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一種提高絲狀真菌纖維素酶產量和木質纖維素降解利用的菌株構建方法及應用_2

文檔序號:9882130閱讀:來源:國知局
號為:
纖維寡糖轉運蛋白⑶T-1 (NCU00801),FGSC 16575 (配型a);
纖維寡糖轉運蛋白⑶T-2 (NCU08114),FGSC 17868 (配型a)和FGSC 17869 (配型A);纖維寡糖轉運類似蛋白NCU05853,FGSC 13770 (配型a)和FGSC 13771 (配型A);β-葡萄糖苷酶單基因突變菌株BGl (NCU00130), FGSC11822 (配型a)和FGSCl 1823(配型A);
β -葡萄糖苷酶單基因突變菌株BG2(NCU04952),FGSC13731(配型a)和FGSC13732 (配型A);
β -葡萄糖苷酶單基因突變菌株BG3(NCU08755),FGSC18387(配型a)和FGSC18388(配型A);
碳分解代謝物阻遏蛋白CRE-1 (NCU08807),FGSC 18633 (配型a);
野生型粗糙脈胞菌WT,FGSC 2489 ;
“NCU……”為粗糙脈孢菌的基因位點編號,“FGSC……”為FGSC的保藏編號。
[0019]實施例在以本發明技術方案為前提下進行實施,給出了詳細的實施方式和具體的操作過程,實施例將有助于理解本發明,但是本發明的保護范圍不限于下述的實施例。
[0020]
實施例1、構建用于生產纖維素酶的多基因突變菌株Δ3β G(Δ ncu00130 Δ ncu04952 Δ ncu08755), CPL2 ( Δ3β GΔcdtl),CPL3 ( Δ3β GΔcdt2), CPL4(Λ 3 β G Λ ncu05853),CPL5 ( Δ3β GAcdtlA cdt2),CPL6 ( Δ3β GAcdtlA ncu05853), CPL7(Λ 3 β G Λ cdt2 Δ ncu05853)和 CPL8 ( Δ3β GAcdtlA cdt2 Δ ncu05853)
構建方法包括以下步驟:
IA2PG ( Ancu00130Ancu08755)的構建 1.1雜交 I)作為父本的β-葡萄糖苷酶單突變體菌株BGl (NCU00130),FGSC11822 (配型a)在MM斜面培養基【50 X Vogel’ s鹽20mL,鹿糖20g,瓊脂15g,組氨酸(50mg/mL) 20mL,定容體積到1L,高壓滅菌。50 X Voger s鹽(1L):檸檬酸三鈉(1/2H20) 150g,無水KH2PO4 250g,無水 NH4NO3 10g, MgSO4*7H20 10g, CaCl2CH2O 5g,微量元素鹽溶液 5mL,生物素(0.lmg/mL)2.5mL,定容體積到1L。】上28°C培養7天后待用。
[0021]2)作為母本的β -葡萄糖苷酶單突變體菌株BG3 (NCU08755), FGSC18388(配型A)在Westergaards平板培養基【4 X Westergaards鹽溶液250mL,鹿糖15g,瓊脂15g,調PH值 6.5,定容到 1L,高壓滅菌,倒平板。4XWestergaards 鹽溶液(1L):KN03 4g, KH2PO4 4g,MgSO4*7H20 2g,微量元素鹽溶液4mL,生物素(0.lmg/mL) 200 μ L,定容體積到1L。】上28°C培養10天,在體式顯微鏡下觀察子囊,若有子囊產生,則進行雜交試驗,若未產生子囊則繼續培養,直至看到大量子囊產生為止。
[0022]3)取ImL無菌水洗在MM斜面培養基上培養的BGl (NCUOO130)菌株孢子,制成孢子懸液,濃度為I X 17,均勻滴到Westergaards平板培養基上,用無菌槍頭均勻涂布,盡量涂成規則形狀,以便觀察是否污染。
