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抗酸表達盒及其篩選方法_3

文檔序號:9882228閱讀:來源:國知局
增出與預期相符的正確條帶,并進 行凝膠分離回收。將得到PCR產物用限制性內切酶Κρη I和Xho I進行雙酶切后,與經同 樣酶雙酶切的質粒pBR322-temp2-rrnBT (此載體為發明人構建的載體,所述質粒的全長序 列可見于SEQ ID N0:18)進行連接,將連接產物轉化到大腸桿菌MG1655感受態細胞,將轉 化細胞涂布于添加有50 μ g/mL氨芐青霉素的LB平板上篩選陽性克隆,提取質粒,對其進行 測序,測序結果表明所克隆的PBR322中間克隆載體序列正確。
[0121] 2. 2. 2 構建 pQevgA/pZevgA/pVevgA/pWevgA/pNevgA/pSevgA/pAAevgA/pJJevgA/ pIIevgA/pOOevgA-rrnBT 的 10 個 pBR322 中間表達載體(pBR322_pQevgA/pZevgA/pVevgA/ pffevgA/pNevgA/pSevgA/pAAevgA/pJJevgA/pIIevgA/pOOevgA-rrnBT)
[0122] 本申請實施例中所使用的10個pBR322中間表達載體的構建過程,如圖2所示:
[0123] 使用實施例1中合成的含人工啟動子序列的10個pUC57質粒為作為模板,利用如 下2套正向引物和反向引物,按照常規方法進行PCR擴增獲得10個含人工啟動子部分序列 的多核苷酸片段:
[0124] 第一套引物:上游引物 5' -CGAGCCAAGCTTAAGCTTCAATTC-3' (5N-U :SEQ ID NO :19, 帶下劃線堿基為限制性內切酶Hind III識別位點),和下游引物5' -TTTAATGAATTCGGTCAG TGCGTC-3'(5N-L :SEQ ID N0 :20,帶下劃線堿基為限制性內切酶EcoR I識別位點),用于擴 增9個含人工啟動子部分序列的多核苷酸片段(pQ/pZ/pV/pW/pN/pS/pAA/pJJ/p00)。
[0125] 第二套引物:上游引物 5' -CGAGCCAAGCTTAAGCTTCAATC-3' (9II-U :SEQ ID NO :21, 帶下劃線堿基為限制性內切酶Hind III識別位點),和下游引物(5N-L:SEQ ID NO :20),用 于擴增1個多核苷酸片段(pll)。
[0126] PCR反應使用全式金(transgen)公司的Fast pfu聚合酶,PCR反應條件為:95°C, 5min ;95°C 20sec,63°C 20sec,72°C 20sec,共 30 個循環;72°C 5min。反應結束后,對 PCR 擴 增產物進行1 %瓊脂糖凝膠電泳檢測,結果PCR擴增出與預期相符的正確條帶,并進行凝膠 分離回收。將得到PCR產物用限制性內切酶Hind III和EcoR I進行雙酶切后,與經同樣 酶雙酶切的中間克隆載體pBR322-tempevgA-rrnBT進行連接,將連接產物轉化到大腸桿菌 MG1655感受態細胞,將轉化細胞涂布于添加有50 μ g/mL氨芐青霉素的LB平板上篩選陽性 克隆,提取質粒,對其進行測序,測序結果表明所克隆的PBR322中間表達載體序列正確。
[0127] 2. 2. 3 構建 pQevgA/pZevgA/pVevgA/pWevgA/pNevgA/pSevgA/pAAevgA/pJJevgA/ pIIevgA/pOOevgA-rrnBT 的 10 個 pACYC184 表達載體(pACYC184_pQevgA/pZevgA/pVevgA/ pffevgA/pNevgA/pSevgA/pAAevgA/pJJevgA/pIIevgA/pOOevgA-rrnBT)
[0128] 本申請實施例中所使用的10個pACYC184表達載體的構建過程,如圖3所示:
