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一種dbat突變酶r363h及其應用_3

文檔序號:9838504閱讀:來源:國知局
藍蛋白質在酸性條 件下結合時,染色液的最大吸光值波長由465nm轉移至595nm,同時其顏色由褐色轉為藍色。 通過測定樣品的吸光值并對照標準蛋白的吸光值,推算出蛋白濃度。
[0090] (1)考馬斯亮藍溶液的配制
[0091] 稱取50mg考馬斯亮蘭G250完全溶于50mL乙醇(95%)至完全溶解,加入100mLH3P〇4 (85%),加入蒸餾水至1L,4°C攪拌過夜,濾紙過濾后棕色瓶避光保存于4°C備用。
[0092] (2)牛血清白蛋白(BSA)標準曲線
[0093]以BSA作為標準蛋白繪制標準曲線。配制1 Omg/mL BSA溶液,分別吸取0、0.1、0.5、 0.75、1.0、1.25、1.5、211^并加水補足至1011^,得到濃度為0、0.1、0.5、0.75、1.0、1.25、1.5、 2mg/mL的BSA溶液,各吸取500yL后分別加入2.5mL考馬斯亮藍溶液,混合均勻后室溫下靜置 5min,在595nm處測定吸光度值,讀數在3~5min內保持穩定。得到的BSA標準曲線。
[0094]由實驗數據進行線性擬合,得到曲線方程:Y = 0.1514X-0.0158, R2 = 0.9946。測定 時待測蛋白液濃度需在〇. 1~2mg/mL范圍內。
[0095] 2、酶活測定(以野生型為準)
[0096] (1)重組酶催化體系設置
[0097] DBAT酶活力單位定義:在30°C條件下,每分鐘轉化lyM 10-DBA生成巴卡亭ΙΠ 的所 需的酶量定義為1U。
[0098] 根據不同目的改變體系內的變量,一般體系設置為:
[0099] Mg2+lmM,10-DAB 400μΜ,乙酰輔酶Α 400μΜ,純化后重組酶 10yL,Buffer定容至400μ L〇
[0100] (2)測定巴卡亭m生成量
[0101] 加樣后,輕輕震蕩混勻。30°C下反應lh。反應結束后,立即加入400yL乙腈終止反 應。0.22μπι微孔濾膜過濾樣品,進行HPLC-UV檢測。
[0102] 3、HPLC-UC測定巴卡亭m(以野生酶為準)
[0103] (1 )HPLC條件:采用HPLC-UV對巴卡亭ΙΠ 和10-DAB進行定性、定量,主要參數如下: 柱溫:室溫;檢測波長:227nm;流動相:MeCN: H20(50:50);流速:1. OmL/min;進樣量:20yL。
[0104] (2)標準品溶液的制備:分別準確稱量巴卡亭m和1 ο-DBA標準品適量,甲醇溶解, 均配置成lmg/mL母液。
[0105] (3)樣品溶液的制備:催化反應完成后,加入等體積乙腈,搖勻,終止反應。再用 0.45μπι微孔濾膜過濾,取濾液,即可。
[0106] (4)標準曲線:精密吸取巴卡亭m標準品母液2.5yL、5yL、1 OyL、15yL、20yL,用色譜 級甲醇定容至10mL。過濾后,分別按上述色譜條件測定,重復測定3次,取平均值。以標準品 巴卡亭m的進樣量(X)為橫坐標,峰面積積分值(Y)為縱坐標,繪制標準曲線,并對所測得的 數據進行線性回歸分析。
[0107] 同理繪制10-DAB標準曲線。
[0108] (5)精密度的考察:取巴卡亭m標準品溶液,精密吸取20yL連續進樣5次,分別按上 述色譜條件進行檢測,考察方法的精密度。
[0109] (6)加樣回收率:精密稱量己知含量的樣品,適量加入巴卡亭m對照品,制備供試 品溶液,分別按上述色譜條件及測定方法進行測定,按下列公式計算回收率:
[0110] 巴卡亭ΓΠ 的加樣回收率= 加入的巴卡苧ΙΠ 量
[0111]結果與分析:
[0112] 由圖1可知,野生型DBAT在發生氨基酸替換后對其可溶性表達及表達量有影響。在 相同的濃度IPTG誘導后,所有突變體仍能夠正常表達。其中,D166A和H162AR363H(簡寫為 HARH)的可溶表達量均減少。相反的是,D166H、R363H和D166HR363H(簡寫為DHRH)可溶表達 量都增加。結果表明R363位點替換成His或者Ala都能增加 DBAT的可溶表達,D166位點替換 成Ala可溶表達量減少,替換成His時則增加。
[0113] 分別將這些突變體誘導、表達和純化(圖2),進行酶學性質測定。
[0114] 實施例4DBAI1酶的酶學性質分析 [0115]( - )動力學參數的測定
[0116] 以10-DAB和乙酰輔酶A為底物,在pH 7.4,0.5mol/L磷酸鈉緩沖液中,于30 °C反應 1 h條件下,按照上述酶活力測定方法,測定突變酶在2~1 Ommo 1 /L底物濃度下產物巴卡亭 ΠI的生成量,重復測定3次。采用Lineweaver-Burk雙倒數作圖法計算酶的Km、Vmax和kcat 〇
[0117] (二)突變酶最適反應溫度的測定
