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香菇C91?3菌株的Latcripin?8基因片段、編碼蛋白、制備方法及用途與流程

文檔序號:12097424閱讀:459來源:國知局
香菇C91?3菌株的Latcripin?8基因片段、編碼蛋白、制備方法及用途與流程

本發明涉及一種從香菇C91-3菌株中提取的Latcripin-8基因片段、編碼蛋白制備方法及用途,所編碼的蛋白具有誘導腫瘤細胞凋亡、調節機體免疫力、調節細胞周期、抗腫瘤及清除自由基及染料廢水脫色等功能。



背景技術:

真菌富含多種生物活性分子,包括核糖體失活蛋白、抗真菌蛋白、凝集素、泛素樣蛋白、多糖和激酶。其中的抗腫瘤成分以不良反應少、療效顯著等優點在腫瘤治療方面具有獨到之處。香菇菌C91-3屬真菌為擔子菌亞門擔子菌綱側耳科,該菌種已于2013年保藏于中國微生物菌種保藏管理委員會普通微生物中心,保藏號為CGMCC No.7354。香菇菌C91-3含有健脾益氣,扶正祛邪,增強機體免疫力,防治癌癥等功效。[Zhao C,Sun H,Tong X,et a1.An Antitumor lectin from edible Mushroom Agrocybe aegerita[J].Biochem J,2003,374:321—327]。香菇菌C91-3發酵液中含有多種蛋白成分,通過動物體內實驗證實有些蛋白成分具有較好的抗腫瘤作用[黃敏,寧安紅,張卓然等.香菇C91-3菌絲發酵液小鼠體內抗腫瘤作用的研究[J].中國微生態學雜志,1996,8(3):38-40]。體外實驗也證實,其發酵液中的一些蛋白組分具有誘導腫瘤細胞凋亡的能力[戴兵,黃敏,寧安紅.香菇C91-3菌絲發酵液蛋白抑制小鼠宮頸癌細胞株U14生長及誘導凋亡的實驗研究.浙江醫學,2004,26(9);656 -658]。雖然目前已有關于從香菇C91-3菌中提取可誘導腫瘤細胞凋亡的基因片段、編碼蛋白及制備方法的相關報道,但是不同的基因片斷的作用效果不盡相同,亟待開發更多的表達蛋白藥效強、靶向性好、具備產業價值的香菇C91-3cDNA的基因片段。



技術實現要素:

本發明是為了解決現有技術所存在的上述技術問題,提供一種從香菇C91-3菌株中提取的Latcripin-8基因片段、編碼蛋白及制備方法,所編碼的蛋白具有誘導腫瘤細胞凋亡、調節機體免疫力、調節細胞周期、抗腫瘤及清除自由基等功能。

本發明的技術解決方案是:一種香菇C91-3菌株的Latcripin-8基因片段,其特征在于核苷酸序列如SEQ ID NO:1 所示。

一種上述香菇C91-3菌株的Latcripin-8基因片段編碼蛋白,其特征在于氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。

一種上述香菇C91-3菌株的Latcripin-8基因片段的制備方法,其特征在于依次按如下步驟進行:

a. 提取香菇C91-3菌株的菌絲體總RNA;

b. 將菌絲體總RNA反轉錄合成cDNA;

c. PCR擴增目標基因:

以所得到的cDNA為模板、以具有BamHⅠ和NotⅠ兩個酶切位點的PCR反應引物進行PCR反應;所述PCR反應引物序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示;

d. 回收純化DNA片段:

將所得到的PCR產物進行1%瓊脂糖凝膠電泳,純化762bpMarker附近的明顯條帶,切膠回收DNA片段。

所述香菇C91-3菌株的Latcripin-8基因片段的制備方法,其特征在于所述a步驟是取培養18天的香菇C91-3菌株的菌絲體,于研缽中加入液氮充分研磨,加入Trizol后室溫靜置30min,樣品融化后繼續研磨至裂解液透明狀,室溫靜置5min后,12000r/min離心5min,將上清轉移至另一離心管中,然后加入1/5體積氯仿,溫和振蕩后,4?C, 12000 r/min離心,15 min;吸取上層水相溶液并轉移至另一離心管中,加入等體積異丙醇,混勻后室溫靜置15 min,再次4?C,12000 r/min離心,10 min,棄上清,然后加入75%乙醇洗滌并干燥,最后用DEPC處理水溶解,得到香菇C91-3菌株的菌絲體總RNA。