[0023]3)雜交后的平板28°C培養大約2周后,在體式顯微鏡下觀察培養皿上蓋上是否有子囊孢子,若發現噴發出的子囊孢子,則取ImL無菌水沖洗培養皿上蓋,收集子囊孢子,4°C或常溫保存。
[0024]4)取收集的子囊孢子3 μ L加入30 μ L無菌水放于60°C水浴熱激半小時,殺死子囊孢子里混合的紅色分生孢子。
[0025]5)采用玻璃珠子法涂BDES (雜交篩選培養基)+hph (潮霉素)平板【配方:BDES平板培養基(IL):50XVogel’ s鹽20mL,瓊脂15g,定容到950mL,高壓滅菌,再加50mL20 XBDES鹽溶液,倒平板(潮霉素hph終濃度200 μ g/mL)】,28°C培養12小時后在顯微鏡下挑單菌落(挑單菌落過程中,挑取發生菌絲交叉的單菌落),轉接到MM+hph斜面培養基【配方:50XVogel’ s鹽20mL,鹿糖20g,瓊脂15g,組氨酸(50mg/mL) 20mL,定容體積到1L,高壓滅菌。50 X Vogel’ s 鹽(IL):檸檬酸三鈉(1/2H20) 150g,無水 KH2PO4 250g,無水 NH4NO3100g,MgSO4*7H20 10g,CaCl2CH2O 5g,微量元素鹽溶液 5mL,生物素(0.lmg/mL) 2.5mL,定容體積到1L。】中28°C培養3天。
[0026]6) 3天后,將挑取的菌轉接到麗斜面培養基上28°C培養3天,然后放于室溫下培養7天,提孢子DNA進行PCR驗證。
[0027]1.2提基因組DNA
采用酚氯仿法從BGl (NCU00130)&BG3 (NCU08755)雜交菌產生的孢子中提取基因組DNA,具體包括以下操作:
1)2.0mL的無菌的DNA提取管中加入200mg的鋯珠,標號準備下一步用.2)加ImL 的裂解液(lysis buffer,配方:0.2M Tris.HCl (pH 7.5),0.5Μ NaCl, 1mMEDTA,I % SDS (w/v))于每個斜面培養基試管中,用ImL槍頭將孢子輕輕刮下,將孢子溶解。
[0028]3)漩渦震蕩10s,取400 μ L孢子懸液預先準備好的DNA提取管中。
[0029]4)將所有DNA提取管置于助磨器上,最大轉速振蕩30s,重復兩次。
[0030]5) 65°C水浴30分,在水浴過程中每個幾分鐘取出漩渦振蕩。
[0031]6)水浴結束后取出,每管加入80 μ L pH 7.5的IM的Tris-HCl中和。
[0032]7)加入400 μ L的酚:氯仿(1:1),13000rpm離心5分鐘。
[0033]8)取300 μ L上清液于新的1.5mL EP管中,加入600 μ L 95%的乙醇(DNA級)。
[0034]9)冰上孵育一小時,隨后4°C、13000rpm離心,可看到白色的DNA沉淀到EP管底部。
[0035]10)用75%的酒精(DNA級)400 μ L清洗,4度13000rpm離心,輕輕取出上清液。
[0036]11)將EP管置于真空濃縮儀中,真空干燥酒精。
[0037]12)加入50 μ L ddH20溶解DNA,用NanoDrop測DNA濃度,測完濃度后將提取的DNA置于-20°C冰箱保存,以備下一步進行PCR驗證。
[0038]1.3 PCR驗證突變體
BGl (NCU00130)&BG3 (NCU08755)雜交菌中提取基因組DNA (方法見1.2),以提取的基因組DNA為模版進行基因BGl (NCUOO130) &BG3 (NCU08755)的PCR驗證。
[0039]I) 25 μ L RCR體系包括:12.5 μ L DreamTaq PCR Master Mix 12.5 μ L, 9.5 μ L 水(nuclease-free),上、下游引物各IyL (上游引物序列hph5f,為了驗證潮霉素hph基因,序列為5’ -TGCAATAGGTCAGGCTCT-3’,下游引物NCU00130r,為了驗證潮霉素hph基因處在NCUOO130 基因位點,序列為 5,-GTAGTGTACAAACCCCAAGC-3’和下游引物 NCU08755r,為了驗證潮霉素hph基因處在NCU08755基因位點,序列為5’- GACAGTGGAGGTGAGAAAGG-3’),基因組 DNA IuL0
