序列)NM_002005-1696，gattggacgggggaacttt(SEQIDNO845)NM_002005-2181，cacctgaggcccttaacta(SEQIDNO846)NM_002005-1553，ggctttcctagcattcctt(SEQIDNO847)NM_002005-683，gaatacctggagattagca(SEQIDNO848)NM_002005-74，ctactggagggcatgagaa(SEQIDNO849)(RNAi目標基因)NM_000633，人B-細胞CLL/淋巴瘤2(BCL2)(目標序列)NM_000633-43，gatgaagtacatccattat(SEQIDNO850)NM_000633-41，gtgatgaagtacatccatt(SEQIDNO851)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_000633-452，gagttcggtggggtcatgt(SEQIDNO852)NM_000633-454，gttcggtggggtcatgtgt(SEQIDNO853)NM_000633-525，ggatgactgagtacctgaa(SEQIDNO854)(RNAi目標基因)NM_001167，人桿狀病毒IAP重復-含有4(HomosapiensbaculoviralIAPrepeat-containing4)(BIRC4)(目標序列)NM_001167-302，gccacgcagtctacaaatt(SEQIDNO855)NM_001167-794，gaagcacggatctttactt(SEQIDNO856)NM_001167-485，gaagaagctagattaaagt(SEQIDNO857)NM_001167-402，cacatgcagactatctttt(SEQIDNO858)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_001167-71，gaagagtttaatagattaa(SEQIDNO859)NM_001167-68，gtagaagagtttaatagat(SEQIDNO860)NM_001167-1354，ctgtatggatagaaatatt(SEQIDNO861)(RNAi目標基因)NM_139317，人桿狀病毒IAP重復-含有7(livin)(BIRC7)(目標序列)NM_139317-458，ctgctccggtcaaaaggaa(SEQIDNO862)NM_139317-457，cctgctccggtcaaaagga(SEQIDNO863)NM_139317-743，gagaggacgtgcaaggtgt(SEQIDNO864)NM_139317-774，ccgtgtccatcgtctttgt(SEQIDNO865)NM_139317-417，cctggacggagcatgccaa(SEQIDNO866)(RNAi目標基因)NM_005036，人過氧化物酶體增生性活化的受體，α(Homosapiensperoxisomeproliferativeactivatedreceptor，alpha)(PPARA)(目標序列)NM_005036-922，gctaaaatacggagtttat(SEQIDNO867)NM_005036-1243，ccacccggacgatatcttt(SEQIDNO868)NM_005036-711，cttttgtcatacatgatat(SEQIDNO869)NM_005036-498，cacacaacgcgattcgttt(SEQIDNO870)NM_005036-988，gctggtagcgtatggaaat(SEQIDNO871)(RNAi目標基因)NM_138712，人過氧化物酶體增生性活化的受體，γ(PPARG)(目標序列)NM_138712-953，ggagtccacgagatcattt(SEQIDNO872)NM_138712-304，ctccctcatggcaattgaa(SEQIDNO873)NM_138712-954，gagtccacgagatcattta(SEQIDNO874)NM_138712-445，ctgtcggatccacaaaaaa(SEQIDNO875)NM_138712-409，cagattgaagcttatctat(SEQIDNO876)(對鼠的同源基因有效的目標序列)NM_138712-239，gcatctccaccttattatt(SEQIDNO877)NM_138712-688，ggcgagggcgatcttgaca(SEQIDNO878)NM_138712-664，gtccttcccgctgaccaaa(SEQIDNO879)(RNAi目標基因)NM_004421，人凌亂的，dsh同源物1(Homosapiensdishevelled，dshhomolog1)(果蠅(Drosophila))(DVL1)(目標序列)NM_004421-1173，ccgtcgtccgggtcatgca(SEQIDNO880)(RNAi目標基因)NM_004422，人凌亂的，dsh同源物2(Drosophila)(DVL2)(目標序列)NM_004422-1253，gtccatacggacatggcat(SEQIDNO881)(RNAi目標基因)NM_004423，人凌亂的，dsh同源物3(果蠅)(DVL3)(目標序列)NM_004423-1197，gcctagacgacttccactt(SEQIDNO882)(RNAi目標基因)NC_001802，人免疫缺陷病毒1，完整基因組(Humanimmunodeficiencyvirus1，completegenome)。