一種水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子標記Pi2?1及應用的制作方法

技術特征：

1.一種水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子標記Pi2-1，其特征在于，所述功能分子標記所擴增的DNA片段包含水稻抗稻瘟病基因Pi2基因組序列的第1543-1545位核苷酸，某些水稻感稻瘟病品種在該位點存在ACA 3個堿基缺失，由引物對SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2從水稻基因組中擴增出抗稻瘟病基因Pi2的DNA片段，經電泳檢測DNA片段大小，從而確定水稻抗稻瘟病基因Pi2的完整性，進而確定其稻瘟病抗性。

2.一種水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子標記Pi2-1的引物對，其特征在于，所述引物對的正向引物如SEQ ID NO.1所示，所述引物對的反向引物如SEQ ID NO.2所示。

3.一種鑒定水稻抗稻瘟病基因Pi2的方法，其特征在于，包括以下步驟：

1)通過常規PCR法擴增及測序，獲得水稻抗稻瘟病基因Pi2的1個抗病等位基因與1個感病等位基因序列；

2)將步驟1)所獲得的序列進行比對，得到水稻抗稻瘟病基因Pi2的第1543-1545位點處存在ACA 3個堿基缺失，該差異位于該基因的外顯子；

3)對不同水稻的總DNA進行PCR擴增反應，所得擴增產物進行電泳檢測驗證，獲得與水稻抗稻瘟病基因Pi2呈特異性帶型的核苷酸片段；

4)對步驟3)所獲得的分子標記在不同的水稻品種中進行帶型顯色和基因型分型，從而確定水稻抗稻瘟病基因Pi2的完整性，進而確定其稻瘟病抗性。

4.根據權利要求3所述的鑒定水稻抗稻瘟病基因Pi2的方法，其特征在于，所述步驟3)中的PCR反應體系如下：

5.根據權利要求3所述的鑒定水稻抗稻瘟病基因Pi2的方法，其特征在于，所述電泳檢測中的8％聚丙烯酰胺凝膠的組成如下：

6.根據權利要求3所述的鑒定水稻抗稻瘟病基因Pi2的方法，其特征在于，所述顯色中的聚丙烯酰胺凝膠顯色液100ml的組成如下：

7.權利要求1所述的水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子標記Pi2-1在篩選和鑒定水稻稻瘟病抗性品種中的應用。