[0129] 使用Tiangen公司的高純度質粒小提試劑盒提取實施例2. 2. 2中構建的10個 pBR322 中間表達載體(pBR322_pQevgA/pZevgA/pVevgA/pWevgA/pNevgA/pSevgA/pAAevgA/ pJJevgA/pIIevgA/p00evgA-rrnBT)質粒為作為模板,利用如下4套正向引物和反向引物, 按照常規方法進行PCR擴增獲得10個人工啟動子-evgA-rrnBT (pQevgA/pZevgA/pVevgA/ pWevgA/pNevgA/pSevgA/pAAevgA/pJJevgA/pIIevgA/pOOevgA-rrnBT) (Xba I,Sail)的多核 苷酸片段:
[0130] 第一套引物:上游引物 5 ' -GAGATTTCTAGAAAGCTTCAATTCCGACGTCTAAGA-3 '(pAE -F2,SEQIDN0:22,帶下劃線堿基為限制性內切酶XbaI識別位點),和下游引物(pAE-R, SEQ ID N0:15),用于擴增 7 個多核苷酸片段(pQevgA/pZevgA/pWevgA/pNevgA/pSevgA/ pAAevgA/pJJevgA-rrnBT)〇
[0131] 第二套引物:上游引物 5 ' -GAGATTTCTAGAAAGCTTCAATTCCGACGTCTAAGA-3 '(pAE -F3,SEQIDN0:23,帶下劃線堿基為限制性內切酶XbaI識別位點),和下游引物(pAE-R, SEQ ID NO :15),用于擴增1個多核苷酸片段(pVevgA-rrnBT)。
[0132] 第三套引物:上游引物 5 ' -GAGATTTCTAGAAAGCTTCAATCCGACGTCTGAGA-3 '(pAE_F4, SEQIDN0:24,帶下劃線堿基為限制性內切酶XbaI識別位點),和下游引物(pAE-R,SEQ ID NO :15),用于擴增1個多核苷酸片段(pIIevgA-rrnBT)。
[0133] 第四套引物:上游引物 5 ' -GAGATTTCTAGAAAGCTTCAATTCCGACGTCTAAG-3 '(pAE_F5, SEQIDN0:25,帶下劃線堿基為限制性內切酶XbaI識別位點),和下游引物(pAE-R,SEQ ID NO :15),用于擴增1個多核苷酸片段(pOOevgA-rrnBT)。
[0134] PCR反應使用全式金(transgen)公司的Fast pfu聚合酶,PCR反應條件為:95°C, 5min ;95°C 20sec,62°C 20sec,72°C 30sec,共 30 個循環;72°C 5min。反應結束后,對 PCR 擴 增產物進行1 %瓊脂糖凝膠電泳檢測,結果PCR擴增出與預期相符的正確條帶,并進行凝膠 分離回收。將得到PCR產物用限制性內切酶Xba I和Sal I進行雙酶切后,與經同樣酶雙 酶切的中間克隆載體PACYC184進行連接,將連接產物轉化到大腸桿菌MG1655感受態細胞, 將轉化細胞涂布于添加有34 μ g/mL氯霉素的LB平板上篩選陽性克隆,提取質粒,對其進行 測序,測序結果表明所克隆的人工啟動子-evgA的10個pACYC184表達載體序列正確。
[0135] 2. 3 構建對照質粒 pACYC184-rrnBT
[0136] 本申請實施例中所使用的對照質粒pACYC184-rrnBT的構建過程,如圖4所示:
[0137] 使用Tiangen公司的高純度質粒小提試劑盒提取由實施例2. 2獲得的 pACYC184-pNatevgA-rrnBT質粒,經限制性內切酶Xba I和Xho I雙酶切后,載體骨架 用T4DNA polymerase(NEB)進行平末端化,反應條件為:12°C,30min;加入1.5μ1 0.2M EDTA,75°C,20min。純化后通過T4DNA ligase(NEB)連接后轉化到大腸桿菌MG1655感受態 細胞,將轉化細胞涂布于添加有34 μ g/mL氯霉素的LB平板上篩選陽性克隆,提取質粒,對 其進行測序,測序結果表明所克隆的pACYC184-rrnBT序列正確。