(目標序列)NC_001802-8242，ggacagatagggttataga(SEQIDNO883)NC_001802-340，gcgagagcgtcagtattaa(SEQIDNO884)NC_001802-1222，gtagaccggttctataaaa(SEQIDNO885)NC_001802-1818，cgacccctcgtcacaataa(SEQIDNO886)NC_001802-4973，gccctaggtgtgaatatca(SEQIDNO887)NC_001802-5224，gcttagggcaacatatcta(SEQIDNO888)NC_001802-550，gaagaacttagatcattat(SEQIDNO889)NC01802-1777，gaactgtatcctttaactt(SEQIDNO890)NC01802-3244，gaaagactcctaaatttaa(SEQIDNO891)NC01802-5225，cttagggcaacatatctat(SEQIDNO892)發明效果根據本發明，可以高概率地獲得實際顯示RNAi效果的siRNA，因此，在制備新的siRNA的時候，大幅降低了由于試驗者經驗等原因在需要確認實際合成的siRNA是否具有RNAi效果時反復試驗和試驗錯誤造成的勞動，也即，本發明極其適于新序列siRNA的搜索。進一步，根據本發明，能夠在短時間得到多種希望的siRNA，同時因為減低了沒有必要的、用于試行錯誤的實際制作siRNA的數量，RNA干擾試驗中的成本也大幅下降。另外，本發明在大幅簡化有關利用RNAi效果的所有試驗、制作等的方法的同時，也大幅提高了方法本身的確定性。本發明在以哺乳類高等動物為對象進行RNA干擾時特別有效。產業上的利用可能性如上所述，本發明涉及RNA干擾，更詳細地說，涉及提高RNA干擾的試驗、制作效率以及能夠產生RNA干擾的多核苷酸的序列設計方法。序列表<110>生物智囊團株式會社(BIO-THINKTANKCO.，LTD)<120>RNA干擾的目標堿基序列的搜索方法，導致RNA干擾的多核苷酸的堿基序列的設計方法，雙鏈多核苷酸的制備方法，抑制基因表達的方法，堿基序列處理裝置，操作堿基序列處理方法的計算機程序，記錄介質，以及堿基序列處理系統<130>PC/B-18-1<140>PCT/JP2003/014893<141>2003-11-21<150>JP2002-340053<151>2002-11-22<160>892<210>1<211>37<212>DNA<213>人工<220><223>包含NheI位點，EcoRI位點和XhoI位點的低聚物<400>1gctagccaccatggaattcacgcgtctcgagtctaga37<210>2<211>18<212>DNA<213>人工<220><223>PCR引物T<400>2aggcactgggcaggtgtc18<210>3<211>24<212>DNA<213>人工<220><223>PCR引物T<400>3tgctcgaagcattaaccctcacta24<210>4<211>21<212>DNA<213>人工<220><223>PCR引物C<400>4atcaggatgatctggacgaag21<210>5<211>21<212>DNA<213>人工<220><223>PCR引物C<400>5ctcttcagcaatatcacgggt21<210>6<211>35<212>DNA<213>人工<220><223>目標序列VIM35<400>6gaattcgcaggatgttcggcggcccgggcctcgag35<210>7<211>35<212>DNA<213>人工<220><223>目標序列VIM812<400>7gaattcacgtacgtcagcaatatgaaagtctcgag35<210>8<211>21<212>RNA<213>人工<220><223>siRNA作為評價對象；siVIM35<400>8aggauguucggcggcccgggc21<210>9<211>21<212>RNA<213>人工<220><223>siRNA作為評價對象；siVIM812<400>9guacgucagcaauaugaaagu21<210>10<211>21<212>RNA<213>人工<220><223>對照siRNA；siControl<400>10cauucuauccgcuggaagaug21<210>11<211>20<212>DNA<213>人工<220><223>PCR引物VIM-F3-84<400>11gagctacgtgactacgtcca20<210>12<211>21<212>DNA<213>人工<220><223>PCR引物VIM-R3-274<400>12gttcttgaactcggtgttgat21<210>13<211>20<212>DNA<213>人工<220><223>PCR引物ACTB-F2-481<400>13cacactgtgcccatctacga20<210>14<211>20<212>DNA<213>人工<220><223>PCR引物ACTB-R2-664<400>14gccatctcttgctcgaagtc20<210>15<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>15gacgccaaaaacataaaga19<210>16<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>16gttggcagaagctatgaaa19<210>17<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>17gtgttgggcgcgttattta19<210>18<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>18ccgcgaacgacatttataa19<210>19<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>19ccaatcatccaaaaaatta19<210>20<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>20cctcccggttttaatgaat19<210>21<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>21gcatgccagagatcctatt19<210>22<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>22ccggatactgcgattttaa19<210>23<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>23ggttttggaatgtttacta19<210>24<