[0040]2) PCR擴增條件為:先95°C預變性5分鐘;然后94°C變性30秒,52°C退火45秒,72°C延伸2分鐘,共34個循環;最后72°C退火10分鐘。
[0041]3)對PCR擴增產物進行1%瓊脂糖凝膠電泳(IlOV電壓,30分鐘),在凝膠成像系統下看基因擴增條帶,顯示在上游弓I物hph5f和下游引物NCUOO130r的引導下經PCR擴增獲得了 1780bp目的條帶,該條帶表明NCU00130基因已經被潮霉素hph基因替代;在上游引物hph5f和下游引物NCU08755r的引導下經PCR擴增獲得了 1850bp目的條帶,該條帶表明NCU08755基因已經被潮霉素hph基因替代。通過PCR方法擴增出同源重組的hph基因片段即表明已經成功敲除目的基因,只要兩個條帶同時電泳可見,則表明兩基因(核苷酸序列如序列表中SEQ ID N0.1和N0.5所示)敲除成功,。該結果確證已獲得了 β -葡萄糖苷酶雙基因突變菌株,命名為Δ2β6 ( Ancu00130Ancu08755)(配型a)。
[0042]
2Δ3β6 ( Λ IicuOOl3OAncuO4952 AncuO8755)的構建
2.1 雜交:以實施例1中Λ2β6 (Ancu00130Ancu08755)(配型a)作為母本,以BG2 (NCU04952), FGSC13732 (配型A)作為父本進行雜交,方法見實施例1步驟1.1。
[0043]2.2提基因組DNA:方法見實施例1步驟1.2。
[0044]2.3 PCR驗證篩選突變體
上游引物hph5f,為了驗證潮霉素hph基因,序列為5 ’ -TGCAATAGGTCAGGCTCT-3 ’ ;下游引物NCU00130r,為了驗證潮霉素hph基因處在NCU 00130基因位點,序列為5’ -GTAGTGTACAAACCCCAAGC-3’ ;下游引物 NCU04952r,為了 驗證潮霉素 hph 基因處在 NCU04952基因位點,序列為5’ -AACACACACACACACACTGG-3’ ;下游引物NCU08755r,為了驗證潮霉素hph基因處在NCU 08755基因位點,序列為5’ -GACAGTGGAGGTGAGAAAGG-3’。PCR反應體系及反應條件見實施例1步驟I。結果在上游引物hph5f和下游引物NCU00130r的引導下經PCR擴增獲得了 1780bp目的條帶,該條帶表明NCU00130基因已經被潮霉素hph基因替代;在上游引物hph5f和下游引物NCU04952r的引導下經PCR擴增獲得了 1910bp目的條帶,該條帶表明NCU04952基因已經被潮霉素hph基因替代;在上游引物hph5f和下游引物NCU08755r的引導下經PCR擴增獲得了 1850bp目的條帶,該條帶表明NCU08755基因已經被潮霉素hph基因替代。通過PCR方法擴增出同源重組的hph基因片段即表明已經成功敲除目的基因,所以只要三個條帶同時電泳可見,則表明三基因(核苷酸序列如序列表中SEQ IDN0.1、N0.3、N0.5所示)敲除成功,與預期結果相符,表明獲得了 β -葡萄糖苷酶三基因突變菌株,命名為 Δ3β6 ( Δ ncu00130 Δ ncu04952 Δ ncu08755)(配型 a)。
[0045]
3Δ cdtl Δ cdt2 ( Δ ncu00801 Δ ncu08114)的構建
3.1 雜交:以 Acdtl (NCU00801, FGSC 16575 配型 a)作為母本,以 Λ cdt2(NCU08114),FGSC 17869 (配型A)作為父本進行雜交,方法見實施例1步驟1.1。
[0046]3.2提基因組DNA:方法見實施例1步驟1.2。
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