所述c步驟的PCR反應體系50 μl: cDNA模板1 μl,上游引物0.5 μl,下游引物0.5 μl,dNTP Mixture 4 μl、5×PrimeSTAR Buffer 10 μl、2.5 U/μl 的PrimeSTAR HS DNA Polymerase0.5 μl、滅菌蒸餾水33.5 μl;反應條件:98℃變性10 s,55℃復性10 s,72℃延伸1 min,30個循環;72℃延伸5 min;4℃冷卻10 min。

一種上述香菇C91-3菌株的Latcripin-8基因片段編碼蛋白在制備抗腫瘤、抗氧化或抗衰老藥物中的應用。

本發明是從香菇C91-3菌絲體轉錄組中,克隆出一段特異性基因片段,命名為Latcripin-8基因片段,該基因片段所編碼的蛋白具有誘導腫瘤細胞凋亡、調節機體免疫力、調節細胞周期、抗腫瘤及清除自由基等功能。可將該基因片段進行基因重組,并于原核表達體系中進行高效表達,將表達產物通過親和層析進行分離和提純,獲得該基因編碼的蛋白質,該蛋白可用于研究細胞凋亡中的機制及其在細胞信號通路中的作用,也可用于制備治療腫瘤、抗氧化或抗衰老藥物,增加藥物種類。

附圖說明

圖1是本發明實施例 PCR產物的1%瓊脂糖凝膠電泳圖。

圖2是本發明實施例所用載體 pET-32a(+)雙酶切后的電泳圖。

圖3是本發明實施例提取的Latcripin-8基因片段轉化后的單克隆陽性菌落。

圖4是本發明實施例重組表達蛋白的SDS-PAGE電泳圖。

圖5是本發明實施例誘導表達蛋白的Western-blot電泳圖。

圖6是本發明實施例純化后的目標蛋白SDS-PAGE電泳圖。

圖7是本發明實施例純化后的目標蛋白對SGC細胞的生長抑制率示意圖。

香菇C91-3菌株保藏日期:2013年3月15日;

分類命名:香菇(Lentinula edodes);

保藏單位:中國微生物菌種保藏管理委員會普通微生物中心(CGMCC);

保藏單位地址:北京市朝陽區北辰西路1號院3號

保藏號:CGMCC No.7354。

具體實施方式

a. 提取香菇C91-3菌株的菌絲體總RNA:

取用培養基培養18天的香菇C91-3菌株的菌絲體,于研缽中加入液氮充分研磨,加入1ml的Trizol后室溫靜置30min,樣品融化后繼續研磨至裂解液透明狀,室溫靜置5min后,12000r/min離心5min,將上清轉移至另一離心管中,然后加入然后加入0.2 ml氯仿,溫和振蕩后,4?C, 12000 r/min離心,15 min;吸取上層水相溶液0.5 ml并轉移至另一干凈的1.5 ml離心管,加入等體積異丙醇,顛倒混勻后室溫靜置15 min,再次4?C,12000 r/min離心,10 min,棄上清,然后加入75%乙醇1 ml洗滌并干燥,最后用DEPC處理水溶解,香菇C91-3菌株的菌絲體總RNA;

紫外分光光度計驗證純度,OD260/280比值在1.8~2.0之間。

進行1%瓊脂糖凝膠電泳驗證,表明RNA提取純度較高。

b. 將菌絲體總RNA反轉錄合成cDNA;

使用TaKaRa 3′-Full RACE Core Set Ver.2.0試劑盒反轉錄合成cDNA,本試劑盒購自寶生物工程(大連)有限公司。

反應體系:香菇菌絲體總RNA (1μg/μl) 1 μl、3’ RACE Adaptor (5 μM) 1 μl、dNTP Mixture (10 mM each) 1 μl、RNase Free dH2O 4.5 μl;

反應條件:70℃,10 min 立即冰上放置2分鐘;

然后加入下列組分:5× M-MLV Buffer 2μl、 RNase Inhibitor (40 U/μl) 0.25 μl、Reverse Transcriptase M-MLV (無RNA酶) (200 U/μl) 0.25 μl,體系總體積達到10 μl。

反應條件: 42℃,60 min 70℃,15 min 得到反轉錄反應液(cDNA)。

c. PCR擴增目標基因:

以所得到的cDNA為模板、以具有BamHⅠ和NotⅠ兩個酶切位點的PCR反應引物進行PCR反應;所述PCR反應引物序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示。