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>24gatttcgagtcgtcttaat19<210>25<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>25gcactctgattgacaaata19<210>26<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>26caaatacgatttatctaat19<210>27<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>27gattatgtccggttatgta19<210>28<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>28ccgcctgaagtctctgatt19<210>29<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>29ctcgacgcaagaaaaatca19<210>30<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>30aacataaagaaaggcccgg19<210>31<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>31tatgccggtgttgggcgcg19<210>32<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA標序列<400>32agttgcagttgcgcccgcg19<210>33<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>33acgtgcaaaaaaagctccc19<210>34<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>螢火蟲螢光素酶的siRNA目標序列<400>34ttctgattacacccgaggg19<210>35<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠狀病毒的siRNA目標序列<400>35gggcgcggtcggtaaagtt19<210>36<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠狀病毒的siRNA目標序列<400>36ggaattgccgtcttagata19<210>37<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠狀病毒的siRNA目標序列<400>37gaatggtcgtactatcctt19<210>38<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠狀病毒的siRNA目標序列<400>38ccaagtaatcgttaacaat19<210>39<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠狀病毒的siRNA目標序列<400>39gcttggcgcatatattcta19<210>40<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠狀病毒的siRNA目標序列<400>40cctttcgcgacttgataaa19<210>41<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠狀病毒的siRNA目標序列<400>41gtgcgtactgctgcaatat19<210>42<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠狀病毒的siRNA目標序列<400>42ctactcgcgtgttaaaaat19<210>43<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠狀病毒的siRNA目標序列<400>43gcagacaacggtactatta19<210>44<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠狀病毒的siRNA目標序列<400>44ccggtagcaacgacaatat19<210>45<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠狀病毒的siRNA目標序列<400>45cgtagtcgcggtaattcaa19<210>46<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠狀病毒的siRNA目標序列<400>46gatcgagggtacagtgaat19<210>47<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR1的siRNA目標序列(NM_000604).<400>47gtagcaacgtggagttcat19<210>48<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR1的siRNA目標序列(NM_000604).<400>48ggtagcaacgtggagttca19<210>49<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR1的siRNA目標序列(NM_000604).<400>49caacgtggagttcatgtgt19<210>50<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR1的siRNA目標序列(NM_000604).<400>50ggtgaatgggagcaagatt19<210>51<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR1的siRNA目標序列(NM_000604).