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針對toso的抗體的制作方法_2

文檔序號:9915964閱讀:來源:國知局
inology 16(3) :435-49中。
[0040] 如本文中所使用,術語"調控元件"是指能夠調芐基因轉錄的核酸序列。調控元件 的非限制性實例包括啟動子、增強子、沉默子、聚腺巧酷化信號、轉錄終止序列。調控元件可 W存在于原生基因的5/或y區或在內含子內。
[0041]本文中還公開了多種蛋白質與其人類蛋白質和編碼序列的GenBank登記號。然而, 蛋白質不局限于具有由所公開的GenBank登記號表示的氨基酸序列的來源于人類的蛋白 質,而是可W具有來源于其他動物,特別是溫血動物(例如大鼠、豚鼠、小鼠、小雞、兔、豬、綿 羊、奶牛、猴子等)的氨基酸序列。
[004引如本文中所使用,術語"Toso"、"FAIM3"或"Fas細胞調亡抑制分子3"是指具有基本 上與任何代表性Toso序列同一的氨基酸序列的蛋白質,包括GenBank登記號NP_001135945 (人類同種型b)、W_001180267(人類同種型c)、NP_005440(人類同種型a)、NP_081252(小 鼠)或NP_001014843(大鼠)的任何和所有版本。GenBank登記號匪_001142473、NM_ 001193338、醒_005449、醒_026976和醒_001014843提供了合適的。0臟編碼1'030。
[0043] 如本文中所使用,術語"Toso的生物活性"或"Toso活性"是指與全長原生Toso蛋白 相關的任何生物活性。在一些實施方案中,Toso的生物活性是指結合IgM抗體。在其他實施 方案中,Toso的生物活性是指抑制CDUb或CD18活性。在其他實施方案中,Toso的生物活性 是指增加粒細胞的活化闊值。活化闊值可W通過來自于骨髓的活化粒細胞的數目來測量。 在其他實施方案中,Toso的生物活性包括樹突狀細胞的活化和其向T細胞呈遞抗原的能力。 在其他實施方案中,Toso的生物活性包括抑制細胞調亡或增強TNF信號傳遞。在一些實施方 案中,Toso 生物活性等于具有由 GenBank 登記號 NP_001135945、NP_001180267、NP_005440、 NP_081252或NP_001014843(包括運些登記號的任何和所有版本)表示的氨基酸序列的蛋白 質的活性。
[0044] 如本文中所使用,術語"治療"是指出于通過減輕、緩解、逆轉或預防疾病或病癥的 至少一種不利影響或癥狀來改善患者的病狀的目的施用藥物組合物。
[0045] 如本文中所使用,術語"預防"是指鑒別對疾病具有增加的敏感性但尚未展現疾病 癥狀的受試者(即,患者)并且根據本公開的原則施用療法。設計預防療法W降低易感染受 試者稍后將變成有癥狀患者或與不存在預防療法時相比疾病將延遲發作或更緩慢進展的 可能性。可W通過任何適當的方法,包括例如通過鑒別所述疾病或其他退化性腦病家族史 將受試者鑒別為具有增加的發展所述疾病的可能性,或具有一個或多個指示疾病或疾病敏 感性的診斷標記物。
[0046] 如本文中所使用,術語"樣品"或"測試樣品"是指含有核酸的任何液體或固體物 質。在合適的實施方案中,測試樣品是獲自生物來源(即,"生物樣品"),諸如培養物中的細 胞或得自于動物,最優選地得自于人類的組織樣品。