[0118] 取適量純化后的突變酶加入到磷酸鈉緩沖液(0.5111〇1/1,?!17.4)中,并在不同的 溫度(l〇°C~60°C,間隔10°C)條件下,分別設置6個反應體系,測定其最適反應溫度,10-DAB 和乙酰輔酶A的濃度均為400ymol/L 10-DAB,參照上述測定其酶活力,重復測定3次。以突變 酶在不同溫度條件下所測得的最高酶活力為100%,其它值與之比較得到的相對值作圖。 [0119](三)突變酶的最適反應pH的測定
[0120]為了測定突變酶的最適pH值,我們在標準狀態下,以1.2M的蔗糖為底物30°C水浴 反應60min后,對蔗糖磷酸化酶水解反應的最適pH進行了摸索。將純化后的突變酶在不同的 pH(4.0~9.0)條件下進行酶促反應測定其最適pH值,所使用的緩沖液為0.5mol/L醋酸鹽緩 沖液4訊4.0~5.0);0.5111〇1/1磷酸鈉緩沖液4!1(6.0~8.0) ;0.5111〇1/11^8-!1(:1緩沖液, pH(8.0~9.0)。并參照上述測定其酶活力,重復測定3次。酶活最高的一組反應緩沖液pH值 為該酶的最適pH值設定酶活為100%,以此為標準制作不同pH值與酶相對活性關系曲線。
[0121] 結果與分析:
[0122] (一)突變酶的酶學性質測定
[0123] 利用上述純化的突變酶,分別以乙酰輔酶A和10-DAB為底物,進行酶學性質測定, 以研究這些理性設計位點是否能如預期效果。
[0124] (1)D166A
[0125] 突變體D166A對pH的影響。看出,該酶最佳反應pH是7,這和野生型DBAT-致。但是, 在酸性范圍內,其活力下降較明顯,這和野生型又有比較大的差別。如在pH=6時,野生型 DBAT的相對酶活約為70%,而D166A不到50% ;在pH=8時,野生型DBAT的相對酶活和D166A 相當。從酶對環境pH的適應角度來看,Asp屬于酸性氨基酸,Ala屬于脂肪族氨基酸,Aspl66 位點突變成Ala,不利于保持酶活性,降低了適應性。我們推測Hisl62發生親核攻擊,需要奪 取10-DAB上醇羥基的氫,而在酸性環境下,這一機制極有可能受到干擾,從而使酶活降低。
[0126] 另外,我們考察了D166A的最適溫度。表明D166位點突變成Ala,并未對溫度適應性 有明顯的影響。
[0127] (2)D166H
[0128] 為進一步驗證D166位點是否為活性殘基H162提供反應的微環境,我們設想,把酸 性氨基酸Asp替換成堿性氨基酸(如His)同樣會影響酶對環境pH的適應性。我們繼續測定了 D166H的最適PILD166H的最適pH為7,這和野生型DBAT和突變體D166A-致。所不同的是,在 pH=6時,D166H的相對酶活還保留在80%以上,這明顯高于野生型DBAT和D166A;而在pH=8 時,0166!1的相對酶活力卻下降到了50%左右,這低于野生型0841'和01664。因此,我們認為, D166位點不僅維持了蛋白的高級構象,而且在Hisl62發生親核攻擊的時候,為其提供了一 定的微環境。
[0129] 另外,我們測試了 D166H的最適反應溫度。可以看出,其最適溫度是30°C,這和野生 型DBAT和D166A-致。但在較低溫度下,還能保持較高的酶活,我們猜測,D166突變成His后, 更利于維持其構象。
[0130] (3)R363H
[0131] pH對突變體R363H酶活的影響。看出,R363H表現出的性質和野生型完全不同,該酶 最佳反應pH是3,這和野生型DBAT相差很遠。在酸性范圍內,R363H的活力較高,而在堿性環 境中,活性完全消失,這和野生型完全不同。
[0132] His的pKa是6.04,屬于弱堿性氨基酸。Arg的pKa是12.48,屬于堿性氨基酸。在堿性 環境下,Arg363位點突變成His后,不利于His的質子化,從而使得酶活性大大降低。這也說 明除了環境pH對酶活性有影響之外,在酶活性中心附近的氨基酸殘基(D166和R363)同樣為 His提供了可供其質子化的微環境,這也在一定程度上決定了酶對環境pH的適應性。
[0133] 另外,我們研究了溫度對R363H酶活性的影響。可知,R363H的最適溫度是30°C,這 和野生型的一致。但在較高溫度(如30~50°C)下,R363H還能保持70%以上的酶活性,而野 生型均下降到50 %以下。這表明R363H擁有更高的溫度適應性。
[0134] (4)H162AR363H
[0135] 根據Hi s催化的酰基轉移原理,我們構建了雙突變位點突變體Η16 2AR36 3H,其中, 替換了原有的活性殘基Η162Α,同時在R363的位置引入新的擬活性殘基His。酶學性質測定, 表明H162AR363H具有活性,即新引入的活性殘基可以正常發揮作用。我們進一步研究了 pH 對其酶活的影響。可知,H162AR363H的最適pH為6,而且在酸性環境下(如pH=4~6時
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