<400>51gcaagattggcccagacaa19<210>52<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR1的siRNA目標序列(NM_000604).<400>52gagttcatgtgtaaggtgt19<210>53<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR2的siRNA目標序列(NM_000141).<400>53gaggctacaaggtacgaaa19<210>54<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR2的siRNA目標序列(NM_000141).<400>54gctacaaggtacgaaacca19<210>55<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR2的siRNA目標序列(NM_000141).<400>55ctggagcctcattatggaa19<210>56<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR2的siRNA目標序列(NM_000141).<400>56gaaaaacgggaaggagttt19<210>57<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR2的siRNA目標序列(NM_000141).<400>57gcaggagcatcgcattgga19<210>58<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR2的siRNA目標序列(NM_000141).<400>58ccttcagtttagttgagga19<210>59<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR2的siRNA目標序列(NM_000141).<400>59cttcagtttagttgaggat19<210>60<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>F6FR3的siRNA目標序列(NM_000142).<400>60gacggcacaccctacgtta19<210>61<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR3的siRNA目標序列(NM_000142).<400>61cacaacctcgactactaca19<210>62<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR3的siRNA目標序列(NM_000142).<400>62gcacacacgacctgtacat19<210>63<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR3的siRNA目標序列(NM_000142).<400>63cctgcgtcgtggagaacaa19<210>64<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR3的siRNA目標序列(NM_000142).<400>64cacacgacctgtacatgat19<210>65<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR3的siRNA目標序列(NM_000142).<400>65gagttccactgcaaggtgt19<210>66<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB2的siRNA目標序列(NM_004448).<400>66ggagacccgctgaacaata19<210>67<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB2的siRNA目標序列(NM_004448).<400>67ccttcgacaacctctatta19<210>68<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB2的siRNA目標序列(NM_004448).<400>68gggctggctccgatgtatt19<210>69<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB2的siRNA目標序列(NM_004448).<400>69ggctggctccgatgtattt19<210>70<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB2的siRNA目標序列(NM_004448).<400>70ctggctccgatgtatttga19<210>71<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB3的siRNA目標序列(NM_001982).<400>71gtgctgggcgtatctatat19<210>72<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB3的siRNA目標序列(NM_001982).<400>72gctgggcgtatctatataa19<210>73<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB3的siRNA目標序列(NM_001982).<400>73gcttgtcctgtcgaaatta19<210>74<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB3的siRNA目標序列(NM_001982).<400>74cttgtcctgtcgaaattat19<210>75<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB3的siRNA目標序列(NM_001982).<400>75cattcgcccaacctttaaa19<210>76<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB4的siRNA目標序列(NM_005235).