[0047] 如本文中所使用,術語"基本上同一"當提及蛋白質或多膚時意指與參考氨基酸序 列具有至少80%、85%、90%、95%或99%序列同一性的蛋白質或多膚。比較長度優選地是 所述多膚或蛋白質的全長,但一般是至少10、15、20、25、30、40、50、60、80或100個或更多個 連續氨基酸。"基本上同一"的核酸是與參考核酸序列具有至少80%、85%、90%、95%、 96%、97%、98%或99%序列同一性的核酸。比較長度優選地是所述核酸的全長,但一般是 至少20個核巧酸、30個核巧酸、40個核巧酸、50個核巧酸、75個核巧酸、100個核巧酸、125個 核巧酸或更多個。
[0048] 如本文中所使用,"氨基酸取代"或"取代"是指在起始多膚序列中的特定位置上將 一個氨基酸用另一個氨基酸置換。舉例來說,取代M23Y是指23位上的甲硫氨酸經酪氨酸置 換的變異多膚。
[0049] 蛋白質或核酸的"生物等同物"是指在氨基酸或核酸序列方面基本上與所述蛋白 質或核酸同一或具有等同的生物活性的蛋白質或核酸。
[0050] 如本文中所使用,術語"有效量"是指W足W向患者提供醫療益處的頻率遞送的化 合物(例如抗體或其生物學活性片段)的量。在一個實施方案中,蛋白質的有效量是足W治 療或改善疾病癥狀的量。
[0051] 細胞"群體"是指在表型和/或基因型方面同一(克隆)或不同一的多于一個細胞的 集合。
[0052] "基本上同源"描述了其中超過約50 %或可選地超過約60 %或可選地超過70 %或 可選地超過75 %或可選地超過80 %或可選地超過85 %或可選地超過90 %或可選地超過 95%的細胞具有相同或相似的表型的細胞群體。表型可W通過預先選定的細胞表面標記物 或其他標記物來確定。
[0053] 術語自體轉移、自體移植、自體移植物等等是指其中細胞供體同樣是細胞置換療 法的受體的治療。術語同種異體轉移、同種異體移植、同種異體移植物等是指其中細胞供體 與細胞置換療法的受體屬于同一物種,但并非同一個體的治療。其中供體細胞與受體存在 組織相容性匹配的細胞轉移有時稱為同基因轉移。術語異種轉移、異種移植、異種移植物等 是指其中細胞供體與細胞置換療法的受體屬于不同的物種的治療。
[0054] 如本文中所使用,"抗體"包括整個抗體和其任何抗原結合片段或單鏈。因此,術語 "抗體"包括含有包含免疫球蛋白分子的至少一部分的分子的任何蛋白質或膚。其實例包括 但不限于重鏈或輕鏈的互補性決定區(CDR)或其配體結合部分、重鏈或輕鏈可變區、重鏈或 輕鏈恒定區、框架(FR)區或其任何部分或結合蛋白的至少一部分。一般來說,術語"抗體"包 括了包括至少一個恒定結構域(包括但不限于CH1、CH2、C冊和化)的任何多膚。用于本發明 的抗體可W呈如本文中所描述的多種形式,包括傳統抗體W及抗體衍生物、片段和模擬物。
[0055] 抗體可W是多克隆的或單克隆的,并且可W從任何合適的生物來源(例如鼠類、大 鼠、綿羊和犬類)中分離。
[0056] 單克隆抗體是由細胞的單克隆或雜交瘤產生的抗體,并且因此是單一純同源型抗 體。
[0057] 雜交瘤是在實驗室中由產生抗體的淋己細胞與不產生抗體的癌細胞(通常是骨髓 瘤或淋己瘤)融合而產生的細胞。雜交瘤增殖并產生特定單克隆抗體的連續供應。
[0058] 如本文中所使用的術語"人類抗體"意在包括具有來源于人類種系免疫球蛋白序 列的可變區和恒定區的抗體。本發明的人類抗體可W包括并非由人類種系免疫球蛋白序列 編碼的氨基酸殘基(例如,通過體外隨機或位點特異性誘變或通過體內體細胞突變而引入 的突變)。然而,如本文中所使用的術語"人類抗體"不打算包括將來源于另一個哺乳動物物 種(諸如小鼠)的種系的CDR序列移植到人類框架序列上的抗體。因此,如本文中所使用,術 語"人類抗體"是指其中基本上蛋白質的每個部分(例如CDR、框架、CL、Cn結構域(例如Cm、 Cm、CH3)、較鏈、(化、VH))在人類中基本上都不具免疫原性,而僅具有微小序列變化或變異 的抗體。