引物委托寶生物(大連)公司合成。

PCR反應體系50 μl: cDNA模板1 μl,上游引物0.5 μl,下游引物0.5 μl,dNTP Mixture(各2.5 mM)4 μl、5×PrimeSTAR Buffer(Mg2+plus) 10 μl、PrimeSTAR HS DNA Polymerase(2.5 U/μl)0.5 μl、滅菌蒸餾水33.5 μl;反應條件:98℃變性10 s,55℃復性10 s,72℃延伸1 min,30個循環;72℃延伸5 min;4℃冷卻10 min。

PCR 產物經1%瓊脂糖凝膠電泳如圖1所示,圖1中M : DL2,000 DNA Marker;1:Latcripin-8目的克隆片段產物,證明成功獲得了該基因片段。

d. 回收純化DNA片段:

將所得到的PCR產物進行1%瓊脂糖凝膠電泳,純化762bpMarker附近的明

顯條帶,切膠回收DNA片段,命名為Latcripin-8基因片段。

實驗:

1. Latcripin-8基因片段序列測定:

測序由大連寶生物公司測定,香菇C91-3 Latcripin-8基因片段核苷酸序列如SEQ ID NO.1。Latcripin-8的基因片段序列長為762bp的cDNA,其含有254個密碼子可讀框(ORF)。經使用NCBI數據庫核苷酸相似性檢索表明,無任何相似性的基因片段序列,證明此基因為一新型基因片段。

2. Latcripin-8基因片段的克隆表達

2.1 載體構建

2.1.1 將質粒pET-32a(+),使用BamHⅠ/NotⅠ進行酶切;

反應體系 (37℃過夜):

pET-32a(+)(100 ng/μl) 10 μl

10×K Buffer 5 μl

EcoRⅠ(10 U/μl) 1 μl

XhoⅠ(10 U/μl) 1 μl

dH2O Up to 50 μl

取5 μl 進行1% 瓊脂糖凝膠電泳,結果如圖2所示,M : λ-Hind Ⅲ digest;1 :pET-32a(+)-plasmid;p;2 :ET-32a(+)- BamHⅠ/NotⅠ,表明質粒切割完全,可進行后續實驗。

2.1.2 載體回收

使用TaKaRa MiniBEST Agarose Gel DNA Extraction Kit Ver.3.0切膠回收約5.9 kbp 的DNA 片段。

2.1.3 將pET-32a(+)載體與本發明實施例的Latcripin-8基因片段進行重組

使用In-Fusion? HD Cloning Kit,分別將本發明實施例的Latcripin-8基因片段與酶切后回收載體連接,反應體系及條件如下:

Latcripin-8基因片段(100 ng/μl) 2 μl

酶切后回收載體(50 ng/μl) 1μl

5xIn-Fusion HD Enzyme Premix 2 μl

dH2O Up to 10 μl

50℃ 15 min

取上述In-Fusion 產物2.5 μl 熱轉化至E.coli Rosetta-gami(DE3)中,涂布于含四種抗生素(羧芐青霉素、四環素、氯霉素、卡那霉素)的LB平板上,37 ℃ 過夜培養。培養結果如圖3所示,表明重組載體成功轉化到宿主菌中,并獲得陽性菌落。

同時,選取平板上生長的單克隆陽性菌落接種于含四種抗生素(羧芐青霉素、四環素、氯霉素、卡那霉素)的LB液體培養基于37 ℃ 培養14小時,采用寶生物公司Plasmid Miniprep Kit V3.l 抽提質粒進行測序鑒定,結果如SEQ ID NO.1。

2.2 Latcripin-8蛋白的誘導表達及鑒定

2.2.1 Latcripin-8蛋白的自誘導表達

挑取2.1.3的單克隆陽性菌落,接種于10 ml 含四種抗生素(羧芐青霉素、四環素、氯霉素、卡那霉素)的LB液體培養基中,于37 ℃ 下,120 r/min 振蕩培養過夜,再接種于100 ml含四種抗生素(羧芐青霉素、四環素、氯霉素、卡那霉素)的自誘導培養基中,于37 ℃ 下,120 r/min 振蕩培養4小時。取菌液進行反復凍融破碎(4次),低溫(4℃)離心5000 r/min,5 min,取上清,加入50 μl PBS。將上清按蛋白樣品處理方法處理后,做12%SDS-PAGE電泳圖如