<400>76ggagaatttacgcattatt19<210>77<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB4的siRNA目標序列(NM_005235).<400>77gctcaacttcgtat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)<220><223>PPARA的siRNA目標序列(NM_005036).<400>867gctaaaatacggagtttat19<210>868<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARA的siRNA目標序列(NM_005036).<400>868ccacccggacgatatcttt19<210>869<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARA的siRNA目標序列(NM_005036).<400>869cttttgtcatacatgatat19<210>870<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARA的siRNA目標序列(NM_005036).<400>870cacacaacgcgattcgttt19<210>871<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARA的siRNA目標序列(NM_005036).<400>871gctggtagcgtatggaaat19<210>872<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARG的MRNA目標序列(NM_138712).<400>872ggagtccacgagatcattt19<210>873<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARG的siRNA目標序列(NM_138712).<400>873ctccctcatggcaattgaa19<210>874<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARG的siRNA目標序列(NM_138712).<400>874gagtccacgagatcattta19<210>875<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARG的siRNA目標序列(NM_138712).<400>875ctgtcggatccacaaaaaa19<210>876<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARG的siRNA目標序列(NM_138712).<400>876cagattgaagcttatctat19<210>877<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARG的siRNA目標序列(NM_138712).<400>877gcatctccaccttattatt19<210>878<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARG的siRNA目標序列(NM_138712).<400>878ggcgagggcgatcttgaca19<210>879<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARG的siRNA目標序列(NM_138712).<400>879gtccttcccgctgaccaaa19<210>880<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>DVL1的siRNA目標序列(NM_004421).<400>880ccgtcgtccgggtcatgca19<210>881<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>DVL2的siRNA目標序列(NM_004422).<400>881gtccatacggacatggcat19<210>882<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>DVL3的siRNA目標序列(NM_004423).<400>882gcctagacgacttccactt19<210>883<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>siRNA目標序列forHumanimmunodeficiencyvirus1.<400>883ggacagatagggttataga19<210>884<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目標序列.<400>884gcgagagcgtcagtattaa19<210>885<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目標序列.<400>885gtagaccggttctataaaa19<210>886<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目標序列.<400>886cgacccctcgtcacaataa19<210>887<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目標序列.<400>887gccctaggtgtgaatatca19<210>888<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目標序列.<400>888gcttagggcaacatatcta19<210>889<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目標序列.