類似地,指定靈長類(猴、拂拂、黑猩猩等)、曬齒動物(小鼠、大鼠、兔、豚鼠、倉鼠等 等)和其他哺乳動物的抗體命名為運些物種、亞屬、屬、亞科、科特異性抗體。此外,嵌合抗體 包括上述抗體的任何組合。相對于未經修飾的抗體,運樣的變化或變異任選地且優選地在 人類或其他物種中保留或降低免疫原性。因此,人類抗體不同于嵌合抗體或人源化抗體。需 要指出,人類抗體可w由非人類動物或能夠表達功能重排的人免疫球蛋白(例如,重鏈和/ 或輕鏈)基因的原核細胞或真核細胞產生。此外,當人類抗體是單鏈抗體時,其可W包含原 生人類抗體中未發現的連接膚。舉例來說,Fv可W包含諸如二至約八個甘氨酸或其他氨基 酸殘基的連接膚,其連接重鏈可變區與輕鏈可變區。運種連接膚被認為是人類起源的。
[0059] 如本文中所使用,人類抗體"來源于"特定的種系序列,如果所述抗體是獲自使用 人類免疫球蛋白序列的系統,例如通過對攜帶人免疫球蛋白基因的轉基因小鼠進行免疫或 通過篩選人免疫球蛋白基因文庫的話。"來源于"人類種系免疫球蛋白序列的人類抗體可W 通過比較所述人類抗體的氨基酸序列與人類種系免疫球蛋白的氨基酸序列來鑒定。所選擇 的人類抗體的氨基酸序列典型地與由人類種系免疫球蛋白基因編碼的氨基酸序列具有至 少9 0 %同一性,并且含有當與其他物種的種系免疫球蛋白氨基酸序列(例如,小鼠種系序 列)比較時鑒定所述人類抗體屬于人類的氨基酸殘基。在某些情況下,人類抗體的氨基酸序 列可W與所述種系免疫球蛋白基因所編碼的氨基酸序列具有至少95%、或甚至至少96%、 97%、98%或99%同一性。典型地,來源于特定人類種系序列的人類抗體相對于人類種系免 疫球蛋白基因所編碼的氨基酸序列將呈現不超過10個氨基酸差異。在某些情況下,人類抗 體可W與所述種系免疫球蛋白基因所編碼的氨基酸序列呈現不超過5個、或甚至不超過4、 3、2或1個氨基酸差異。
[0060] 如本文中所使用的術語"重組人類抗體"包括通過重組手段制備、表達、產生或分 離的所有人類抗體,諸如從人免疫球蛋白基因的轉基因或轉染色體動物(例如小鼠)或由其 制得的雜交瘤分離的抗體,從經過轉化W表達所述抗體的宿主細胞(例如從轉染瘤)分離的 抗體,從重組、組合人類抗體文庫分離的抗體,W及通過設及剪接人免疫球蛋白基因序列與 其他DNA序列的任何其他手段制備、表達、產生或分離的抗體。所述重組人類抗體具有來源 于人類種系免疫球蛋白序列的可變區和恒定區。然而,在某些實施方案中,所述重組人類抗 體可W經受體外誘變(或者當使用人類Ig序列的轉基因動物時進行體內體細胞誘變),并且 重組抗體的VH和VL區的氨基酸序列是當來源于人類種系VH和VL序列或與其相關時可能不 會天然存在于體內人類抗體種系譜系內的序列。本文中描述了用于制造運些抗體的方法描 述。
[0061] 如本文中所使用的"同種型"意指由其恒定區的化學特征和抗原特征定義的任何 免疫球蛋白亞類。應理解,治療抗體還可W包含同種型和/或亞類的雜合物。
[0062] 如本文中所使用的術語"多克隆抗體"或"多克隆抗體組合物"是指來源于不同的B 細胞系的抗體制劑。其為針對特定抗原分泌的免疫球蛋白分子的混合物,每個分子識別不 同的表位。
[0063] 如本文中所使用的術語"單克隆抗體"或"單克隆抗體組合物"是指具有單一分子 組成的抗體分子制劑。單克隆抗體組合物對特定表位呈現單一結合特異性和親和力。