[0138] 本實施例2中構建的evgA抗酸表達盒,包括pNatevgA-rrnBT和pQevgA/pZevgA/ pVevgA/pWevgA/pNevgA/pSevgA/pAAevgA/pJJevgA/pIIevgA/pOOevgA-rrnBT,序列分別如 SEQ ID NO :26-36 所示。
[0139] 實施例3 :構建ybaS-gadB-gadC的三基因抗酸表達盒
[0140] 構建 ybaS-gadB/gadB (H465A)/gadB (dHT)/gadB (H465A&E89Q) / gadB(dHT&E89Q)-gadC470-rrnBT三基因抗酸表達盒的pACYC184表達質 粒 pACYC184-ybaS-rrnBT-gadB/gadB (H465A)/gadB (dHT)/gadB (H465A&E89Q)/ gadB(dHT&E89Q)-gadC470-rrnBT。其中:ybaS 的啟動子為 ybaS 天然啟動子(SEQ ID NO: 70),gadB-gadC470操縱子的啟動子為gadB天然啟動子(SEQ ID NO :72)。
[0141] 3· 1 構建中間克隆質粒 pACYC184_Hind III-pNatevgA-Xho I-rrnBT-BamH I
[0142] 本申請實施例中所使用的中間克隆質粒pACYC184_Hind III-pNatevgA-Xho I-rrnBT-BamH I的構建過程,如圖5所示:
[0143] 使用Tiangen公司的高純度質粒小提試劑盒提取由實施例2. 1. 1獲得的 pBR322-pNatevgA-rrnBT質粒作為模板,利用如下正向引物和反向引物,按照常規方法進行 PCR擴增獲得pNatevgA-rrnBT (Hind III,Xho I)多核苷酸片段:h.游引物 5'_AATGATAAGCT IGACTAAACCGTGGCTTTTGCA-3'(evgA-Fn,SEQ ID NO :37,帶下劃線堿基為限制性內切酶Hind III 識別位點),和下游引物 5' -TAGATTGGATCCTAGATATGACGACAG-3' (evgA-Rn,SEQ ID N0 : 38,帶下劃線堿基為限制性內切酶Xho I識別位點)。PCR反應使用全式金(transgen)公 司的 Fast pfu 聚合酶,PCR 反應條件為:95°C,5min ;95°C 20sec,58°C 20sec,72°C lmin, 共30個循環;72°C 5min。反應結束后,對PCR擴增產物進行1 %瓊脂糖凝膠電泳檢測,結 果PCR擴增出與預期相符的正確條帶,并進行凝膠分離回收。將得到PCR產物用限制性內 切酶Hind III和Xho I進行雙酶切后,與經同樣酶雙酶切的質粒pACYC184進行連接,將連 接產物轉化到大腸桿菌MG1655感受態細胞,將轉化細胞涂布于添加有34 μ g/mL氯霉素的 LB平板上篩選陽性克隆,提取質粒,對其進行測序,測序結果表明所克隆的pACYC184-Hind III-pNatevgA-Xho I-rrnBT-BamH I 序列正確。
[0144] 3. 2擴增ybaS-rrnBT-gadB多核昔酸片段
[0145] 本申請實施例中所使用的ybaS-rrnBT-gadB多核苷酸片段的擴增,如圖8所示:
[0146] PCR擴增ybaS多核苷酸片段:以大腸桿菌MG1655基因組作為模板,利用如下正 向引物和反向引物,按照常規方法進行PCR擴增:上游引物5' -AATGATAAGCTTTCGATTTGCAT CAGGATTAGACATT-3'(yS-Fl-A,SEQ ID N0:39,帶下劃線堿基為限制性內切酶 Hind III 識 別位點),和下游引物 5' -GCCTTCTAGATCAGCCCTTAAACAC-3' (yS_R,SEQ ID N0 :40,帶下劃 線堿基為限制性內切酶Xba I識別位點)。PCR反應使用全式金(transgen)公司的Fast pfu 聚合酶,PCR 反應條件為:95°C,5min ;95°C 20sec,60°C 20sec,72°C lmin,共 30 個循環; 72 °C 5min。反應結束后,對PCR擴增產物進行1 %瓊脂糖凝膠電泳檢測,結果PCR擴增出與 預期相符的正確條帶,并進行凝膠分離回收。
[0147] PCR擴增rrnBT多核苷酸片段:以由實施例2. 1. 1獲得的pBR322-pNatevgA-rrnBT 質粒作為模板,利用如下正向引物和反向引物,按照常規方法進行PCR擴增:上游引物 5' -GTTTAAGGGCTGATCTAGAAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCGTCGAA-3' (rB-F, SEQ ID NO :41, 帶下劃線堿基為限制性內切酶Xba I識別位點),和下游引物5'-TATTGTTTAACGGCAGTCCCGG GTAGATATGACGACAGGAAGAGTTTGTAGAA-3'(rB-R,SEQ ID N0:42,帶下劃線堿基為限制性內切 酶Xmal識別位點)。PCR反應使用全式金(transgen)公司的Fast pfu聚合酶,PCR反應 條件為:95°C,5min ;95°C 20sec,60°C 20sec,72°C 30sec,共 30 個循環;72°C 5min。反應結 束后,對PCR擴增產物進行1 %瓊脂糖凝膠電泳檢測,結果PCR擴增出與預期相符的正確條 帶,并進行凝膠分離回收。
[0148] PCR擴增gadB多核苷酸片段:以大腸桿菌MG1655基因組作為模板,利用如下正向 引物和反向引物,按照常規方法進行PCR擴增:上游引物5'-CCCGGGACTGCCGTTAAACAATATCT TTCTC-3'(gBC-F,SEQ ID N0:43,帶下劃線堿基為限制性內切酶Xma I識別位點),和下游 引物 5'-TGTTAATGGATAAATCCATCAATTTGT-3'(gBC-R,SEQ ID N0:44)。PCR 反應使用全式金 (transgen)公司的 Fast pfu 聚合酶,PCR 反應條件為:95°C,5min;95°C20sec,60°C20sec, 72°C 30sec,共30個循環;72°C 5min。反應結束后,對PCR擴增產物進行1%瓊脂糖凝膠電 泳檢測,結果PCR擴增出與預期相符的正確條帶,并進行凝膠分離回收。
[0149] 重疊 PCR擴增ybaS-rrnBT-gadB多核苷酸片段:以前述獲得的ybaS、rrnBT、gadB 為模板,進行重疊 PCR反應。先在不加入引物的情況下,使用全式金(transgen)公司的Fast pfu 聚合酶,PCR 反應條件為:95°C,5min ;95°C 20sec,65°C 20sec,72°C lmin30sec,共 10 個 循環。然后加入上游引物(yS-Fl-A,SEQ ID NO :39)和下游引物(gBC-R,SEQ ID NO :44), 使用全式金(transgen)公司的Fast pfu聚合酶,PCR反應條件為:95°C,5min ;95°C 20sec, 65°C 20sec,72°C lmin30sec,共25個循環。反應結束后,對PCR擴增產物進行1%瓊脂糖凝 膠電泳檢測,結果PCR擴增出與預期相符的正確條帶,并進行凝膠分離回收。
[0150] 3.3 構建中間克隆質粒 pBR322-gadB/gadB(H465A)/gadB(dHT)/ gadB(H465A&E89Q)/gadB(dHT&E89Q)-gadC47〇-rrnBT
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