<400>889gaagaacttagatcattat19<210>890<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目標序列.<400>890gaactgtatcctttaactt19<210>891<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目標序列.<400>891gaaagactcctaaatttaa19<210>892<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目標序列.<400>892cttagggcaacatatctat19權利要求1.一種搜索RNA干擾的目標堿基序列的方法，其從RNA干擾的目標基因堿基序列中搜索符合下述規則(a)-(d)的序列部位(a)3’末端的堿基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶，(b)5’末端的堿基是鳥嘌呤或胞嘧啶，(c)3’末端的7堿基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，(d)堿基數在能夠產生RNA干擾且不產生細胞毒性的范圍內。2.權利要求1記載的搜索目標堿基序列的方法，其中在上述規則(c)中，7堿基中的至少3個或3個以上為從腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基。3.權利要求1或2記載的搜索目標堿基序列的方法，其中在上述規則(d)中，堿基數為13-28。4.設計用于產生RNA干擾的多核苷酸堿基序列方法，其包括，在目標基因的堿基序列中搜索符合下述規則(a)-(d)的堿基序列，并設計與搜索到的堿基序列相同的堿基序列(a)3’末端的堿基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶，(b)5’末端的堿基是鳥嘌呤或胞嘧啶，(c)3’末端的7堿基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，(d)堿基數在能夠產生RNA干擾且不產生細胞毒性的范圍內。5.權利要求4記載的堿基序列設計方法，其中在上述規則(c)中，7堿基中的至少3個或3個以上為從腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基。6.權利要求4或5記載的堿基序列設計方法，其中所設計的相同堿基序列的堿基數為13-28。7.權利要求4至6任意一項記載的堿基序列設計方法，其中經過設計，使得上述所設計的相同堿基序列中至少80％或80％以上的堿基與搜索到的堿基序列一致。8.權利要求4至7任意一項記載的堿基序列設計方法，其中搜索到的堿基序列的3’末端堿基和設計的堿基序列的3’末端堿基相同，而且，搜索到的堿基序列的5’末端堿基和設計的堿基序列的5’末端堿基相同。9.權利要求4至8任意一項記載的堿基序列設計方法，其中在多核苷酸的3’末端添加突出部。10.雙鏈多核苷酸的制作方法，包括形成一條鏈，其在與規定序列相同的堿基序列的3’末端設一突出部，所述規定序列包含在目標基因的堿基序列中且符合下述規則(a)-(d)；形成另一條鏈，其在與上述規定序列相同的堿基序列的互補序列的3’末端設一突出部；合成雙鏈多核苷酸時各鏈的堿基數設計成15-30，(a)3’末端的堿基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶，(b)5’末端的堿基是鳥嘌呤或胞嘧啶，(c)3’末端的7堿基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，(d)堿基數在能夠產生RNA干擾且不產生細胞毒性的范圍內。11.雙鏈多核苷酸，通過以下方法合成從RNA干擾的目標基因的堿基序列中搜索符合下述規則(a)-(d)、堿基數為13-28的序列部位，形成兩條鏈，其中一條鏈在與包含在目標基因堿基序列中且符合下述規則(a)-(d)的規定序列相同的堿基序列的3’末端設一突出部，另一條鏈在與上述規定序列相同的堿基序列的互補序列的3’末端設一突出部，且各鏈的堿基數設計成15-30，(a)3’末端的堿基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶，(b)5’末端的堿基是鳥嘌呤或胞嘧啶，(c)3’末端的7堿基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，(d)堿基數在能夠產生RNA干擾且不產生細胞毒性的范圍內。12.基因表達抑制方法，包含搜索步驟，是從RNA干擾的目標基因的堿基序列中搜索符合下述規則(a)-(d)、堿基數為13-28的序列部位，和合成雙鏈多核苷酸的步驟，所述雙鏈中，一條鏈在與包含在目標基因堿基序列中且符合下述規則(a)-(d)的規定序列相同的堿基序列的3’末端設一突出部，另一條鏈在與上述規定序列相同的堿基序列的互補序列的3’末端設一突出部，各鏈的堿基數設計成15-30，和抑制目的基因表達的步驟，其把合成的雙鏈多核苷酸添加至想要抑制目標基因表達的表達系統中(a)3’末端的堿基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶，(b)5’末端的堿基是鳥嘌呤或胞嘧啶，(c)3’末端的7堿基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，(d)堿基數在能夠產生RNA干擾且不產生細胞毒性的范圍內。13.堿基序列處理裝置，其特征是，具備部分堿基序列制作裝置，其可取得RNA干擾的目標基因的堿基序列信息，并制作上述堿基序列信息中具有預定堿基數的序列部位的部分堿基序列信息形成部分堿基序列，和3’末端堿基判定裝置，其判定由上述部分堿基序列制作裝置制作的部分堿基序列信息的3’末端的堿基是否是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶，和5’末端堿基判定裝置，其判定由上述部分堿基序列制作裝置制作的部分堿基序列信息的5’末端的堿基是否是鳥嘌呤或胞嘧啶，和判定是否包含預定堿基的裝置，其判定包含上述部分堿基序列制作裝置制作的部分堿基序列信息3’末端7堿基的堿基序列信息是否富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基預定堿基，和規定序列選擇裝置，根據上述3’末端堿基判定裝置、上述5’末端堿基判定裝置、上述判定是否包含預定堿基的裝置而判定的結果，從上述部分堿基序列制作裝置制作的部分堿基序列信息中篩選上述目標基因中特異地產生RNA干擾的規定序列信息。