圖4所示,圖4中M:標準蛋白; 1:Lp-8全菌蛋白,表明重組蛋白在陽性菌株中成功表達。

2.2.2目標蛋白Western-blotting 鑒定分析

將SDS-PAGE電泳分離樣品后,將PAGE膠用濕轉膜的方式轉印到NC膜上,經5%脫脂牛奶室溫封閉液封閉120分鐘后,第一抗Mouse Anti-His Tag Monoclonal Antibody,4℃孵育過夜。再加入第二抗辣根酶標記山羊抗小鼠IgG (H+L)室溫孵育60分鐘,顯色試劑盒顯色如圖5所示,證明誘導表達的重組蛋白確實為目的蛋白。

2.3 Latcripin-8蛋白的純化及活性鑒定

2.3.1. Latcripin-8蛋白的純化

將上述條件誘導的菌體低溫5000 r/min,10 min~20 min離心,每50~100 mg菌體(濕重)加入1~2 ml細菌裂解液。10000×g,4℃離心15~20分鐘,分離上清和沉淀,并收集沉淀(包涵體)。將沉淀重懸于Binding Buffer中,10,000×g離心20分鐘,收集上清。將上清負載上柱,利用HIS標簽的親和層析進行蛋白的純化,使用適量Elution Buffer洗脫,收集洗脫峰。得到單一的目的蛋白,12%SDS-PAGE電泳驗證如圖6所示。圖6中,1: M:標準蛋白; 1:Lp-8純化前;2:純化1 ;3:純化2;4:純化3 。

采用現有方法對純化濃縮的目標蛋白進行測序,其氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。

2.3.2. Latcripin-8蛋白的除鹽和復性

將純化后的Latcripin-8蛋白進行梯度透析,將Latcripin-8蛋白裝入MW16000的透析袋中,兩端用透析袋夾夾緊。將透析袋放入0.5 L~2 L的透析復性液中,冰浴,攪拌透析,24 h~72 h,每6~8 h換液一次復性,逐步降低尿素濃度直至0。將透析袋中的溶液離心10000 rpm,4℃離心,20~30 min上清即為復性的重組蛋白。

2.33. Latcripin-8蛋白的活性鑒定(CCK8法)

將純化濃縮的目的蛋白進行微量BCA蛋白定量后,用CCK8法檢測細胞存活和生長情況。將目的蛋白作用的終濃度分別調整為12.5 μg / mL、25 μg / mL、50 μg / mL、100 μg / mL、200 μg / mL,備用。以PBS作為空白對照,評價其對腫瘤細胞的細胞毒作用,選用人胃癌SGC細胞株進行CCK8實驗。用0.25~1%胰酶消化對數期細胞,終止后離心收集,制成細胞懸液,細胞計數調整其濃度至5×104/ml。每孔加入100 ul,邊緣孔用無菌PBS填充,5% CO2,37 ℃孵育,至細胞單層鋪滿孔底(96孔平底板)加入上述100 μg / mL的藥物每孔200 μL,每個濃度設6個復孔,5% CO2,37 ℃孵育24小時,48小時,并倒置顯微鏡下觀察。48小時后棄去含有藥物的培養基,然后每孔加入CCK8溶液(即10% CCK8)200μL,繼續培養3小時。終止培養,置搖床上低速振蕩5 min。在酶聯免疫檢測儀450nm處測量各孔的吸光值,按照下面公式計算抑瘤率(細胞生長抑制率)=(對照組平均OD值-實驗組平均OD值)/(對照組平均OD值-空白組平均OD值)。目標蛋白的CCK8實驗結果說明本發明基因表達的蛋白對人胃癌SGC細胞株有明顯地抑制作用,在蛋白濃度為12.5 μg / mL、25 μg / mL、50 μg / mL、100 μg / mL時,24 h、48 h的抑瘤率見圖7。

序列表

<110> 大連醫科大學

<120>香菇C91-3菌株的Latcripin-8基因片段、編碼蛋白、制備方法及用途

<160> 4

<210> 1

<211> 762

<212> DNA

<213>香菇C91-3菌株(Lentinula edodes)