[0064] 如本文中所使用,術語"標記"意指直接或間接綴合于待檢測組合物W產生經"標 記"的組合物的可直接或間接檢測的化合物或組合物,例如N末端組氨酸標簽(N-His)、磁活 性同位素(例如ii5Sn、ii7Sn和ii9Sn)、非放射性同位素(諸如1?和i 5N)、多核巧酸或蛋白質(諸 如抗體)。該術語還包括與將會在表達插入的序列后提供諸如綠色巧光蛋白(GFP)等信號的 多核巧酸綴合的序列。標記可W是自身可檢測的(例如放射性同位素標記或巧光標記),或 者,在酶促標記的情況下,可W催化可檢測的底物化合物或組合物的化學變化。標記可能適 用于小規模檢測或更適用于高通量篩選。因此,合適的標記包括但不限于磁活性同位素、非 放射性同位素、放射性同位素、巧光染料、化學發光化合物、染料和蛋白質,包括酶。標記可 W簡單地被檢測或可W被定量。被簡單檢測的反應一般包括僅證實其存在的反應,而被定 量的反應一般包括具有可定量(例如可用數值報告)的值,諸如強度、極化度和/或其他性質 的反應。在發光或巧光測定中,可W使用與實際上設及結合的測定組分相關的發光團或巧 光團直接產生或者使用與另一組分(例如報告分子或指示分子)相關的發光團或巧光團間 接產生可檢測的反應。
[0065] 產生信號的發光標記的實例包括但不限于生物發光和化學發光。可檢測的發光反 應一般包括發光信號的變化或發生。用于發光標記測定組分的合適的方法和發光團在本領 域中是已知的并且描述于例如化ugland,Richard P.(1996)Han化ook of Fluorescent Probes and Research化emicals(第6版)中。發光探針的實例包括但不限于水母發光蛋白 和巧光素酶。
[0066] 合適的巧光標記的實例包括但不限于巧光素、若丹明、四甲基若丹明、曙紅、藻紅、 香豆素、甲基香豆素、巧、孔雀綠、巧、巧光黃、Cascade Blue?和得克薩斯紅。其他合適的光 學染料描述于Haugland,Richard P.(1996)Handbook of Fluorescent Probes and Research Qiemicals(第6版)中。
[0067] 在另一個方面,巧光標記被功能化W促進共價連接于細胞或組織中或表面上所存 在的細胞組分,諸如細胞表面標記物。合適的官能團包括但不限于異硫氯酸醋基、氨基、面 代乙酷基、馬來酷亞胺、班巧酷亞胺基醋和橫酷基面化物,所有運些都可W用于將巧光標記 連接于第二分子。巧光標記的官能團的選擇將取決于與連接子、試劑、標記物或第二標記試 劑連接的位點。
[0068] 如本文中所使用的"ADCC"或"抗體依賴性細胞介導的細胞毒性"意指細胞介導的 反應,其中表達化丫 R的非特異性細胞毒性細胞識別祀細胞上的結合抗體且隨后引起祀細 胞溶解。ADCC跟與Fc 丫 Rllla的結合相關;與Fc 丫 Rllla的結合增加導致ADCC活性增加。
[0069] 如本文中所使用的"ADCP"或抗體依賴性細胞介導的吞隧意指細胞介導的反應,其 中表達Fc 丫 R的非特異性細胞毒性細胞識別祀細胞上的結合抗體且隨后造成祀細胞的吞 隧。
[0070] "修飾"在本文中意指多膚序列中的氨基酸取代、插入和/或缺失,或與蛋白質化學 連接的部分的變化。舉例來說,修飾可W是與蛋白質連接的碳水化合物或PEG結構的變化。 "氨基酸修飾"在本文中意指多膚序列中的氨基酸取代、插入和/或缺失。為清楚起見,除非 另外指出,否則氨基酸修飾始終針對由DNA編碼的氨基酸,例如具有DNA和RNA中的密碼子的 20個氨基酸。
[0071] "氨基酸取代"或"取代"在本文中意指用不同的氨基酸置換親本多膚序列中特定 位置上的氨基酸。具體來說,在一些實施方案中,取代是針對特定位置上非天然存在的氨基 酸,即天然情況下不存在于生物體內或任何生物體中的氨基酸。舉例來說,取代E272Y
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