14.權利要求13記載的堿基序列處理裝置，其特征是，上述部分堿基序列制作裝置進一步包括區域特異性堿基序列制作裝置，其由上述堿基序列信息中目標基因編碼區、或轉錄區相應部位制成具有預定堿基數的部分堿基序列信息。15.權利要求13或14記載的堿基序列處理裝置，其特征是，上述部分堿基序列制作裝置進一步包括共同堿基序列制作裝置，其用于制作在源于不同生物的多個上述堿基序列信息間共有、且具有預定堿基數的上述部分堿基序列信息。16.權利要求13至15任意一項記載的堿基序列處理裝置，其特征是，上述富含的堿基序列信息是一種包含上述7堿基的堿基序列信息，所述7堿基中至少含有3個或3個由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選出的1或1種以上的堿基。17.權利要求13至16任意一項記載的堿基序列處理裝置，其特征是上述預定的堿基數是13-28。18.權利要求13至17任意一項記載的堿基序列處理裝置，其特征是，上述部分堿基序列制作裝置進一步包含含有突出部的堿基序列的制作裝置，其制作含有突出部的上述部分堿基序列信息。19.權利要求13至17任意一項記載的堿基序列處理裝置，其特征是，其還包括突出部添加裝置，其在上述規定序列信息的至少一個末端添加上述突出部。20.權利要求18或19記載的堿基序列處理裝置，其特征是，上述突出部的堿基數為2。21.權利要求13至20任意一項記載的堿基序列處理裝置，其特征是，其進一步包括，相同或類似堿基序列搜索裝置，其從其它堿基序列信息中搜索與上述規定序列信息相同或類似的堿基序列信息，和無關基因靶標評價裝置，其根據由上述相同或類似堿基序列搜索裝置搜索得到的相同或類似堿基序列信息，評價上述規定序列信息是否靶向與上述目標基因無關的基因。22.權利要求21記載的堿基序列處理裝置，其特征是，上述無關基因靶標評價裝置其進一步包括，總和計算裝置，其根據由上述相同或類似堿基序列搜索方法搜索得到的相同或類似堿基序列信息中，與目標基因無關的基因的堿基序列信息的總數，以及與目標基因無關的基因的堿基序列信息所附帶的相同或類似程度的數值，計算出表示相同或類似程度的數值的倒數的總和，和總和基準靶標評價裝置，其根據由上述總和計算方法算出的總和評價上述規定序列信息是否靶向與目標基因無關的基因。23.一種在計算機上執行堿基序列處理方法的程序，其特征是，其堿基序列處理方法包含部分堿基序列制作步驟，其取得RNA干擾的目標基因的堿基序列信息，并制作在上述堿基序列信息中具有預定堿基數的序列部位的部分堿基序列信息，和3’末端堿基判定步驟，其判定上述部分堿基序列制作步驟中制作得到的部分堿基序列信息的3’末端堿基是否是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶，和5’末端堿基判定步驟，其判定上述部分堿基序列制作步驟中制作得到的部分堿基序列信息的5’末端堿基是否是鳥嘌呤或胞嘧啶，和判定是否包含預定堿基的步驟，其判定包含上述部分堿基序列制作步驟中制作得到的部分堿基序列信息3’末端7堿基的堿基序列信息是否富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，和規定序列選擇步驟，根據上述3’末端堿基判定步驟、上述5’末端堿基判定步驟、上述包含預定堿基判定步驟的判定結果，從上述部分堿基序列制作步驟中制作得到的部分堿基序列信息中選擇對目標基因特異地產生RNA干擾的規定序列信息。24.一種計算機可讀取的記錄介質，其特征是其記錄權利要求23中記載的程序。25.一種堿基序列處理系統，其特征是，將處理RNA干擾的目標基因的堿基序列信息的堿基序列處理裝置和客戶機裝置通過網絡可通訊地連接，上述客戶機裝置具備堿基序列發送裝置，其將上述目標基因的名稱或上述堿基序列信息提交給上述堿基序列處理裝置，和規定序列取得裝置，其取得由上述堿基序列處理裝置發送的、對上述目標基因特異地產生RNA干擾的規定序列信息，上述堿基序列處理裝置具備部分堿基序列制作裝置，其取得由上述客戶機裝置發送的對應上述目標基因名稱的堿基序列信息或者由上述客戶機裝置發送的上述堿基序列信息，制作與上述堿基序列信息中具有預定堿基數的序列部位對應的部分堿基序列信息，和3’末端堿基判定裝置，其判定由上述部分堿基序列制作裝置制作的部分堿基序列信息3’末端的堿基是否是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶，和5’末端堿基判定裝置，其判定由上述部分堿基序列制作裝置制作的部分堿基序列信息5’末端的堿基是否是鳥嘌呤或胞嘧啶，和判定是否包含預定堿基的裝置，其判定包含上述部分堿基序列制作裝置制作的部分堿基序列信息3’末端7堿基的上述堿基序列信息是否富含腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基，和規定序列選擇裝置，其根據上述3’末端堿基判定裝置、上述5’末端堿基判定裝置、上述判定是否包含預定堿基的裝置而判定的結果，從上述部分堿基序列制作裝置制作的部分堿基序列信息中篩選上述規定序列信息，和規定序列發送裝置，將上述規定序列選擇裝置篩選的上述規定序列信息向上述客戶機裝置發送。全文摘要本發明從RNA干擾的目標基因的堿基序列中搜索符合下述規則(a)－(d)的序列部位，根據搜索結果進行能夠產生RNA干擾的小干擾RNA(siRNA)的設計、合成等。(a)3’末端的堿基是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)。(b)5’末端的堿基是鳥嘌呤(G)或胞嘧啶(C)。(c)3’末端的7堿基序列中富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)組成的群組中選擇的1或1種以上的堿基。(d)堿基數在產生RNA干擾且不產生細胞毒性的范圍內。文檔編號C12M1/00GK1742086SQ200380109108公開日2006年3月1日申請日期2003年11月21日優先權日2002年11月22日發明者西鄉薰,程久美子,內藤雄樹申請人:生物智囊團株式會社