<400> 1

1 GACTGGAAAACTCTTGGATCTGGCTCGTTTGGCAAGGTTTACAAGGGCACTTATCTTGGA

61 ATCGACGTCGCCATCAAGGAAGTCTTACCATCTACTGAATACGACGTGGCSAAATACTTT

121 GAGCGTGAATGGCGTCTCATGAAGGAATCTCGCCATCCTAATATCGTCCTCTTTCTTGGT

181 CTCTCTCGTGCTCCCGAGCCAGACAATCGCATTTTCATCGTCTCCGAGTTCATAGACAAC

241 GGCAACCTGCGTCATTACATTCACGACAAGAACAAACCRTTCCCGTGGCGTCTTCGATTG

301 TCTTTTGCCACAGATATTGCCCGTGCGCTTGCATATTTACATGCTCGAAAATGCATACAT

361 CGAGATTTGAAAGGCGAAAACCTGCTTGTCACCGCTAATGGTCGTTTGAAGATTACAGAC

421 TTTGGCTTTGCTCGGATAGCTGCCCGAAGCGAAGACGAATCSAARCGACTCACGTTTTGT

481 GGRACCGATTCGTACATGTCTCCCGAAATCCTCCTTGGAGAGGAGTTTGATCTCCCTACC

541 GACATATTCTCCTTYGGTATCATYCTCTGTGAGATCGCTGCYCGCCGACTTGCGGACGAC

601 CATCATTTCAAGCGAGCYGCACCSACTTTCTCCATMGATGCAGATGAGATCCGCAGTCTC

661 GCTAATCCAGGATGTCCGCCTGACTTGATATCATTGTGCATTGAATGCTGCTCTTCAAAT

721 CCTGCCGCTCGTCCAACGACTCGTCAAATTCTCGAGAAACTT

<210> 2

<211> 254

<212> PRT

<213>香菇C91-3菌株(Lentinula edodes)表達產物

<400> 2

1 GACTGGAAAACTCTTGGATCTGGCTCGTTTGGCAAGGTTTACAAGGGCACTTATCTTGGA

1 D W K T L G S G S F G K V Y K G T Y L G

61 ATCGACGTCGCCATCAAGGAAGTCTTACCATCTACTGAATACGACGTGGCSAAATACTTT

21 I D V A I K E V L P S T E Y D V A K Y F

121 GAGCGTGAATGGCGTCTCATGAAGGAATCTCGCCATCCTAATATCGTCCTCTTTCTTGGT

41 E R E W R L M K E S R H P N I V L F L G

181 CTCTCTCGTGCTCCCGAGCCAGACAATCGCATTTTCATCGTCTCCGAGTTCATAGACAAC

61 L S R A P E P D N R I F I V S E F I D N

241 GGCAACCTGCGTCATTACATTCACGACAAGAACAAACCRTTCCCGTGGCGTCTTCGATTG

81 G N L R H Y I H D K N K P F P W R L R L

301 TCTTTTGCCACAGATATTGCCCGTGCGCTTGCATATTTACATGCTCGAAAATGCATACAT

101 S F A T D I A R A L A Y L H A R K C I H

361 CGAGATTTGAAAGGCGAAAACCTGCTTGTCACCGCTAATGGTCGTTTGAAGATTACAGAC

121 R D L K G E N L L V T A N G R L K I T D

421 TTTGGCTTTGCTCGGATAGCTGCCCGAAGCGAAGACGAATCSAARCGACTCACGTTTTGT

141 F G F A R I A A R S E D E S X R L T F C

481 GGRACCGATTCGTACATGTCTCCCGAAATCCTCCTTGGAGAGGAGTTTGATCTCCCTACC

161 G T D S Y M S P E I L L G E E F D L P T

541 GACATATTCTCCTTYGGTATCATYCTCTGTGAGATCGCTGCYCGCCGACTTGCGGACGAC

181 D I F S F G I I L C E I A A R R L A D D

601 CATCATTTCAAGCGAGCYGCACCSACTTTCTCCATMGATGCAGATGAGATCCGCAGTCTC

201 H H F K R A A P T F S I D A D E I R S L

661 GCTAATCCAGGATGTCCGCCTGACTTGATATCATTGTGCATTGAATGCTGCTCTTCAAAT

221 A N P G C P P D L I S L C I E C C S L N

721 CCTGCCGCTCGTCCAACGACTCGTCAAATTCTCGAGAAACTT

241 P A A R P T T R Q I L E K L

<210> 3

<211> 35

<212> DNA

<213>人工序列

<220>

<223>上游引物

<400>3

GCTGATATCGGATCCGACTGGAAAACTCTTGGAT 35

<210> 4

<211> 24

<212> DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>4

CTTACGAGGACATCAAAGGCGACT 24

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